Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000492312
• Subject: NM_001145108.1
• Aligned Length: 2448
• Identities: 2448
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGAGTCTCGGGTCTTACTGAGAACATTCTGTTTGATCTTCGGTCTCGGAGCAGTTTGGGGGCTTGGTGTGGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGTCTCGGGTCTTACTGAGAACATTCTGTTTGATCTTCGGTCTCGGAGCAGTTTGGGGGCTTGGTGTGGA  74

Query   75  CCCTTCCCTACAGATTGACGTCTTAACAGAGTTAGAACTTGGGGAGTCCACGACCGGAGTGCGTCAGGTCCCGG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCCTTCCCTACAGATTGACGTCTTAACAGAGTTAGAACTTGGGGAGTCCACGACCGGAGTGCGTCAGGTCCCGG  148

Query  149  GGCTGCATAATGGGACGAAAGCCTTTCTCTTTCAAGATACTCCCAGAAGCATAAAAGCATCCACTGCTACAGCT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GGCTGCATAATGGGACGAAAGCCTTTCTCTTTCAAGATACTCCCAGAAGCATAAAAGCATCCACTGCTACAGCT  222

Query  223  GAACAGTTTTTTCAGAAGCTGAGAAATAAACATGAATTTACTATTTTGGTGACCCTAAAACAGACCCACTTAAA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GAACAGTTTTTTCAGAAGCTGAGAAATAAACATGAATTTACTATTTTGGTGACCCTAAAACAGACCCACTTAAA  296

Query  297  TTCAGGAGTTATTCTCTCAATTCACCACTTGGATCACAGGTACCTGGAACTGGAAAGTAGTGGCCATCGGAATG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TTCAGGAGTTATTCTCTCAATTCACCACTTGGATCACAGGTACCTGGAACTGGAAAGTAGTGGCCATCGGAATG  370

Query  371  AAGTCAGACTGCATTACCGCTCAGGCAGTCACCGCCCTCACACAGAAGTGTTTCCTTACATTTTGGCTGATGAC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AAGTCAGACTGCATTACCGCTCAGGCAGTCACCGCCCTCACACAGAAGTGTTTCCTTACATTTTGGCTGATGAC  444

Query  445  AAGTGGCACAAGCTCTCCTTAGCCATCAGTGCTTCCCATTTGATTTTACACATTGACTGCAATAAAATTTATGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AAGTGGCACAAGCTCTCCTTAGCCATCAGTGCTTCCCATTTGATTTTACACATTGACTGCAATAAAATTTATGA  518

Query  519  AAGGGTAGTAGAAAAGCCCTCCACAGACTTGCCTCTAGGCACAACATTTTGGCTAGGACAGAGAAATAATGCGC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AAGGGTAGTAGAAAAGCCCTCCACAGACTTGCCTCTAGGCACAACATTTTGGCTAGGACAGAGAAATAATGCGC  592

Query  593  ATGGATATTTTAAGGGTATAATGCAAGATGTCCAATTACTTGTCATGCCCCAGGGATTTATTGCTCAGTGCCCA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ATGGATATTTTAAGGGTATAATGCAAGATGTCCAATTACTTGTCATGCCCCAGGGATTTATTGCTCAGTGCCCA  666

Query  667  GATCTTAATCGCACCTGTCCAACTTGCAATGACTTCCATGGACTTGTGCAGAAAATCATGGAGCTACAGGATAT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GATCTTAATCGCACCTGTCCAACTTGCAATGACTTCCATGGACTTGTGCAGAAAATCATGGAGCTACAGGATAT  740

Query  741  TTTAGCCAAAACATCAGCCAAGCTGTCTCGAGCTGAACAGCGAATGAATAGATTGGATCAGTGCTATTGTGAAA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TTTAGCCAAAACATCAGCCAAGCTGTCTCGAGCTGAACAGCGAATGAATAGATTGGATCAGTGCTATTGTGAAA  814

Query  815  GGACTTGCACCATGAAGGGAACCACCTACCGAGAATTTGAGTCCTGGATAGACGGCTGTAAGAACTGCACATGC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GGACTTGCACCATGAAGGGAACCACCTACCGAGAATTTGAGTCCTGGATAGACGGCTGTAAGAACTGCACATGC  888

Query  889  CTGAATGGAACCATCCAGTGTGAAACTCTAATCTGCCCAAATCCTGACTGCCCACTTAAGTCGGCTCTTGCGTA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTGAATGGAACCATCCAGTGTGAAACTCTAATCTGCCCAAATCCTGACTGCCCACTTAAGTCGGCTCTTGCGTA  962

Query  963  TGTGGATGGCAAATGCTGTAAGGAATGCAAATCGATATGCCAATTTCAAGGACGAACCTACTTTGAAGGAGAAA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGTGGATGGCAAATGCTGTAAGGAATGCAAATCGATATGCCAATTTCAAGGACGAACCTACTTTGAAGGAGAAA  1036

Query 1037  GAAATACAGTCTATTCCTCTTCTGGAGTATGTGTTCTCTATGAGTGCAAGGACCAGACCATGAAACTTGTTGAG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GAAATACAGTCTATTCCTCTTCTGGAGTATGTGTTCTCTATGAGTGCAAGGACCAGACCATGAAACTTGTTGAG  1110

Query 1111  AGTTCAGGCTGTCCAGCTTTGGATTGTCCAGAGTCTCATCAGATAACCTTGTCTCACAGCTGTTGCAAAGTTTG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AGTTCAGGCTGTCCAGCTTTGGATTGTCCAGAGTCTCATCAGATAACCTTGTCTCACAGCTGTTGCAAAGTTTG  1184

Query 1185  TAAAGGTTATGACTTTTGTTCTGAAAGGCATAACTGCATGGAGAATTCCATCTGCAGAAATCTGAATGACAGGG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TAAAGGTTATGACTTTTGTTCTGAAAGGCATAACTGCATGGAGAATTCCATCTGCAGAAATCTGAATGACAGGG  1258

Query 1259  CTGTTTGTAGCTGTCGAGATGGTTTTAGGGCTCTTCGAGAGGATAATGCCTACTGTGAAGACATCGATGAGTGT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CTGTTTGTAGCTGTCGAGATGGTTTTAGGGCTCTTCGAGAGGATAATGCCTACTGTGAAGACATCGATGAGTGT  1332

Query 1333  GCTGAAGGGCGCCATTACTGTCGTGAAAATACAATGTGTGTCAACACCCCGGGTTCTTTTATGTGCATCTGCAA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GCTGAAGGGCGCCATTACTGTCGTGAAAATACAATGTGTGTCAACACCCCGGGTTCTTTTATGTGCATCTGCAA  1406

Query 1407  AACTGGATACATCAGAATTGATGATTATTCATGTACAGAACATGATGAGTGTATCACAAATCAGCACAACTGTG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  AACTGGATACATCAGAATTGATGATTATTCATGTACAGAACATGATGAGTGTATCACAAATCAGCACAACTGTG  1480

Query 1481  ATGAAAATGCTTTATGCTTCAACACTGTTGGAGGACACAACTGTGTTTGCAAGCCGGGCTATACAGGGAATGGA  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  ATGAAAATGCTTTATGCTTCAACACTGTTGGAGGACACAACTGTGTTTGCAAGCCGGGCTATACAGGGAATGGA  1554

Query 1555  ACGACATGCAAAGCATTTTGCAAAGATGGCTGTAGGAATGGAGGAGCCTGTATTGCCGCTAATGTGTGTGCCTG  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  ACGACATGCAAAGCATTTTGCAAAGATGGCTGTAGGAATGGAGGAGCCTGTATTGCCGCTAATGTGTGTGCCTG  1628

Query 1629  CCCACAAGGCTTCACTGGACCCAGCTGTGAAACGGACATTGATGAATGCTCTGATGGTTTTGTTCAATGTGACA  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CCCACAAGGCTTCACTGGACCCAGCTGTGAAACGGACATTGATGAATGCTCTGATGGTTTTGTTCAATGTGACA  1702

Query 1703  GTCGTGCTAATTGCATTAACCTGCCTGGATGGTACCACTGTGAGTGCAGAGATGGCTACCATGACAATGGGATG  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  GTCGTGCTAATTGCATTAACCTGCCTGGATGGTACCACTGTGAGTGCAGAGATGGCTACCATGACAATGGGATG  1776

Query 1777  TTTTCACCAAGTGGAGAATCGTGTGAAGATATTGATGAGTGTGGGACCGGGAGGCACAGCTGTGCCAATGATAC  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  TTTTCACCAAGTGGAGAATCGTGTGAAGATATTGATGAGTGTGGGACCGGGAGGCACAGCTGTGCCAATGATAC  1850

Query 1851  CATTTGCTTCAATTTGGATGGCGGATATGATTGTCGATGTCCTCATGGAAAGAATTGCACAGGGGACTGCATCC  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  CATTTGCTTCAATTTGGATGGCGGATATGATTGTCGATGTCCTCATGGAAAGAATTGCACAGGGGACTGCATCC  1924

Query 1925  ATGATGGAAAAGTTAAGCACAATGGTCAGATTTGGGTGTTGGAAAATGACAGGTGCTCTGTGTGCTCATGTCAG  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  ATGATGGAAAAGTTAAGCACAATGGTCAGATTTGGGTGTTGGAAAATGACAGGTGCTCTGTGTGCTCATGTCAG  1998

Query 1999  AATGGATTCGTTATGTGTCGACGGATGGTCTGTGACTGTGAGAATCCCACAGTTGATCTTTTTTGCTGCCCTGA  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  AATGGATTCGTTATGTGTCGACGGATGGTCTGTGACTGTGAGAATCCCACAGTTGATCTTTTTTGCTGCCCTGA  2072

Query 2073  ATGTGACCCAAGGCTTAGTAGTCAGTGCCTCCATCAAAATGGGGAAACTTTGTATAACAGTGGTGACACCTGGG  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  ATGTGACCCAAGGCTTAGTAGTCAGTGCCTCCATCAAAATGGGGAAACTTTGTATAACAGTGGTGACACCTGGG  2146

Query 2147  TCCAGAATTGTCAACAGTGCCGCTGCTTGCAAGGGGAAGTTGATTGTTGGCCCCTGCCTTGCCCAGATGTGGAG  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  TCCAGAATTGTCAACAGTGCCGCTGCTTGCAAGGGGAAGTTGATTGTTGGCCCCTGCCTTGCCCAGATGTGGAG  2220

Query 2221  TGTGAATTCAGCATTCTCCCAGAGAATGAGTGCTGCCCGCGCTGTGTCACAGACCCTTGCCAGGCTGACACCAT  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  TGTGAATTCAGCATTCTCCCAGAGAATGAGTGCTGCCCGCGCTGTGTCACAGACCCTTGCCAGGCTGACACCAT  2294

Query 2295  CCGCAATGACATCACCAAGACTTGCCTGGACGAAATGAATGTGGTTCGCTTCACCGGGTCCTCTTGGATCAAAC  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  CCGCAATGACATCACCAAGACTTGCCTGGACGAAATGAATGTGGTTCGCTTCACCGGGTCCTCTTGGATCAAAC  2368

Query 2369  ATGGCACTGAGTGTACTCTCTGCCAGTGCAAGAATGGCCACATCTGTTGCTCAGTGGATCCACAGTGCCTTCAG  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  ATGGCACTGAGTGTACTCTCTGCCAGTGCAAGAATGGCCACATCTGTTGCTCAGTGGATCCACAGTGCCTTCAG  2442

Query 2443  GAACTG  2448
            ||||||
Sbjct 2443  GAACTG  2448