Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000492319
• Subject: NM_001320527.1
• Aligned Length: 1142
• Identities: 860
• Gaps: 271

Alignment

Query    1  ATGGGTTTCAATCGTCCATCCAAGATACAAGAGAACGCATTGCCACTGATGCTTGCTGAGCCCCCACAGAACTT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  AATTGCCCAATCTCAGTCTGGTACTGGTAAAACAGCTGCCTTCGTGCTGGCCATGCTTAGCCAAGTAGAACCTG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  CAAACAAATACCCCCAGTGTCTATGTCTCTCCCCAACGTATGAGCTCGCCCTCCAAACAGGAAAAGTGATTGAA  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  CAAATGGGCA-------AATTTTACCCTGAACTGAAGCTAGCTTATGCTGTTCGAGGCAAT--------AAAT-  280
               |||||||       .||||   ||.|      ||||.|||| |||..||    |.|||        |||| 
Sbjct    1  ---ATGGGCAGGGCTTTGATTT---CCAG------AGCTGGCTT-TGCCTTT----GAAATACCTATGAAAATC  57

Query  281  ----------------TGGAAAGAGGCCAGAAGATCAGTGAGCAGATTGTCATTGGCACCCCTGGGACTGTGCT  338
                            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct   58  ACCTGGGTCTCCACAGTGGAAAGAGGCCAGAAGATCAGTGAGCAGATTGTCATTGGCACCCCTGGGACCGTGCT  131

Query  339  GGACTGGTGCTCCAAGCTCAAGTTCATTGATCCCAAGAAAATCAAGGTGTTTGTTCTGGATGAGGCTGATGTCA  412
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  132  GGACTGGTGCTCCAAGCTCAAGTTCATTGATCCCAAGAAAATCAAGGTGTTTGTTCTGGATGAGGCTGATGTCA  205

Query  413  TGATAGCCACTCAGGGCCACCAAGATCAGAGCATCCGCATCCAGAGGATGCTGCCCAGGAACTGCCAGATGCTG  486
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  206  TGATAGCCACTCAGGGCCACCAAGATCAGAGCATCCGCATCCAGAGGATGCTGCCCAGGAACTGCCAGATGCTG  279

Query  487  CTTTTCTCCGCCACCTTTGAAGACTCTGTGTGGAAGTTTGCCCAGAAAGTGGTCCCAGACCCAAACGTTATCAA  560
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  280  CTTTTCTCCGCCACCTTTGAAGACTCTGTGTGGAAGTTTGCCCAGAAAGTGGTCCCAGACCCAAATGTTATCAA  353

Query  561  ACTGAAGCGTGAGGAAGAGACCCTGGACACCATCAAGCAGTACTATGTCCTGTGCAGCAGCAGAGACGAGAAGT  634
            |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  354  ACTGAAGCGTGAGGAAGAGACCCTGGATACCATCAAGCAGTACTATGTCCTGTGCAGCAGCAGAGACGAGAAGT  427

Query  635  TCCAGGCCTTGTGTAACCTCTACGGGGCCATCACCATTGCTCAAGCCATGATCTTCTGCCATACTCGCAAAACA  708
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  428  TCCAGGCCTTGTGTAACCTCTACGGGGCCATCACCATTGCTCAAGCCATGATCTTCTGCCATACTCGCAAAACA  501

Query  709  GCTAGTTGGCTGGCAGCAGAGCTCTCAAAAGAAGGCCACCAGGTGGCTCTGCTGAGTGGGGAGATGATGGTGGA  782
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  502  GCTAGTTGGCTGGCAGCAGAGCTCTCAAAAGAAGGCCACCAGGTGGCTCTGCTGAGTGGGGAGATGATGGTGGA  575

Query  783  ACAGAGGGCTGCAGTGATTGAGCGCTTCCGAGAGGGCAAAGAGAAGGTTTTGGTGACCACCAACGTGTGTGCCC  856
            .|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  576  GCAGAGGGCTGCGGTGATTGAGCGCTTCCGAGAGGGCAAAGAGAAGGTTTTGGTGACCACCAACGTGTGTGCCC  649

Query  857  GCGGCATTGATGTTGAACAAGTGTCTGTCGTCATCAACTTTGATCTTCCCGTGGACAAGGACGGGAATCCTGAC  930
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  650  GCGGCATTGATGTTGAACAAGTGTCTGTCGTCATCAACTTTGATCTTCCCGTGGACAAGGACGGGAATCCTGAC  723

Query  931  AATGAGACCTACCTGCACCGGATCGGGCGCACGGGCCGCTTTGGCAAGAGGGGCCTGGCAGTGAACATGGTGGA  1004
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  724  AATGAGACCTACCTGCACCGGATCGGGCGCACGGGCCGCTTTGGCAAGAGGGGCCTGGCAGTGAACATGGTGGA  797

Query 1005  CAGCAAGCACAGCATGAACATCCTGAACAGAATCCAGGAGCATTTTAATAAGAAGATAGAAAGATTGGACACAG  1078
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  798  CAGCAAGCACAGCATGAACATCCTGAACAGAATCCAGGAGCATTTTAATAAGAAGATAGAAAGATTGGACACAG  871

Query 1079  ATGATTTGGACGAGATTGAGAAAATAGCCAAC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  872  ATGATTTGGACGAGATTGAGAAAATAGCCAAC  903