Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000492319
• Subject: XM_006530650.3
• Aligned Length: 1164
• Identities: 994
• Gaps: 54

Alignment

Query    1  ------------------------------------------------------ATGGGTTTCAATCGTCCATC  20
                                                                  |||||.||||||||.||.||
Sbjct    1  ATGTCAGGAACATGTCTAATTAGGAAACCTCAGCTTCTCCAAGGAGTCTACGCCATGGGCTTCAATCGACCGTC  74

Query   21  CAAGATACAAGAGAACGCATTGCCACTGATGCTTGCTGAGCCCCCACAGAACTTAATTGCCCAATCTCAGTCTG  94
            ||||||.||.|||||.||..||||..|||||||||||||.||||||||||||.|.|||||.||.||.|||||||
Sbjct   75  CAAGATCCAGGAGAATGCTCTGCCCATGATGCTTGCTGAACCCCCACAGAACCTGATTGCACAGTCCCAGTCTG  148

Query   95  GTACTGGTAAAACAGCTGCCTTCGTGCTGGCCATGCTTAGCCAAGTAGAACCTGCAAACAAATACCCCCAGTGT  168
            |||||||.||||||||||||||.||.||.||.|||||.|||..|||.|||||.|||.|||.|||.||.||||||
Sbjct  149  GTACTGGGAAAACAGCTGCCTTTGTCCTAGCTATGCTCAGCAGAGTGGAACCAGCAGACAGATATCCTCAGTGT  222

Query  169  CTATGTCTCTCCCCAACGTATGAGCTCGCCCTCCAAACAGGAAAAGTGATTGAACAAATGGGCAAATTTTACCC  242
            .|.||.||.||||||||.||||||||.||..|.|||||.||||||||||||||.||.||||||||.|||.||||
Sbjct  223  TTGTGCCTGTCCCCAACATATGAGCTGGCATTACAAACTGGAAAAGTGATTGAGCAGATGGGCAAGTTTCACCC  296

Query  243  TGAACTGAAGCTAGCTTATGCTGTTCGAGGCAATAAATTGGAAAGAGGCCAGAAGATCAGTGAGCAGATTGTCA  316
            .|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||.|.||||||||||||||||
Sbjct  297  AGAATTGAAGCTAGCTTATGCTGTTCGAGGCAATAAATTGGAGAGAGGTCAGAAGGTGAGTGAGCAGATTGTCA  370

Query  317  TTGGCACCCCTGGGACTGTGCTGGACTGGTGCTCCAAGCTCAAGTTCATTGATCCCAAGAAAATCAAGGTGTTT  390
            ||||||||||.|||||.||..|||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct  371  TTGGCACCCCCGGGACCGTCTTGGACTGGTGCTCCAAGCTGAAGTTCATTGACCCCAAGAAGATCAAGGTGTTT  444

Query  391  GTTCTGGATGAGGCTGATGTCATGATAGCCACTCAGGGCCACCAAGATCAGAGCATCCGCATCCAGAGGATGCT  464
            ||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GTTCTGGACGAGGCTGATGTGATGATAGCGACTCAGGGCCACCAAGACCAGAGCATCCGCATCCAGAGGATGCT  518

Query  465  GCCCAGGAACTGCCAGATGCTGCTTTTCTCCGCCACCTTTGAAGACTCTGTGTGGAAGTTTGCCCAGAAAGTGG  538
            ||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  519  GCCCAGAAACTGCCAGATGCTGCTTTTCTCGGCCACCTTTGAAGACTCGGTGTGGAAGTTTGCCCAGAAGGTGG  592

Query  539  TCCCAGACCCAAACGTTATCAAACTGAAGCGTGAGGAAGAGACCCTGGACACCATCAAGCAGTACTATGTCCTG  612
            ||||||||||.|||.|.|||||.||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.
Sbjct  593  TCCCAGACCCCAACATCATCAAGCTAAAGCGTGAGGAGGAGACTCTGGACACCATCAAACAGTACTACGTCCTC  666

Query  613  TGCAGCAGCAGAGACGAGAAGTTCCAGGCCTTGTGTAACCTCTACGGGGCCATCACCATTGCTCAAGCCATGAT  686
            ||||..|.||||||.|||||||||||||||.||||.|||||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||
Sbjct  667  TGCAATAACAGAGAGGAGAAGTTCCAGGCCCTGTGCAACCTGTATGGGGCCATCACCATCGCCCAAGCCATGAT  740

Query  687  CTTCTGCCATACTCGCAAAACAGCTAGTTGGCTGGCAGCAGAGCTCTCAAAAGAAGGCCACCAGGTGGCTCTGC  760
            ||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||
Sbjct  741  CTTCTGCCATACCCGCAAAACAGCTAGCTGGCTGGCAGCAGAGCTCTCAAAAGAGGGCCACCAGGTGGCCCTGC  814

Query  761  TGAGTGGGGAGATGATGGTGGAACAGAGGGCTGCAGTGATTGAGCGCTTCCGAGAGGGCAAAGAGAAGGTTTTG  834
            |||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||.||
Sbjct  815  TGAGTGGAGAGATGATGGTGGAGCAGAGGGCTGCGGTGATCGAGCGCTTCCGAGAAGGCAAAGAGAAGGTTCTG  888

Query  835  GTGACCACCAACGTGTGTGCCCGCGGCATTGATGTTGAACAAGTGTCTGTCGTCATCAACTTTGATCTTCCCGT  908
            |||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||.||
Sbjct  889  GTGACCACCAACGTGTGTGCCCGTGGTATCGATGTTGAACAGGTGTCTGTCGTCATCAATTTTGACCTCCCTGT  962

Query  909  GGACAAGGACGGGAATCCTGACAATGAGACCTACCTGCACCGGATCGGGCGCACGGGCCGCTTTGGCAAGAGGG  982
            |||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  963  GGACAAGGATGGGAACCCAGACAATGAGACCTACCTGCACCGCATTGGGCGCACTGGCCGCTTTGGCAAGAGGG  1036

Query  983  GCCTGGCAGTGAACATGGTGGACAGCAAGCACAGCATGAACATCCTGAACAGAATCCAGGAGCATTTTAATAAG  1056
            |.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GTCTGGCGGTGAACATGGTGGACAGCAAGCACAGCATGAATATCCTCAACAGGATCCAGGAGCATTTTAATAAG  1110

Query 1057  AAGATAGAAAGATTGGACACAGATGATTTGGACGAGATTGAGAAAATAGCCAAC  1110
            ||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1111  AAGATAGAAAGACTGGACACAGATGATTTGGACGAGATTGAGAAAATCGCCAAC  1164