Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000492330
• Subject: NR_047673.1
• Aligned Length: 3127
• Identities: 1907
• Gaps: 1219

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  GGAGTTTGGAGGGGAGAGGGGAAGGTGGCTGGCCGGGTGGCTGAAATCAAAAATTCAATTGCGCACTGGGTTGT  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  GATGAGAAATCTAATCAGATCTTTGGCGAAGGGGCCGGCCGGAAGGATGGAGAGTGGGGGGGAAGTTGCTCCCC  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  AAATTCTTCGAAGGGGAGGCTGGGGAGAGGAATTGACCATGTAAAAGGAGACTTTTTTTTTTGGTGGTGGTGGC  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  TGTTGGGTGCCTTGCAAAAATGAAGGATGCAGGACGCAGCTTTCTCCTGGAACCGAACGCAATGGATAAACTGA  296

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  297  TTGTGCAAGAGAGAAGGAAGAACGAAGCTTTTTCTTGTGAGCCCTGGATCTTAACACAAATGTGTATATGTGCA  370

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  371  CACAGGGAGCATTCAAGAATGAAATAAACCAGAGTTAGACCCGCGGGGGTTGGTGTGTTCTGACATAAATAAAT  444

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  445  AATCTTAAAGCAGCTGTTCCCCTCCCCCCCCCCAAAAAAAAGGATGATTGGAAATGAAGAACCGAGGATTCACA  518

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  519  AAGAAAAAAGTATGTTCATTTTTCTCTATAAAGGAGAAAGTGAGCCAAGGAGATATTTTTGGAATGAAAAGTTT  592

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  593  GGGGCTTTTTTAGTAAAGTAAAGAACTGGTGTGGTGGTGTTTTCTTTTCTTTTTGAATTTCCCACAAGAGGAGA  666

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  667  GGAAATTAATAATACATCTGCAAAGAAATTTCAGAGAAGAAAAGTTGACCGCGGCAGATTGAGGCATTGATTGG  740

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  741  GGGAGAGAAACCAGCAGAGCACAGTTGGATTTGTGCCTATGTTGACTAAAATTGACGGATAATTGCAGTTGGAT  814

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  815  TTTTCTTCATCAACCTCCTTTTTTTTTAATTTTTATTCCTTTTGGTATCAAGATCATGCGTTTTCTCTTGTTCT  888

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  889  TAACCACCTGGATTTCCATCTGGATGTTGCTGTGATCAGTCTGAAATACAATTGGCAAACGCACTGCCTACTTA  962

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  963  CAGCATAGAGACCCCCAGTGGAGAGCTAGACTGTTTGAATTCCAGAAGGACCAACACCAGATAAATTATGAATG  1036

Query    1  ---------ATGACCTTACATCCACAGCAGATAATGATAGGTCCTAGGTTTAACAGGGCCCTATTTGACCCCCT  65
                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TTGAACAAGATGACCTTACATCCACAGCAGATAATGATAGGTCCTAGGTTTAACAGGGCCCTATTTGACCCCCT  1110

Query   66  GCTTGTGGTGCTGCTGGCTCTTCAACTTCTTGTGGTGGCTGGTCTGGTGCGGGCTCAGACCTGCCCTTCTGTGT  139
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GCTTGTGGTGCTGCTGGCTCTTCAACTTCTTGTGGTGGCTGGTCTGGTGCGGGCTCAGACCTGCCCTTCTGTGT  1184

Query  140  GCTCCTGCAGCAACCAGTTCAGCAAGGTGATTTGTGTTCGGAAAAACCTGCGTGAGGTTCCGGATGGCATCTCC  213
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GCTCCTGCAGCAACCAGTTCAGCAAGGTGATTTGTGTTCGGAAAAACCTGCGTGAGGTTCCGGATGGCATCTCC  1258

Query  214  ACCAACACACGGCTGCTGAACCTCCATGAGAACCAAATCCAGATCATCAAAGTGAACAGCTTCAAGCACTTGAG  287
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ACCAACACACGGCTGCTGAACCTCCATGAGAACCAAATCCAGATCATCAAAGTGAACAGCTTCAAGCACTTGAG  1332

Query  288  ACACTTGGAAATCCTACAGTTGAGTAGGAACCATATCAGAACCATTGAAATTGGGGCTTTCAATGGTCTGGCGA  361
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  ACACTTGGAAATCCTACAGTTGAGTAGGAACCATATCAGAACCATTGAAATTGGGGCTTTCAATGGTCTGGCGA  1406

Query  362  ACCTCAACACTCTGGAACTCTTTGACAATCGTCTTACTACCATCCCGAATGGAGCTTTTGTATACTTGTCTAAA  435
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  ACCTCAACACTCTGGAACTCTTTGACAATCGTCTTACTACCATCCCGAATGGAGCTTTTGTATACTTGTCTAAA  1480

Query  436  CTGAAGGAGCTCTGGTTGCGAAACAACCCCATTGAAAGCATCCCTTCTTATGCTTTTAACAGAATTCCTTCTTT  509
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CTGAAGGAGCTCTGGTTGCGAAACAACCCCATTGAAAGCATCCCTTCTTATGCTTTTAACAGAATTCCTTCTTT  1554

Query  510  GCGCCGACTAGACTTAGGGGAATTGAAAAGACTTTCATACATCTCAGAAGGTGCCTTTGAAGGTCTGTCCAACT  583
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GCGCCGACTAGACTTAGGGGAATTGAAAAGACTTTCATACATCTCAGAAGGTGCCTTTGAAGGTCTGTCCAACT  1628

Query  584  TGAGGTATTTGAACCTTGCCATGTGCAACCTTCGGGAAATCCCTAACCTCACACCGCTCATAAAACTAGATGAG  657
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  TGAGGTATTTGAACCTTGCCATGTGCAACCTTCGGGAAATCCCTAACCTCACACCGCTCATAAAACTAGATGAG  1702

Query  658  CTGGATCTTTCTGGGAATCATTTATCTGCCATCAGGCCTGGCTCTTTCCAGGGTTTGATGCACCTTCAAAAACT  731
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CTGGATCTTTCTGGGAATCATTTATCTGCCATCAGGCCTGGCTCTTTCCAGGGTTTGATGCACCTTCAAAAACT  1776

Query  732  GTGGATGATACAGTCCCAGATTCAAGTGATTGAACGGAATGCCTTTGACAACCTTCAGTCACTAGTGGAGATCA  805
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GTGGATGATACAGTCCCAGATTCAAGTGATTGAACGGAATGCCTTTGACAACCTTCAGTCACTAGTGGAGATCA  1850

Query  806  ACCTGGCACACAATAATCTAACATTACTGCCTCATGACCTCTTCACTCCCTTGCATCATCTAGAGCGGATACAT  879
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  ACCTGGCACACAATAATCTAACATTACTGCCTCATGACCTCTTCACTCCCTTGCATCATCTAGAGCGGATACAT  1924

Query  880  TTACATCACAACCCTTGGAACTGTAACTGTGACATACTGTGGCTCAGCTGGTGGATAAAAGACATGGCCCCGTC  953
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1925  TTACATCACAACCCTTGGAACTGTAACTGTGACATACTGTGGCTCAGCTGGTGGATAAAAGACATGGCCCCCTC  1998

Query  954  GAACACAGCTTGTTGTGCCCGGTGTAACACTCCTCCCAATCTAAAGGGGAGGTACATTGGAGAGCTCGACCAGA  1027
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  GAACACAGCTTGTTGTGCCCGGTGTAACACTCCTCCCAATCTAAAGGGGAGGTACATTGGAGAGCTCGACCAGA  2072

Query 1028  ATTACTTCACATGCTATGCTCCGGTGATTGTGGAGCCCCCTGCAGACCTCAATGTCACTGAAGGCATGGCAGCT  1101
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  ATTACTTCACATGCTATGCTCCGGTGATTGTGGAGCCCCCTGCAGACCTCAATGTCACTGAAGGCATGGCAGCT  2146

Query 1102  GAGCTGAAATGTCGGGCCTCCACATCCCTGACATCTGTATCTTGGATTACTCCAAATGGAACAGTCATGACACA  1175
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  GAGCTGAAATGTCGGGCCTCCACATCCCTGACATCTGTATCTTGGATTACTCCAAATGGAACAGTCATGACACA  2220

Query 1176  TGGGGCGTACAAAGTGCGGATAGCTGTGCTCAGTGATGGTACGTTAAATTTCACAAATGTAACTGTGCAAGATA  1249
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  TGGGGCGTACAAAGTGCGGATAGCTGTGCTCAGTGATGGTACGTTAAATTTCACAAATGTAACTGTGCAAGATA  2294

Query 1250  CAGGCATGTACACATGTATGGTGAGTAATTCCGTTGGGAATACTACTGCTTCAGCCACCCTGAATGTTACTGCA  1323
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  CAGGCATGTACACATGTATGGTGAGTAATTCCGTTGGGAATACTACTGCTTCAGCCACCCTGAATGTTACTGCA  2368

Query 1324  GCAACCACTACTCCTTTCTCTTACTTTTCAACCGTCACAGTAGAGACTATGGAACCGTCTCAGGATGAGGCACG  1397
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  GCAACCACTACTCCTTTCTCTTACTTTTCAACCGTCACAGTAGAGACTATGGAACCGTCTCAGGATGAGGCACG  2442

Query 1398  GACCACAGATAACAATGTGGGTCCCACTCCAGTGGTCGACTGGGAGACCACCAATGTGACCACCTCTCTCACAC  1471
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  GACCACAGATAACAATGTGGGTCCCACTCCAGTGGTCGACTGGGAGACCACCAATGTGACCACCTCTCTCACAC  2516

Query 1472  CACAGAGCACAAGGTCGACAGAGAAAACCTTCACCATCCCAGTGACTGATATAAACAGTGGGATCCCAGGAATT  1545
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  CACAGAGCACAAGGTCGACAGAGAAAACCTTCACCATCCCAGTGACTGATATAAACAGTGGGATCCCAGGAATT  2590

Query 1546  GATGAGGTCATGAAGACTACCAAAATCATCATTGGGTGTTTTGTGGCCATCACACTCATGGCTGCAGTGATGCT  1619
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591  GATGAGGTCATGAAGACTACCAAAATCATCATTGGGTGTTTTGTGGCCATCACACTCATGGCTGCAGTGATGCT  2664

Query 1620  GGTCATTTTCTACAAGATGAGGAAGCAGCACCATCGGCAAAACCATCACGCCCCAACAAGGACTGTTGAAATTA  1693
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665  GGTCATTTTCTACAAGATGAGGAAGCAGCACCATCGGCAAAACCATCACGCCCCAACAAGGACTGTTGAAATTA  2738

Query 1694  TTAATGTGGATGATGAGATTACGGGAGACACACCCATGGAAAGCCACCTGCCCATGCCTGCTATCGAGCATGAG  1767
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739  TTAATGTGGATGATGAGATTACGGGAGACACACCCATGGAAAGCCACCTGCCCATGCCTGCTATCGAGCATGAG  2812

Query 1768  CACCTAAATCACTATAACTCATACAAATCTCCCTTCAACCACACAACAACAGTTAACACAATAAATTCAATACA  1841
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813  CACCTAAATCACTATAACTCATACAAATCTCCCTTCAACCACACAACAACAGTTAACACAATAAATTCAATACA  2886

Query 1842  CAGTTCAGTGCATGAACCGTTATTGATCCGAATGAACTCTAAAGACAATGTACAAGAGACTCAAATC-------  1908
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
Sbjct 2887  CAGTTCAGTGCATGAACCGTTATTGATCCGAATGAACTCTAAAGACAATGTACAAGAGACTCAAATCTAAAACA  2960

Query 1909  --------------------------------------------------------------------------  1908
                                                                                      
Sbjct 2961  TTTACAGAGTTACAAAAAACAAACAATCAAAAAAAAAGACAGTTTATTAAAAATGACACAAATGACTGGGCTAA  3034

Query 1909  --------------------------------------------------------------------------  1908
                                                                                      
Sbjct 3035  ATCTACTGTTTCAAAAAAGTGTCTTTACAAAAAAACAAAAAAGAAAAGAAATTTATTTATTAAAAATTCTATTG  3108

Query 1909  -------------------  1908
                               
Sbjct 3109  TGATCTAAAGCAGACAAAA  3127