Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000492330
- Subject:
- XM_011520244.3
- Aligned Length:
- 1920
- Identities:
- 1907
- Gaps:
- 12
Alignment
Query 1 ------------ATGACCTTACATCCACAGCAGATAATGATAGGTCCTAGGTTTAACAGGGCCCTATTTGACCC 62
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTTGAACAAGATGACCTTACATCCACAGCAGATAATGATAGGTCCTAGGTTTAACAGGGCCCTATTTGACCC 74
Query 63 CCTGCTTGTGGTGCTGCTGGCTCTTCAACTTCTTGTGGTGGCTGGTCTGGTGCGGGCTCAGACCTGCCCTTCTG 136
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CCTGCTTGTGGTGCTGCTGGCTCTTCAACTTCTTGTGGTGGCTGGTCTGGTGCGGGCTCAGACCTGCCCTTCTG 148
Query 137 TGTGCTCCTGCAGCAACCAGTTCAGCAAGGTGATTTGTGTTCGGAAAAACCTGCGTGAGGTTCCGGATGGCATC 210
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TGTGCTCCTGCAGCAACCAGTTCAGCAAGGTGATTTGTGTTCGGAAAAACCTGCGTGAGGTTCCGGATGGCATC 222
Query 211 TCCACCAACACACGGCTGCTGAACCTCCATGAGAACCAAATCCAGATCATCAAAGTGAACAGCTTCAAGCACTT 284
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TCCACCAACACACGGCTGCTGAACCTCCATGAGAACCAAATCCAGATCATCAAAGTGAACAGCTTCAAGCACTT 296
Query 285 GAGACACTTGGAAATCCTACAGTTGAGTAGGAACCATATCAGAACCATTGAAATTGGGGCTTTCAATGGTCTGG 358
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GAGACACTTGGAAATCCTACAGTTGAGTAGGAACCATATCAGAACCATTGAAATTGGGGCTTTCAATGGTCTGG 370
Query 359 CGAACCTCAACACTCTGGAACTCTTTGACAATCGTCTTACTACCATCCCGAATGGAGCTTTTGTATACTTGTCT 432
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CGAACCTCAACACTCTGGAACTCTTTGACAATCGTCTTACTACCATCCCGAATGGAGCTTTTGTATACTTGTCT 444
Query 433 AAACTGAAGGAGCTCTGGTTGCGAAACAACCCCATTGAAAGCATCCCTTCTTATGCTTTTAACAGAATTCCTTC 506
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 AAACTGAAGGAGCTCTGGTTGCGAAACAACCCCATTGAAAGCATCCCTTCTTATGCTTTTAACAGAATTCCTTC 518
Query 507 TTTGCGCCGACTAGACTTAGGGGAATTGAAAAGACTTTCATACATCTCAGAAGGTGCCTTTGAAGGTCTGTCCA 580
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TTTGCGCCGACTAGACTTAGGGGAATTGAAAAGACTTTCATACATCTCAGAAGGTGCCTTTGAAGGTCTGTCCA 592
Query 581 ACTTGAGGTATTTGAACCTTGCCATGTGCAACCTTCGGGAAATCCCTAACCTCACACCGCTCATAAAACTAGAT 654
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 ACTTGAGGTATTTGAACCTTGCCATGTGCAACCTTCGGGAAATCCCTAACCTCACACCGCTCATAAAACTAGAT 666
Query 655 GAGCTGGATCTTTCTGGGAATCATTTATCTGCCATCAGGCCTGGCTCTTTCCAGGGTTTGATGCACCTTCAAAA 728
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GAGCTGGATCTTTCTGGGAATCATTTATCTGCCATCAGGCCTGGCTCTTTCCAGGGTTTGATGCACCTTCAAAA 740
Query 729 ACTGTGGATGATACAGTCCCAGATTCAAGTGATTGAACGGAATGCCTTTGACAACCTTCAGTCACTAGTGGAGA 802
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 ACTGTGGATGATACAGTCCCAGATTCAAGTGATTGAACGGAATGCCTTTGACAACCTTCAGTCACTAGTGGAGA 814
Query 803 TCAACCTGGCACACAATAATCTAACATTACTGCCTCATGACCTCTTCACTCCCTTGCATCATCTAGAGCGGATA 876
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TCAACCTGGCACACAATAATCTAACATTACTGCCTCATGACCTCTTCACTCCCTTGCATCATCTAGAGCGGATA 888
Query 877 CATTTACATCACAACCCTTGGAACTGTAACTGTGACATACTGTGGCTCAGCTGGTGGATAAAAGACATGGCCCC 950
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CATTTACATCACAACCCTTGGAACTGTAACTGTGACATACTGTGGCTCAGCTGGTGGATAAAAGACATGGCCCC 962
Query 951 GTCGAACACAGCTTGTTGTGCCCGGTGTAACACTCCTCCCAATCTAAAGGGGAGGTACATTGGAGAGCTCGACC 1024
.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CTCGAACACAGCTTGTTGTGCCCGGTGTAACACTCCTCCCAATCTAAAGGGGAGGTACATTGGAGAGCTCGACC 1036
Query 1025 AGAATTACTTCACATGCTATGCTCCGGTGATTGTGGAGCCCCCTGCAGACCTCAATGTCACTGAAGGCATGGCA 1098
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 AGAATTACTTCACATGCTATGCTCCGGTGATTGTGGAGCCCCCTGCAGACCTCAATGTCACTGAAGGCATGGCA 1110
Query 1099 GCTGAGCTGAAATGTCGGGCCTCCACATCCCTGACATCTGTATCTTGGATTACTCCAAATGGAACAGTCATGAC 1172
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GCTGAGCTGAAATGTCGGGCCTCCACATCCCTGACATCTGTATCTTGGATTACTCCAAATGGAACAGTCATGAC 1184
Query 1173 ACATGGGGCGTACAAAGTGCGGATAGCTGTGCTCAGTGATGGTACGTTAAATTTCACAAATGTAACTGTGCAAG 1246
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 ACATGGGGCGTACAAAGTGCGGATAGCTGTGCTCAGTGATGGTACGTTAAATTTCACAAATGTAACTGTGCAAG 1258
Query 1247 ATACAGGCATGTACACATGTATGGTGAGTAATTCCGTTGGGAATACTACTGCTTCAGCCACCCTGAATGTTACT 1320
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 ATACAGGCATGTACACATGTATGGTGAGTAATTCCGTTGGGAATACTACTGCTTCAGCCACCCTGAATGTTACT 1332
Query 1321 GCAGCAACCACTACTCCTTTCTCTTACTTTTCAACCGTCACAGTAGAGACTATGGAACCGTCTCAGGATGAGGC 1394
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GCAGCAACCACTACTCCTTTCTCTTACTTTTCAACCGTCACAGTAGAGACTATGGAACCGTCTCAGGATGAGGC 1406
Query 1395 ACGGACCACAGATAACAATGTGGGTCCCACTCCAGTGGTCGACTGGGAGACCACCAATGTGACCACCTCTCTCA 1468
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 ACGGACCACAGATAACAATGTGGGTCCCACTCCAGTGGTCGACTGGGAGACCACCAATGTGACCACCTCTCTCA 1480
Query 1469 CACCACAGAGCACAAGGTCGACAGAGAAAACCTTCACCATCCCAGTGACTGATATAAACAGTGGGATCCCAGGA 1542
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 CACCACAGAGCACAAGGTCGACAGAGAAAACCTTCACCATCCCAGTGACTGATATAAACAGTGGGATCCCAGGA 1554
Query 1543 ATTGATGAGGTCATGAAGACTACCAAAATCATCATTGGGTGTTTTGTGGCCATCACACTCATGGCTGCAGTGAT 1616
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 ATTGATGAGGTCATGAAGACTACCAAAATCATCATTGGGTGTTTTGTGGCCATCACACTCATGGCTGCAGTGAT 1628
Query 1617 GCTGGTCATTTTCTACAAGATGAGGAAGCAGCACCATCGGCAAAACCATCACGCCCCAACAAGGACTGTTGAAA 1690
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 GCTGGTCATTTTCTACAAGATGAGGAAGCAGCACCATCGGCAAAACCATCACGCCCCAACAAGGACTGTTGAAA 1702
Query 1691 TTATTAATGTGGATGATGAGATTACGGGAGACACACCCATGGAAAGCCACCTGCCCATGCCTGCTATCGAGCAT 1764
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 TTATTAATGTGGATGATGAGATTACGGGAGACACACCCATGGAAAGCCACCTGCCCATGCCTGCTATCGAGCAT 1776
Query 1765 GAGCACCTAAATCACTATAACTCATACAAATCTCCCTTCAACCACACAACAACAGTTAACACAATAAATTCAAT 1838
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 GAGCACCTAAATCACTATAACTCATACAAATCTCCCTTCAACCACACAACAACAGTTAACACAATAAATTCAAT 1850
Query 1839 ACACAGTTCAGTGCATGAACCGTTATTGATCCGAATGAACTCTAAAGACAATGTACAAGAGACTCAAATC 1908
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 ACACAGTTCAGTGCATGAACCGTTATTGATCCGAATGAACTCTAAAGACAATGTACAAGAGACTCAAATC 1920