Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000492330
• Subject: XM_017018073.2
• Aligned Length: 1920
• Identities: 1907
• Gaps: 12

Alignment

Query    1  ------------ATGACCTTACATCCACAGCAGATAATGATAGGTCCTAGGTTTAACAGGGCCCTATTTGACCC  62
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTTGAACAAGATGACCTTACATCCACAGCAGATAATGATAGGTCCTAGGTTTAACAGGGCCCTATTTGACCC  74

Query   63  CCTGCTTGTGGTGCTGCTGGCTCTTCAACTTCTTGTGGTGGCTGGTCTGGTGCGGGCTCAGACCTGCCCTTCTG  136
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCTGCTTGTGGTGCTGCTGGCTCTTCAACTTCTTGTGGTGGCTGGTCTGGTGCGGGCTCAGACCTGCCCTTCTG  148

Query  137  TGTGCTCCTGCAGCAACCAGTTCAGCAAGGTGATTTGTGTTCGGAAAAACCTGCGTGAGGTTCCGGATGGCATC  210
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGTGCTCCTGCAGCAACCAGTTCAGCAAGGTGATTTGTGTTCGGAAAAACCTGCGTGAGGTTCCGGATGGCATC  222

Query  211  TCCACCAACACACGGCTGCTGAACCTCCATGAGAACCAAATCCAGATCATCAAAGTGAACAGCTTCAAGCACTT  284
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TCCACCAACACACGGCTGCTGAACCTCCATGAGAACCAAATCCAGATCATCAAAGTGAACAGCTTCAAGCACTT  296

Query  285  GAGACACTTGGAAATCCTACAGTTGAGTAGGAACCATATCAGAACCATTGAAATTGGGGCTTTCAATGGTCTGG  358
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GAGACACTTGGAAATCCTACAGTTGAGTAGGAACCATATCAGAACCATTGAAATTGGGGCTTTCAATGGTCTGG  370

Query  359  CGAACCTCAACACTCTGGAACTCTTTGACAATCGTCTTACTACCATCCCGAATGGAGCTTTTGTATACTTGTCT  432
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CGAACCTCAACACTCTGGAACTCTTTGACAATCGTCTTACTACCATCCCGAATGGAGCTTTTGTATACTTGTCT  444

Query  433  AAACTGAAGGAGCTCTGGTTGCGAAACAACCCCATTGAAAGCATCCCTTCTTATGCTTTTAACAGAATTCCTTC  506
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AAACTGAAGGAGCTCTGGTTGCGAAACAACCCCATTGAAAGCATCCCTTCTTATGCTTTTAACAGAATTCCTTC  518

Query  507  TTTGCGCCGACTAGACTTAGGGGAATTGAAAAGACTTTCATACATCTCAGAAGGTGCCTTTGAAGGTCTGTCCA  580
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TTTGCGCCGACTAGACTTAGGGGAATTGAAAAGACTTTCATACATCTCAGAAGGTGCCTTTGAAGGTCTGTCCA  592

Query  581  ACTTGAGGTATTTGAACCTTGCCATGTGCAACCTTCGGGAAATCCCTAACCTCACACCGCTCATAAAACTAGAT  654
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACTTGAGGTATTTGAACCTTGCCATGTGCAACCTTCGGGAAATCCCTAACCTCACACCGCTCATAAAACTAGAT  666

Query  655  GAGCTGGATCTTTCTGGGAATCATTTATCTGCCATCAGGCCTGGCTCTTTCCAGGGTTTGATGCACCTTCAAAA  728
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GAGCTGGATCTTTCTGGGAATCATTTATCTGCCATCAGGCCTGGCTCTTTCCAGGGTTTGATGCACCTTCAAAA  740

Query  729  ACTGTGGATGATACAGTCCCAGATTCAAGTGATTGAACGGAATGCCTTTGACAACCTTCAGTCACTAGTGGAGA  802
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  ACTGTGGATGATACAGTCCCAGATTCAAGTGATTGAACGGAATGCCTTTGACAACCTTCAGTCACTAGTGGAGA  814

Query  803  TCAACCTGGCACACAATAATCTAACATTACTGCCTCATGACCTCTTCACTCCCTTGCATCATCTAGAGCGGATA  876
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TCAACCTGGCACACAATAATCTAACATTACTGCCTCATGACCTCTTCACTCCCTTGCATCATCTAGAGCGGATA  888

Query  877  CATTTACATCACAACCCTTGGAACTGTAACTGTGACATACTGTGGCTCAGCTGGTGGATAAAAGACATGGCCCC  950
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CATTTACATCACAACCCTTGGAACTGTAACTGTGACATACTGTGGCTCAGCTGGTGGATAAAAGACATGGCCCC  962

Query  951  GTCGAACACAGCTTGTTGTGCCCGGTGTAACACTCCTCCCAATCTAAAGGGGAGGTACATTGGAGAGCTCGACC  1024
            .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CTCGAACACAGCTTGTTGTGCCCGGTGTAACACTCCTCCCAATCTAAAGGGGAGGTACATTGGAGAGCTCGACC  1036

Query 1025  AGAATTACTTCACATGCTATGCTCCGGTGATTGTGGAGCCCCCTGCAGACCTCAATGTCACTGAAGGCATGGCA  1098
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGAATTACTTCACATGCTATGCTCCGGTGATTGTGGAGCCCCCTGCAGACCTCAATGTCACTGAAGGCATGGCA  1110

Query 1099  GCTGAGCTGAAATGTCGGGCCTCCACATCCCTGACATCTGTATCTTGGATTACTCCAAATGGAACAGTCATGAC  1172
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GCTGAGCTGAAATGTCGGGCCTCCACATCCCTGACATCTGTATCTTGGATTACTCCAAATGGAACAGTCATGAC  1184

Query 1173  ACATGGGGCGTACAAAGTGCGGATAGCTGTGCTCAGTGATGGTACGTTAAATTTCACAAATGTAACTGTGCAAG  1246
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  ACATGGGGCGTACAAAGTGCGGATAGCTGTGCTCAGTGATGGTACGTTAAATTTCACAAATGTAACTGTGCAAG  1258

Query 1247  ATACAGGCATGTACACATGTATGGTGAGTAATTCCGTTGGGAATACTACTGCTTCAGCCACCCTGAATGTTACT  1320
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ATACAGGCATGTACACATGTATGGTGAGTAATTCCGTTGGGAATACTACTGCTTCAGCCACCCTGAATGTTACT  1332

Query 1321  GCAGCAACCACTACTCCTTTCTCTTACTTTTCAACCGTCACAGTAGAGACTATGGAACCGTCTCAGGATGAGGC  1394
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GCAGCAACCACTACTCCTTTCTCTTACTTTTCAACCGTCACAGTAGAGACTATGGAACCGTCTCAGGATGAGGC  1406

Query 1395  ACGGACCACAGATAACAATGTGGGTCCCACTCCAGTGGTCGACTGGGAGACCACCAATGTGACCACCTCTCTCA  1468
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  ACGGACCACAGATAACAATGTGGGTCCCACTCCAGTGGTCGACTGGGAGACCACCAATGTGACCACCTCTCTCA  1480

Query 1469  CACCACAGAGCACAAGGTCGACAGAGAAAACCTTCACCATCCCAGTGACTGATATAAACAGTGGGATCCCAGGA  1542
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CACCACAGAGCACAAGGTCGACAGAGAAAACCTTCACCATCCCAGTGACTGATATAAACAGTGGGATCCCAGGA  1554

Query 1543  ATTGATGAGGTCATGAAGACTACCAAAATCATCATTGGGTGTTTTGTGGCCATCACACTCATGGCTGCAGTGAT  1616
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  ATTGATGAGGTCATGAAGACTACCAAAATCATCATTGGGTGTTTTGTGGCCATCACACTCATGGCTGCAGTGAT  1628

Query 1617  GCTGGTCATTTTCTACAAGATGAGGAAGCAGCACCATCGGCAAAACCATCACGCCCCAACAAGGACTGTTGAAA  1690
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GCTGGTCATTTTCTACAAGATGAGGAAGCAGCACCATCGGCAAAACCATCACGCCCCAACAAGGACTGTTGAAA  1702

Query 1691  TTATTAATGTGGATGATGAGATTACGGGAGACACACCCATGGAAAGCCACCTGCCCATGCCTGCTATCGAGCAT  1764
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  TTATTAATGTGGATGATGAGATTACGGGAGACACACCCATGGAAAGCCACCTGCCCATGCCTGCTATCGAGCAT  1776

Query 1765  GAGCACCTAAATCACTATAACTCATACAAATCTCCCTTCAACCACACAACAACAGTTAACACAATAAATTCAAT  1838
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GAGCACCTAAATCACTATAACTCATACAAATCTCCCTTCAACCACACAACAACAGTTAACACAATAAATTCAAT  1850

Query 1839  ACACAGTTCAGTGCATGAACCGTTATTGATCCGAATGAACTCTAAAGACAATGTACAAGAGACTCAAATC  1908
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  ACACAGTTCAGTGCATGAACCGTTATTGATCCGAATGAACTCTAAAGACAATGTACAAGAGACTCAAATC  1920