Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000492358
• Subject: XM_006497785.2
• Aligned Length: 834
• Identities: 545
• Gaps: 243

Alignment

Query   1  ATGGCGGCTGTGTCGGTGTATGCTCCACCAGTTGGAGGCTTCTCTTTTGATAACTGCCGCAGGAATGCCGTCTT  74
           |||||||||||||||||||.|...|||||.||.||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.|||||
Sbjct   1  ATGGCGGCTGTGTCGGTGTTTCAGCCACCGGTCGGAGGCTTTTCTTTTGATAATTGTCGCAGGAATGCTGTCTT  74

Query  75  GGAAGCCGATTTTGCAAAGAGGGGATACAAGCTTCCAAAGGCCCGGAAAACTGGCACGACCATCGCTGGGGTGG  148
           ||||||.|||||.|||||.|.|||.|.||||||.||.||.||.||||||||||||||.||||||||.|||||||
Sbjct  75  GGAAGCGGATTTCGCAAAAAAGGGGTTCAAGCTCCCGAAAGCTCGGAAAACTGGCACTACCATCGCGGGGGTGG  148

Query 149  TCTATAAGGATGGCATAGTTCTTGGAGCAGATACAAGAGCAACTGAAGGGATGGTTGTTGCTGACAAGAACTGT  222
           |.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 149  TGTATAAGGATGGCATAGTTCTTGGAGCAGACACGAGAGCAACTGAAGGGATGGTTGTTGCTGACAAAAACTGT  222

Query 223  TCAAAAATACACTTCATATCTCCTAATATTTATTGTTGTGGTGCTGGGACAGCTGCAGACACAGACATGACAAC  296
           ||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  TCAAAAATTCACTTCATATCTCCTAATATTTATTGCTGTGGTGCTGGGACAGCTGCAGACACAGACATGACAAC  296

Query 297  CCAGCTCATTTCTTCCAACCTGGAGCTCCACTCCCTCTCCACTGGCCGTCTTCCCAGAGTTGTGACAGCCAATC  370
           ||||||.||||||||||||.|||||||||||||.||..||||||||||.||.||.||||||||.|||||.||||
Sbjct 297  CCAGCTTATTTCTTCCAACTTGGAGCTCCACTCTCTGACCACTGGCCGCCTCCCGAGAGTTGTTACAGCTAATC  370

Query 371  GGATGCTGAAGCAGATGCTTTTCAGGTATCAAGGTTACATTGGTGCAGCCCTAGTTTTAGGGGGAGTAGATGTT  444
           |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 371  GGATGCTGAAGCAGATGCTCTTCAGGTATCAAGGTTACATTGGTGCAGCCCTAGTTTTGGGGGGAGTAGATGTT  444

Query 445  ACTGGACCTCACCTCTACAGCATCTATCCTCATGGATCAACTGATAAGTTGCCTTATGTCACCATGGGTTCTGG  518
           |||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445  ACTGGACCTCATCTCTACAGCATCTATCCTCATGGATCAACTGATAAATTGCCTTATGTCACCATGGGTTCTGG  518

Query 519  CTCCTTGGCAGCAATGGCTGTATTTGAAGATAAGTTTAGGCCAGACATGGAGGAGGAGGAAGCCAAGAATCTGG  592
           |||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||        
Sbjct 519  CTCCTTGGCAGCAATGGCTGTGTTTGAAGATAAGTTTAGGCCAGATATGGAGGAGGAAGAAGCTAA--------  584

Query 593  TGAGC---GAAGCCATCGCAGCTGGCATCTTCAACGACCTGGGCTCCGGAAGCAACATTGACCTCTGCGTCATC  663
            ||||   |||                                                               
Sbjct 585  -GAGCAAAGAA---------------------------------------------------------------  594

Query 664  AGCAAGAACAAGCTGGATTTTCTCCGCCCATACACAGTGCCCAACAAGAAGGGGACCAGGCTTGGCCGGTACAG  737
                                                                                     
Sbjct 595  --------------------------------------------------------------------------  594

Query 738  GTGTGAGAAAGGGACTACTGCAGTCCTCACTGAGAAAATCACTCCTCTGGAGATTGAGGTGCTGGAAGAAACAG  811
                                                                                     
Sbjct 595  --------------------------------------------------------------------------  594

Query 812  TCCAAACAATGGACACTTCC  831
                               
Sbjct 595  --------------------  594