Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000492360
- Subject:
- NM_001318920.1
- Aligned Length:
- 1115
- Identities:
- 938
- Gaps:
- 34
Alignment
Query 1 ATGGAGCCCCTCTTCCCCGCGCCGTTCTGGGAGGTTATCTACGGCAGCCACCTTCAGGGCAACCTGTCCCTCC- 73
||||||.|||||||.||.||.||.|||||||||||..|.||.|||||||||.||||.||.||||||||.||||
Sbjct 1 ATGGAGTCCCTCTTTCCTGCCCCATTCTGGGAGGTCTTGTATGGCAGCCACTTTCAAGGGAACCTGTCTCTCCT 74
Query 74 ---TGAGCCCCAACCACAGTCTGCTGCCCCCGCATCTGCTGCTCAATGCCAGCCACGGCGCCTTCCTGCCCCTC 144
||||.|| .|.||||..||.|||||.||||||||.||||||.|.||||||||||||||.
Sbjct 75 AAATGAGACC-------------GTACCCCATCACCTGCTCCTCAATGCTAGCCACAGTGCCTTCCTGCCCCTT 135
Query 145 GGGCTCAAGGTCACCATCGTGGGGCTCTACCTGGCCGTGTGTGTCGGAGGGCTCCTGGGGAACTGCCTTGTCAT 218
||.|||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||..||||.||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 136 GGACTCAAGGTCACCATCGTGGGGCTCTACTTGGCTGTGTGCATCGGGGGGCTCCTGGGGAACTGCCTCGTCAT 209
Query 219 GTACGTCATCCTCAGGCACACCAAAATGAAGACAGCCACCAATATTTACATCTTTAACCTGGCCCTGGCCGACA 292
|||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||.|||||.|||||.|||||.||.|
Sbjct 210 ---------------GCACACCAAGATGAAGACTGCTACCAACATTTACATATTTAATCTGGCACTGGCTGATA 268
Query 293 CTCTGGTCCTGCTGACGCTGCCCTTCCAGGGCACGGACATCCTCCTGGGCTTCTGGCCGTTTGGGAATGCGCTG 366
|.||||||.|||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||
Sbjct 269 CCCTGGTCTTGCTGACACTGCCCTTCCAGGGCACAGACATCCTTCTGGGCTTCTGGCCATTTGGGAATGCACTG 342
Query 367 TGCAAGACAGTCATTGCCATTGACTACTACAACATGTTCACCAGCACCTTCACCCTAACTGCCATGAGTGTGGA 440
||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||..|.||||||||||||||.||
Sbjct 343 TGCAAGACGGTCATTGCTATCGACTACTACAACATGTTTACCAGCACTTTCACTTTGACTGCCATGAGTGTAGA 416
Query 441 TCGCTATGTAGCCATCTGCCACCCCATCCGTGCCCTCGACGTCCGCACGTCCAGCAAAGCCCAGGCTGTCAATG 514
.||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||.||.||.|||||.|||||||||||.||.||||
Sbjct 417 CCGTTATGTAGCTATCTGCCACCCTATCCGTGCCCTTGATGTTCGGACATCCAGTAAAGCCCAGGCCGTTAATG 490
Query 515 TGGCCATCTGGGCCCTGGCCTCTGTTGTCGGTGTTCCCGTTGCCATCATGGGCTCGGCACAGGTCGAGGATGAA 588
|||||||.|||||||||||.||.||.||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||
Sbjct 491 TGGCCATATGGGCCCTGGCTTCGGTGGTTGGTGTTCCTGTTGCCATCATGGGCTCAGCACAAGTGGAGGATGAA 564
Query 589 GAGATCGAGTGCCTGGTGGAGATCCCTACCCCTCAGGATTACTGGGGCCCGGTGTTTGCCATCTGCATCTTCCT 662
||||||||||||||||||||||||||..||||||||||.||.||||||||.||.||||||||||||||||||||
Sbjct 565 GAGATCGAGTGCCTGGTGGAGATCCCCGCCCCTCAGGACTATTGGGGCCCTGTATTTGCCATCTGCATCTTCCT 638
Query 663 CTTCTCCTTCATCGTCCCCGTGCTCGTCATCTCTGTCTGCTACAGCCTCATGATCCGGCGGCTCCGTGGAGTCC 736
.||.|||||||||.||||.||.||..||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||.||||
Sbjct 639 TTTTTCCTTCATCATCCCGGTTCTGATCATCTCTGTCTGCTACAGCCTCATGATTCGACGACTTCGTGGTGTCC 712
Query 737 GCCTGCTCTCGGGCTCCCGAGAGAAGGACCGGAACCTGCGGCGCATCACTCGGCTGGTGCTGGTGGTAGTGGCT 810
|.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||.||||||
Sbjct 713 GGCTGCTTTCAGGCTCCCGAGAGAAGGACCGGAACCTGCGACGCATCACACGGCTGGTACTGGTAGTTGTGGCT 786
Query 811 GTGTTCGTGGGCTGCTGGACGCCTGTCCAGGTCTTCGTGCTGGCCCAAGGGCTGGGGGTTCAGCCGAGCAGCGA 884
|||||.||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||||..|||||.|||||.||||||||..|.||.||
Sbjct 787 GTGTTTGTGGGCTGCTGGACACCTGTGCAGGTCTTTGTCCTGGTTCAAGGACTGGGTGTTCAGCCAGGTAGTGA 860
Query 885 GACTGCCGTGGCCATTCTGCGCTTCTGCACGGCCCTGGGCTACGTCAACAGCTGCCTCAACCCCATCCTCTACG 958
||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||.|||||.|||||.|
Sbjct 861 GACTGCAGTAGCCATTCTGCGCTTCTGCACAGCCCTGGGCTATGTCAACAGTTGTCTCAATCCCATTCTCTATG 934
Query 959 CCTTCCTGGATGAGAACTTCAAGGCCTGCTTCCGCAAGTTCTGCTGTGCATCTGCCCTGCGCCGGGACGTGCAG 1032
|.|||.|||||||||||||||||||||||||..|.||||||||||||||.||||||||||.||||||..|||||
Sbjct 935 CTTTCTTGGATGAGAACTTCAAGGCCTGCTTTAGAAAGTTCTGCTGTGCTTCTGCCCTGCACCGGGAGATGCAG 1008
Query 1033 GTGTCTGACCGCGTGCGCAGCATTGCCAAGGACGT-GGCCCTGGCCTGCAAGACCTCTGAGACGGTACCGCGGC 1105
||.|||||.||.||||||||||||||||||||.|| ||||.||| .|||||||||||||||||.|||||.||||
Sbjct 1009 GTTTCTGATCGTGTGCGCAGCATTGCCAAGGATGTAGGCCTTGG-TTGCAAGACCTCTGAGACAGTACCACGGC 1081
Query 1106 CCGCA 1110
|.|||
Sbjct 1082 CGGCA 1086