Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000492360
- Subject:
- NM_001318922.1
- Aligned Length:
- 1145
- Identities:
- 892
- Gaps:
- 121
Alignment
Query 1 ATGGAGCCCCTCTTCCCCGCGCCGTTCTGGGAGGTTATCTACGGCAGCCACCTTCAGGGCAACCTGTCCCTCCT 74
.|
Sbjct 1 ------------------------------------------------------------------------AT 2
Query 75 GAGCCCCAACCACAGTCTGCTGCCCCCGCATCTGCTGCTCAATGCCAGCCACGGCGCCTTCCTGCCCCTCGGGC 148
|||.|| .|.||||..||.|||||.||||||||.||||||.|.||||||||||||||.||.|
Sbjct 3 GAGACC-------------GTACCCCATCACCTGCTCCTCAATGCTAGCCACAGTGCCTTCCTGCCCCTTGGAC 63
Query 149 TCAAGGTCACCATCGTGGGGCTCTACCTGGCCGTGTGTGTCGGAGGGCTCCTGGGGAACTGCCTTGTCATGTAC 222
||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||..||||.||||||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 64 TCAAGGTCACCATCGTGGGGCTCTACTTGGCTGTGTGCATCGGGGGGCTCCTGGGGAACTGCCTCGTCATGTAT 137
Query 223 GTCATCCT----------------------------------CAGGCACACCAAAATGAAGACAGCCACCAATA 262
|||||||| ||||||||||||.||||||||.||.|||||.|
Sbjct 138 GTCATCCTCAGCTGGGAGGGCATTGAGGGGAACTGGAGACAGCAGGCACACCAAGATGAAGACTGCTACCAACA 211
Query 263 TTTACATCTTTAACCTGGCCCTGGCCGACACTCTGGTCCTGCTGACGCTGCCCTTCCAGGGCACGGACATCCTC 336
|||||||.|||||.|||||.|||||.||.||.||||||.|||||||.|||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 212 TTTACATATTTAATCTGGCACTGGCTGATACCCTGGTCTTGCTGACACTGCCCTTCCAGGGCACAGACATCCTT 285
Query 337 CTGGGCTTCTGGCCGTTTGGGAATGCGCTGTGCAAGACAGTCATTGCCATTGACTACTACAACATGTTCACCAG 410
||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct 286 CTGGGCTTCTGGCCATTTGGGAATGCACTGTGCAAGACGGTCATTGCTATCGACTACTACAACATGTTTACCAG 359
Query 411 CACCTTCACCCTAACTGCCATGAGTGTGGATCGCTATGTAGCCATCTGCCACCCCATCCGTGCCCTCGACGTCC 484
|||.|||||..|.||||||||||||||.||.||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||.|
Sbjct 360 CACTTTCACTTTGACTGCCATGAGTGTAGACCGTTATGTAGCTATCTGCCACCCTATCCGTGCCCTTGATGTTC 433
Query 485 GCACGTCCAGCAAAGCCCAGGCTGTCAATGTGGCCATCTGGGCCCTGGCCTCTGTTGTCGGTGTTCCCGTTGCC 558
|.||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.||.||.||.||||||||.||||||
Sbjct 434 GGACATCCAGTAAAGCCCAGGCCGTTAATGTGGCCATATGGGCCCTGGCTTCGGTGGTTGGTGTTCCTGTTGCC 507
Query 559 ATCATGGGCTCGGCACAGGTCGAGGATGAAGAGATCGAGTGCCTGGTGGAGATCCCTACCCCTCAGGATTACTG 632
|||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||.||.||
Sbjct 508 ATCATGGGCTCAGCACAAGTGGAGGATGAAGAGATCGAGTGCCTGGTGGAGATCCCCGCCCCTCAGGACTATTG 581
Query 633 GGGCCCGGTGTTTGCCATCTGCATCTTCCTCTTCTCCTTCATCGTCCCCGTGCTCGTCATCTCTGTCTGCTACA 706
||||||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||.||||.||.||..||||||||||||||||||
Sbjct 582 GGGCCCTGTATTTGCCATCTGCATCTTCCTTTTTTCCTTCATCATCCCGGTTCTGATCATCTCTGTCTGCTACA 655
Query 707 GCCTCATGATCCGGCGGCTCCGTGGAGTCCGCCTGCTCTCGGGCTCCCGAGAGAAGGACCGGAACCTGCGGCGC 780
||||||||||.||.||.||.|||||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 656 GCCTCATGATTCGACGACTTCGTGGTGTCCGGCTGCTTTCAGGCTCCCGAGAGAAGGACCGGAACCTGCGACGC 729
Query 781 ATCACTCGGCTGGTGCTGGTGGTAGTGGCTGTGTTCGTGGGCTGCTGGACGCCTGTCCAGGTCTTCGTGCTGGC 854
|||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||||.
Sbjct 730 ATCACACGGCTGGTACTGGTAGTTGTGGCTGTGTTTGTGGGCTGCTGGACACCTGTGCAGGTCTTTGTCCTGGT 803
Query 855 CCAAGGGCTGGGGGTTCAGCCGAGCAGCGAGACTGCCGTGGCCATTCTGCGCTTCTGCACGGCCCTGGGCTACG 928
.|||||.|||||.||||||||..|.||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct 804 TCAAGGACTGGGTGTTCAGCCAGGTAGTGAGACTGCAGTAGCCATTCTGCGCTTCTGCACAGCCCTGGGCTATG 877
Query 929 TCAACAGCTGCCTCAACCCCATCCTCTACGCCTTCCTGGATGAGAACTTCAAGGCCTGCTTCCGCAAGTTCTGC 1002
|||||||.||.|||||.|||||.|||||.||.|||.|||||||||||||||||||||||||..|.|||||||||
Sbjct 878 TCAACAGTTGTCTCAATCCCATTCTCTATGCTTTCTTGGATGAGAACTTCAAGGCCTGCTTTAGAAAGTTCTGC 951
Query 1003 TGTGCATCTGCCCTGCGCCGGGACGTGCAGGTGTCTGACCGCGTGCGCAGCATTGCCAAGGACGT-GGCCCTGG 1075
|||||.||||||||||.||||||..|||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||.|| ||||.|||
Sbjct 952 TGTGCTTCTGCCCTGCACCGGGAGATGCAGGTTTCTGATCGTGTGCGCAGCATTGCCAAGGATGTAGGCCTTGG 1025
Query 1076 CCTGCAAGACCTCTGAGACGGTACCGCGGCCCGCA 1110
.|||||||||||||||||.|||||.|||||.|||
Sbjct 1026 -TTGCAAGACCTCTGAGACAGTACCACGGCCGGCA 1059