Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_00006
• Subject: NM_001127328.2
• Aligned Length: 1275
• Identities: 1263
• Gaps: 12

Alignment

Query    1  ATGGCAGCGGGGTTCGGGCGATGCTGCAG------------GGTCCTGAGAAGTATTTCTCGTTTTCATTGGAG  62
            |||||||||||||||||||||||||||||            |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCAGCGGGGTTCGGGCGATGCTGCAGGTGTTCTTTACAGGTCCTGAGAAGTATTTCTCGTTTTCATTGGAG  74

Query   63  ATCACAGCATACAAAAGCCAATCGACAACGTGAACCAGGATTAGGATTTAGTTTTGAGTTCACCGAACAGCAGA  136
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  ATCACAGCATACAAAAGCCAATCGACAACGTGAACCAGGATTAGGATTTAGTTTTGAGTTCACCGAACAGCAGA  148

Query  137  AAGAATTTCAAGCTACTGCTCGTAAATTTGCCAGAGAGGAAATCATCCCAGTGGCTGCAGAATATGATAAAACT  210
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AAGAATTTCAAGCTACTGCTCGTAAATTTGCCAGAGAGGAAATCATCCCAGTGGCTGCAGAATATGATAAAACT  222

Query  211  GGTGAATATCCAGTCCCCCTAATTAGAAGAGCCTGGGAACTTGGTTTAATGAACACACACATTCCAGAGAACTG  284
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GGTGAATATCCAGTCCCCCTAATTAGAAGAGCCTGGGAACTTGGTTTAATGAACACACACATTCCAGAGAACTG  296

Query  285  TGGAGGTCTTGGACTTGGAACTTTTGATGCTTGTTTAATTAGTGAAGAATTGGCTTATGGATGTACAGGGGTTC  358
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGGAGGTCTTGGACTTGGAACTTTTGATGCTTGTTTAATTAGTGAAGAATTGGCTTATGGATGTACAGGGGTTC  370

Query  359  AGACTGCTATTGAAGGAAATTCTTTGGGGCAAATGCCTATTATTATTGCTGGAAATGATCAACAAAAGAAGAAG  432
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGACTGCTATTGAAGGAAATTCTTTGGGGCAAATGCCTATTATTATTGCTGGAAATGATCAACAAAAGAAGAAG  444

Query  433  TATTTGGGGAGAATGACTGAGGAGCCATTGATGTGTGCTTATTGTGTAACAGAACCTGGAGCAGGCTCTGATGT  506
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TATTTGGGGAGAATGACTGAGGAGCCATTGATGTGTGCTTATTGTGTAACAGAACCTGGAGCAGGCTCTGATGT  518

Query  507  AGCTGGTATAAAGACCAAAGCAGAAAAGAAAGGAGATGAGTATATTATTAATGGTCAGAAGATGTGGATAACCA  580
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGCTGGTATAAAGACCAAAGCAGAAAAGAAAGGAGATGAGTATATTATTAATGGTCAGAAGATGTGGATAACCA  592

Query  581  ACGGAGGAAAAGCTAATTGGTATTTTTTATTGGCACGTTCTGATCCAGATCCTAAAGCTCCTGCTAATAAAGCC  654
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACGGAGGAAAAGCTAATTGGTATTTTTTATTGGCACGTTCTGATCCAGATCCTAAAGCTCCTGCTAATAAAGCC  666

Query  655  TTTACTGGATTCATTGTGGAAGCAGATACCCCAGGAATTCAGATTGGGAGAAAGGAATTAAACATGGGCCAGCG  728
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TTTACTGGATTCATTGTGGAAGCAGATACCCCAGGAATTCAGATTGGGAGAAAGGAATTAAACATGGGCCAGCG  740

Query  729  ATGTTCAGATACTAGAGGAATTGTCTTCGAAGATGTGAAAGTGCCTAAAGAAAATGTTTTAATTGGTGACGGAG  802
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  ATGTTCAGATACTAGAGGAATTGTCTTCGAAGATGTGAAAGTGCCTAAAGAAAATGTTTTAATTGGTGACGGAG  814

Query  803  CTGGTTTCAAAGTTGCAATGGGAGCTTTTGATAAAACCAGACCTGTAGTAGCTGCTGGTGCTGTTGGATTAGCA  876
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CTGGTTTCAAAGTTGCAATGGGAGCTTTTGATAAAACCAGACCTGTAGTAGCTGCTGGTGCTGTTGGATTAGCA  888

Query  877  CAAAGAGCTTTGGATGAAGCTACCAAGTATGCCCTGGAAAGGAAAACTTTCGGAAAGCTACTTGTAGAGCACCA  950
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CAAAGAGCTTTGGATGAAGCTACCAAGTATGCCCTGGAAAGGAAAACTTTCGGAAAGCTACTTGTAGAGCACCA  962

Query  951  AGCAATATCATTTATGCTGGCTGAAATGGCAATGAAAGTTGAACTAGCTAGAATGAGTTACCAGAGAGCAGCTT  1024
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AGCAATATCATTTATGCTGGCTGAAATGGCAATGAAAGTTGAACTAGCTAGAATGAGTTACCAGAGAGCAGCTT  1036

Query 1025  GGGAGGTTGATTCTGGTCGTCGAAATACCTATTATGCTTCTATTGCAAAGGCATTTGCTGGAGATATTGCAAAT  1098
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GGGAGGTTGATTCTGGTCGTCGAAATACCTATTATGCTTCTATTGCAAAGGCATTTGCTGGAGATATTGCAAAT  1110

Query 1099  CAGTTAGCTACTGATGCTGTGCAGATACTTGGAGGCAATGGATTTAATACAGAATATCCTGTAGAAAAACTAAT  1172
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CAGTTAGCTACTGATGCTGTGCAGATACTTGGAGGCAATGGATTTAATACAGAATATCCTGTAGAAAAACTAAT  1184

Query 1173  GAGGGATGCCAAAATCTATCAGATTTATGAAGGTACTTCACAAATTCAAAGACTTATTGTAGCCCGTGAACACA  1246
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GAGGGATGCCAAAATCTATCAGATTTATGAAGGTACTTCACAAATTCAAAGACTTATTGTAGCCCGTGAACACA  1258

Query 1247  TTGACAAGTACAAAAAT  1263
            |||||||||||||||||
Sbjct 1259  TTGACAAGTACAAAAAT  1275