Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_00010
• Subject: NM_002197.3
• Aligned Length: 2667
• Identities: 2667
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGAGCAACCCATTCGCACACCTTGCTGAGCCATTGGATCCTGTACAACCAGGAAAGAAATTCTTCAATTTGAA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAGCAACCCATTCGCACACCTTGCTGAGCCATTGGATCCTGTACAACCAGGAAAGAAATTCTTCAATTTGAA  74

Query   75  TAAATTGGAGGATTCAAGATATGGGCGCTTACCATTTTCGATCAGAGTTCTTCTGGAAGCAGCCATTCGGAATT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TAAATTGGAGGATTCAAGATATGGGCGCTTACCATTTTCGATCAGAGTTCTTCTGGAAGCAGCCATTCGGAATT  148

Query  149  GTGATGAGTTTTTGGTGAAGAAACAGGATATTGAAAATATTCTACATTGGAATGTCACGCAGCACAAGAACATA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GTGATGAGTTTTTGGTGAAGAAACAGGATATTGAAAATATTCTACATTGGAATGTCACGCAGCACAAGAACATA  222

Query  223  GAAGTGCCATTTAAGCCTGCTCGTGTCATCCTGCAGGACTTTACGGGTGTGCCCGCTGTGGTTGACTTTGCTGC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GAAGTGCCATTTAAGCCTGCTCGTGTCATCCTGCAGGACTTTACGGGTGTGCCCGCTGTGGTTGACTTTGCTGC  296

Query  297  AATGCGTGATGCTGTGAAAAAGTTAGGAGGAGATCCAGAGAAAATAAACCCTGTCTGCCCTGCTGATCTTGTAA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AATGCGTGATGCTGTGAAAAAGTTAGGAGGAGATCCAGAGAAAATAAACCCTGTCTGCCCTGCTGATCTTGTAA  370

Query  371  TAGATCATTCCATCCAGGTTGATTTCAACAGAAGGGCAGACAGTTTACAGAAGAATCAAGACCTGGAATTTGAA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TAGATCATTCCATCCAGGTTGATTTCAACAGAAGGGCAGACAGTTTACAGAAGAATCAAGACCTGGAATTTGAA  444

Query  445  AGAAATAGAGAGCGATTTGAATTTTTAAAGTGGGGTTCCCAGGCTTTTCACAACATGCGGATTATTCCCCCTGG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AGAAATAGAGAGCGATTTGAATTTTTAAAGTGGGGTTCCCAGGCTTTTCACAACATGCGGATTATTCCCCCTGG  518

Query  519  CTCAGGAATCATCCACCAGGTGAATTTGGAATATTTGGCAAGAGTGGTATTTGATCAGGATGGATATTATTACC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CTCAGGAATCATCCACCAGGTGAATTTGGAATATTTGGCAAGAGTGGTATTTGATCAGGATGGATATTATTACC  592

Query  593  CAGACAGCCTCGTGGGCACAGACTCGCACACTACCATGATTGATGGCTTGGGCATTCTTGGTTGGGGTGTCGGT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CAGACAGCCTCGTGGGCACAGACTCGCACACTACCATGATTGATGGCTTGGGCATTCTTGGTTGGGGTGTCGGT  666

Query  667  GGTATTGAAGCAGAAGCTGTCATGCTGGGTCAGCCAATCAGTATGGTGCTTCCTCAGGTGATTGGCTACAGGCT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GGTATTGAAGCAGAAGCTGTCATGCTGGGTCAGCCAATCAGTATGGTGCTTCCTCAGGTGATTGGCTACAGGCT  740

Query  741  GATGGGGAAGCCCCACCCTCTGGTAACATCCACTGACATCGTGCTCACCATTACCAAGCACCTCCGCCAGGTTG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GATGGGGAAGCCCCACCCTCTGGTAACATCCACTGACATCGTGCTCACCATTACCAAGCACCTCCGCCAGGTTG  814

Query  815  GGGTAGTGGGCAAATTTGTCGAGTTCTTCGGGCCTGGAGTAGCCCAGTTGTCCATTGCTGACCGAGCTACGATT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GGGTAGTGGGCAAATTTGTCGAGTTCTTCGGGCCTGGAGTAGCCCAGTTGTCCATTGCTGACCGAGCTACGATT  888

Query  889  GCTAACATGTGTCCAGAGTACGGAGCAACTGCTGCCTTTTTCCCAGTTGATGAAGTTAGTATCACGTACCTGGT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GCTAACATGTGTCCAGAGTACGGAGCAACTGCTGCCTTTTTCCCAGTTGATGAAGTTAGTATCACGTACCTGGT  962

Query  963  GCAAACAGGTCGTGATGAAGAAAAATTAAAGTATATTAAAAAATATCTTCAGGCTGTAGGAATGTTTCGAGATT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GCAAACAGGTCGTGATGAAGAAAAATTAAAGTATATTAAAAAATATCTTCAGGCTGTAGGAATGTTTCGAGATT  1036

Query 1037  TCAATGACCCTTCTCAAGACCCAGACTTCACCCAGGTTGTGGAATTAGATTTGAAAACAGTAGTGCCTTGCTGT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TCAATGACCCTTCTCAAGACCCAGACTTCACCCAGGTTGTGGAATTAGATTTGAAAACAGTAGTGCCTTGCTGT  1110

Query 1111  AGTGGACCCAAAAGGCCTCAGGACAAAGTTGCTGTGTCCGACATGAAAAAGGACTTTGAGAGCTGCCTTGGAGC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AGTGGACCCAAAAGGCCTCAGGACAAAGTTGCTGTGTCCGACATGAAAAAGGACTTTGAGAGCTGCCTTGGAGC  1184

Query 1185  CAAGCAAGGATTTAAAGGATTCCAAGTTGCTCCTGAACATCATAATGACCATAAGACCTTTATCTATGATAACA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CAAGCAAGGATTTAAAGGATTCCAAGTTGCTCCTGAACATCATAATGACCATAAGACCTTTATCTATGATAACA  1258

Query 1259  CTGAATTCACCCTTGCTCATGGTTCTGTGGTCATTGCTGCCATTACTAGCTGCACAAACACCAGTAATCCGTCT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CTGAATTCACCCTTGCTCATGGTTCTGTGGTCATTGCTGCCATTACTAGCTGCACAAACACCAGTAATCCGTCT  1332

Query 1333  GTGATGTTAGGGGCAGGATTGTTAGCAAAGAAAGCTGTGGATGCTGGCCTGAACGTGATGCCTTACATCAAAAC  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GTGATGTTAGGGGCAGGATTGTTAGCAAAGAAAGCTGTGGATGCTGGCCTGAACGTGATGCCTTACATCAAAAC  1406

Query 1407  TAGCCTGTCTCCTGGGAGTGGCGTGGTCACCTACTACCTACAAGAAAGCGGAGTCATGCCTTATCTGTCTCAGC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TAGCCTGTCTCCTGGGAGTGGCGTGGTCACCTACTACCTACAAGAAAGCGGAGTCATGCCTTATCTGTCTCAGC  1480

Query 1481  TTGGGTTTGACGTGGTGGGCTATGGCTGCATGACCTGCATTGGCAACAGTGGGCCTTTACCTGAACCTGTGGTA  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TTGGGTTTGACGTGGTGGGCTATGGCTGCATGACCTGCATTGGCAACAGTGGGCCTTTACCTGAACCTGTGGTA  1554

Query 1555  GAAGCCATCACACAGGGAGACCTTGTAGCTGTTGGAGTACTATCTGGAAACAGGAATTTTGAAGGTCGAGTTCA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GAAGCCATCACACAGGGAGACCTTGTAGCTGTTGGAGTACTATCTGGAAACAGGAATTTTGAAGGTCGAGTTCA  1628

Query 1629  CCCCAACACCCGGGCCAACTATTTAGCCTCTCCCCCCTTAGTAATAGCATATGCAATTGCTGGAACCATCAGAA  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CCCCAACACCCGGGCCAACTATTTAGCCTCTCCCCCCTTAGTAATAGCATATGCAATTGCTGGAACCATCAGAA  1702

Query 1703  TCGACTTTGAGAAAGAGCCATTGGGAGTAAATGCAAAGGGACAGCAGGTATTTCTGAAAGATATCTGGCCGACT  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  TCGACTTTGAGAAAGAGCCATTGGGAGTAAATGCAAAGGGACAGCAGGTATTTCTGAAAGATATCTGGCCGACT  1776

Query 1777  AGAGACGAGATCCAGGCAGTGGAGCGTCAGTATGTCATCCCGGGGATGTTTAAGGAAGTCTATCAGAAAATAGA  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  AGAGACGAGATCCAGGCAGTGGAGCGTCAGTATGTCATCCCGGGGATGTTTAAGGAAGTCTATCAGAAAATAGA  1850

Query 1851  GACTGTGAATGAAAGCTGGAATGCCTTAGCAACCCCATCAGATAAGCTGTTTTTCTGGAATTCCAAATCTACGT  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GACTGTGAATGAAAGCTGGAATGCCTTAGCAACCCCATCAGATAAGCTGTTTTTCTGGAATTCCAAATCTACGT  1924

Query 1925  ATATCAAATCACCACCATTCTTTGAAAACCTGACTTTGGATCTTCAGCCCCCTAAATCTATAGTGGATGCCTAT  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  ATATCAAATCACCACCATTCTTTGAAAACCTGACTTTGGATCTTCAGCCCCCTAAATCTATAGTGGATGCCTAT  1998

Query 1999  GTGCTGCTAAATTTGGGAGATTCGGTAACAACTGACCACATCTCCCCAGCTGGAAATATTGCAAGAAACAGTCC  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  GTGCTGCTAAATTTGGGAGATTCGGTAACAACTGACCACATCTCCCCAGCTGGAAATATTGCAAGAAACAGTCC  2072

Query 2073  TGCTGCTCGCTACTTAACTAACAGAGGCCTAACTCCACGAGAATTCAACTCCTATGGCTCCCGCCGAGGTAATG  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  TGCTGCTCGCTACTTAACTAACAGAGGCCTAACTCCACGAGAATTCAACTCCTATGGCTCCCGCCGAGGTAATG  2146

Query 2147  ACGCCGTCATGGCACGGGGAACATTTGCCAACATTCGCTTGTTAAACAGATTTTTGAACAAGCAGGCACCACAG  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  ACGCCGTCATGGCACGGGGAACATTTGCCAACATTCGCTTGTTAAACAGATTTTTGAACAAGCAGGCACCACAG  2220

Query 2221  ACTATCCATCTGCCTTCTGGGGAAATCCTTGATGTGTTTGATGCTGCTGAGCGGTACCAGCAGGCAGGCCTTCC  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  ACTATCCATCTGCCTTCTGGGGAAATCCTTGATGTGTTTGATGCTGCTGAGCGGTACCAGCAGGCAGGCCTTCC  2294

Query 2295  CCTGATCGTTCTGGCTGGCAAAGAGTACGGTGCAGGCAGCTCCCGAGACTGGGCAGCTAAGGGCCCTTTCCTGC  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  CCTGATCGTTCTGGCTGGCAAAGAGTACGGTGCAGGCAGCTCCCGAGACTGGGCAGCTAAGGGCCCTTTCCTGC  2368

Query 2369  TGGGAATCAAAGCCGTCCTGGCCGAGAGCTACGAGCGCATTCACCGCAGTAACCTGGTTGGGATGGGTGTGATC  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  TGGGAATCAAAGCCGTCCTGGCCGAGAGCTACGAGCGCATTCACCGCAGTAACCTGGTTGGGATGGGTGTGATC  2442

Query 2443  CCACTTGAATATCTCCCTGGTGAGAATGCAGATGCCCTGGGGCTCACAGGGCAAGAACGATACACTATCATTAT  2516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  CCACTTGAATATCTCCCTGGTGAGAATGCAGATGCCCTGGGGCTCACAGGGCAAGAACGATACACTATCATTAT  2516

Query 2517  TCCAGAAAACCTCAAACCACAAATGAAAGTCCAGGTCAAGCTGGATACTGGCAAGACCTTCCAGGCTGTCATGA  2590
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  TCCAGAAAACCTCAAACCACAAATGAAAGTCCAGGTCAAGCTGGATACTGGCAAGACCTTCCAGGCTGTCATGA  2590

Query 2591  GGTTTGACACTGATGTGGAGCTCACTTATTTCCTCAACGGGGGCATCCTCAACTACATGATCCGCAAGATGGCC  2664
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591  GGTTTGACACTGATGTGGAGCTCACTTATTTCCTCAACGGGGGCATCCTCAACTACATGATCCGCAAGATGGCC  2664

Query 2665  AAG  2667
            |||
Sbjct 2665  AAG  2667