Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_00016
Subject:
NM_134156.2
Aligned Length:
911
Identities:
765
Gaps:
19

Alignment

Query   1  MVDYHAANQSYQYGPSSAGNGAGGGGSMGDYMAQEDDWDRDLLLDPAWEKQQRKTFTAWCNSHLRKAGTQIENI  74
            .|.....|.                  .|||..|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  -MDHYDSQQT------------------NDYMQPEEDWDRDLLLDPAWEKQQRKTFTAWCNSHLRKAGTQIENI  55

Query  75  DEDFRDGLKLMLLLEVISGERLPKPERGKMRVHKINNVNKALDFIASKGVKLVSIGAEEIVDGNAKMTLGMIWT  148
           .|||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  56  EEDFRDGLKLMLLLEVISGERLAKPERGKMRVHKISNVNKALDFIASKGVKLVSIGAEEIVDGNVKMTLGMIWT  129

Query 149  IILRFAIQDISVEETSAKEGLLLWCQRKTAPYKNVNVQNFHISWKDGLAFNALIHRHRPELIEYDKLRKDDPVT  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|.|||||||||||.|.|||||||.|
Sbjct 130  IILRFAIQDISVEETSAKEGLLLWCQRKTAPYKNVNIQNFHISWKDGLGFCALIHRHRPELIDYGKLRKDDPLT  203

Query 223  NLNNAFEVAEKYLDIPKMLDAEDIVNTARPDEKAIMTYVSSFYHAFSGAQKAETAANRICKVLAVNQENEHLME  296
           |||.||.|||..|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 204  NLNTAFDVAERFLDIPKMLDAEDIVGTARPDEKAIMTYVSSFYHAFSGAQKAETAANRICKVLAVNQENEQLME  277

Query 297  DYEKLASDLLEWIRRTIPWLEDRVPQKTIQEMQQKLEDFRDYRRVHKPPKVQEKCQLEINFNTLQTKLRLSNRP  370
           |||||||||||||||||||||.|||..|...|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 278  DYEKLASDLLEWIRRTIPWLENRVPENTMHAMQQKLEDFRDYRRLHKPPKVQEKCQLEINFNTLQTKLRLSNRP  351

Query 371  AFMPSEGKMVSDINNGWQHLEQAEKGYEEWLLNEIRRLERLDHLAEKFRQKASIHEAWTDGKEAMLKHRDYETA  444
           |||||||.|||||||.|..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||...|||||
Sbjct 352  AFMPSEGRMVSDINNAWGCLEQAEKGYEEWLLNEIRRLERLDHLAEKFRQKASIHEAWTDGKEAMLRQKDYETA  425

Query 445  TLSDIKALIRKHEAFESDLAAHQDRVEQIAAIAQELNELDYYDSHNVNTRCQKICDQWDALGSLTHSRREALEK  518
           |||.||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||..||.||||||||||.||.||..||||||.
Sbjct 426  TLSEIKALLKKHEAFESDLAAHQDRVEQIAAIAQELNELDYYDSPSVNARCQKICDQWDNLGALTQKRREALER  499

Query 519  TEKQLEAIDQLHLEYAKRAAPFNNWMESAMEDLQDMFIVHTIEEIEGLISAHDQFKSTLPDADREREAILAIHK  592
           |||.||.||||.|||||||||||||||.|||||||.|||||||||.||..||.|||.||||||.||.|||.||.
Sbjct 500  TEKLLETIDQLYLEYAKRAAPFNNWMEGAMEDLQDTFIVHTIEEIQGLTTAHEQFKATLPDADKERLAILGIHN  573

Query 593  EAQRIAESNHIKLSGSNPYTTVTPQIINSKWEKVQQLVPKRDHALLEEQSKQQSNEHLRRQFASQANVVGPWIQ  666
           |...|....|....|.|||||.|||.||.||..|.||||.||.||.||...||.||.||.||..||||.|||||
Sbjct 574  EVSKIVQTYHVNMAGTNPYTTITPQEINGKWDHVRQLVPRRDQALTEEHARQQHNERLRKQFGAQANVIGPWIQ  647

Query 667  TKMEEIGRISIEMNGTLEDQLSHLKQYERSIVDYKPNLDLLEQQHQLIQEALIFDNKHTNYTMEHIRVGWEQLL  740
           |||||||||||||.||||||||||.|||.|||.|||..|.||..|||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 648  TKMEEIGRISIEMHGTLEDQLSHLRQYEKSIVNYKPKIDQLECDHQLIQEALIFDNKHTNYNMEHIRVGWEQLL  721

Query 741  TTIARTINEVENQILTRDAKGISQEQMQEFRASFNHFDKDHGGALGPEEFKACLISLGYDVENDRQGEAEFNRI  814
           |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.||.|.||||||||||||||||..||.||||||.||
Sbjct 722  TTIARTINEVENQILTRDAKGISQEQMNEFRASFNHFDRDHSGTLGPEEFKACLISLGYDIGNDPQGEAEFARI  795

Query 815  MSLVDPNHSGLVTFQAFIDFMSRETTDTDTADQVIASFKVLAGDKNFITAEELRRELPPDQAEYCIARMAPYQG  888
           ||.||||..|.||||||||||||||.||||||||.||||.||||||.||..|||||||||||||||||||||.|
Sbjct 796  MSIVDPNRLGVVTFQAFIDFMSRETADTDTADQVMASFKILAGDKNYITEDELRRELPPDQAEYCIARMAPYAG  869

Query 889  PDAVPGALDYKSFSTALYGESDL  911
           ||.|||||||.||||||||||||
Sbjct 870  PDSVPGALDYMSFSTALYGESDL  892