Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_00016
- Subject:
- XM_005259281.5
- Aligned Length:
- 2746
- Identities:
- 2693
- Gaps:
- 41
Alignment
Query 1 ATGGTGGACTACCACGCGGCGAACCAGTCGTACCAGTACGGCCCCAGCAGCGCGGGCAATGGCGCTGGCGGCGG 74
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Sbjct 1 ATGGTGGACTACCACGCGGCGAACCAGTCGTACCAGTACGGCCCCAGCAGCGCGGGCAATGGCGCTGGCGGCGG 74
Query 75 GGGCAGCATGGGCGACTACATGGCCCAGGAGGACGACTGGGACCGGGACCTGCTGCTGGACCCGGCCTGGGAGA 148
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Sbjct 75 GGGCAGCATGGGCGACTACATGGCCCAGGAGGACGACTGGGACCGGGACCTGCTGCTGGACCCGGCCTGGGAGA 148
Query 149 AGCAGCAGCGCAAGACCTTCACGGCATGGTGCAACTCCCACCTGCGGAAGGCAGGCACACAGATCGAGAACATT 222
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Sbjct 149 AGCAGCAGCGCAAGACCTTCACGGCATGGTGCAACTCCCACCTGCGGAAGGCAGGCACACAGATCGAGAACATT 222
Query 223 GATGAGGACTTCCGAGACGGGCTCAAGCTCATGCTGCTCCTGGAGGTCATATCAGGGGAGCGGTTACCTAAGCC 296
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Sbjct 223 GATGAGGACTTCCGAGACGGGCTCAAGCTCATGCTGCTCCTGGAGGTCATATCAGGGGAGCGGTTACCTAAGCC 296
Query 297 GGAGCGGGGGAAGATGAGAGTGCACAAAATCAACAATGTGAACAAAGCGCTGGACTTTATTGCCAGCAAAGGCG 370
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Sbjct 297 GGAGCGGGGGAAGATGAGAGTGCACAAAATCAACAATGTGAACAAAGCGCTGGACTTTATTGCCAGCAAAGGCG 370
Query 371 TCAAGCTGGTCTCCATCGGGGCAGAAGAGATTGTGGACGGCAACGCAAAGATGACCCTGGGAATGATCTGGACC 444
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Sbjct 371 TCAAGCTGGTCTCCATCGGGGCAGAAGAGATTGTGGACGGCAACGCAAAGATGACCCTGGGAATGATCTGGACC 444
Query 445 ATCATCCTTAGGTTCGCCATCCAGGACATCTCCGTGGAAGAGACCTCGGCCAAGGAAGGGCTCCTTCTCTGGTG 518
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Sbjct 445 ATCATCCTTAGGTTCGCCATCCAGGACATCTCCGTGGAAGAGACCTCGGCCAAGGAAGGGCTCCTTCTCTGGTG 518
Query 519 CCAGAGAAAGACAGCCCCGTATAAGAACGTCAATGTGCAGAACTTCCACATCAGCTGGAAGGATGGTCTTGCCT 592
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Sbjct 519 CCAGAGAAAGACAGCCCCGTATAAGAACGTCAATGTGCAGAACTTCCACATCAGCTGGAAGGATGGTCTTGCCT 592
Query 593 TCAATGCCCTGATCCACCGGCACAGACCAGAGCTGATTGAGTATGACAAGCTGAGGAAGGACGACCCTGTCACC 666
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Sbjct 593 TCAATGCCCTGATCCACCGGCACAGACCAGAGCTGATTGAGTATGACAAGCTGAGGAAGGACGACCCTGTCACC 666
Query 667 AACCTGAACAATGCCTTCGAAGTGGCTGAGAAATACCTCGACATCCCCAAGATGCTGGATGCAGAGGACATCGT 740
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Sbjct 667 AACCTGAACAATGCCTTCGAAGTGGCTGAGAAATACCTCGACATCCCCAAGATGCTGGATGCAGAGGACATCGT 740
Query 741 GAACACGGCCCGGCCCGACGAGAAGGCCATAATGACCTATGTGTCCAGCTTCTACCATGCCTTTTCAGGAGCGC 814
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Sbjct 741 GAACACGGCCCGGCCCGACGAGAAGGCCATAATGACCTATGTGTCCAGCTTCTACCATGCCTTTTCAGGAGCGC 814
Query 815 AGAAGGCTGAAACTGCCGCCAACCGGATCTGTAAGGTGCTGGCTGTCAACCAAGAGAACGAGCACCTGATGGAG 888
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Sbjct 815 AGAAGGCTGAAACTGCCGCCAACCGGATCTGTAAGGTGCTGGCTGTCAACCAAGAGAACGAGCACCTGATGGAG 888
Query 889 GACTACGAGAAGCTGGCCAGCGACCTCCTGGAGTGGATCCGGCGCACCATCCCCTGGCTGGAGGACCGTGTGCC 962
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Sbjct 889 GACTACGAGAAGCTGGCCAGCGACCTCCTGGAGTGGATCCGGCGCACCATCCCCTGGCTGGAGGACCGTGTGCC 962
Query 963 CCAAAAGACTATCCAGGAGATGCAGCAGAAGCTGGAGGACTTCCGCGACTACCGGCGTGTGCACAAGCCGCCCA 1036
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Sbjct 963 CCAAAAGACTATCCAGGAGATGCAGCAGAAGCTGGAGGACTTCCGCGACTACCGGCGTGTGCACAAGCCGCCCA 1036
Query 1037 AGGTGCAGGAGAAGTGCCAGCTGGAGATCAACTTCAACACGCTGCAGACCAAGCTGCGCCTCAGCAACCGGCCC 1110
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Sbjct 1037 AGGTGCAGGAGAAGTGCCAGCTGGAGATCAACTTCAACACGCTGCAGACCAAGCTGCGCCTCAGCAACCGGCCC 1110
Query 1111 GCCTTCATGCCCTCCGAGGGCAAGATGGTCTCGGACATCAACAATGGCTGGCAGCACTTGGAGCAGGCTGAGAA 1184
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Sbjct 1111 GCCTTCATGCCCTCCGAGGGCAAGATGGTCTCGGACATCAACAATGGCTGGCAGCACTTGGAGCAGGCTGAGAA 1184
Query 1185 GGGCTACGAGGAGTGGCTGCTGAATGAGATCCGCAGGCTGGAGCGGCTCGACCACCTGGCAGAGAAGTTCCGGC 1258
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Sbjct 1185 GGGCTACGAGGAGTGGCTGCTGAATGAGATCCGCAGGCTGGAGCGGCTCGACCACCTGGCAGAGAAGTTCCGGC 1258
Query 1259 AGAAGGCCTCCATCCACGAGGCCTGGACTGACGGGAAGGAAGCCATGCTGAAGCACCGGGACTACGAGACGGCC 1332
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Sbjct 1259 AGAAGGCCTCCATCCACGAGGCCTGGACTGACGGGAAGGAAGCCATGCTGAAGCACCGGGACTACGAGACGGCC 1332
Query 1333 ACACTATCGGACATCAAAGCCCTCATTCGCAAGCACGAGGCCTTCGAGAGCGACCTGGCTGCGCACCAGGACCG 1406
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Sbjct 1333 ACACTATCGGACATCAAAGCCCTCATTCGCAAGCACGAGGCCTTCGAGAGCGACCTGGCTGCGCACCAGGACCG 1406
Query 1407 CGTGGAGCAGATCGCCGCCATTGCCCAGGAGCTCAACGAGCTGGATTACTACGACTCCCACAATGTCAACACCC 1480
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Sbjct 1407 CGTGGAGCAGATCGCCGCCATTGCCCAGGAGCTCAACGAGCTGGATTACTACGACTCCCACAATGTCAACACCC 1480
Query 1481 GGTGCCAGAAGATCTGTGACCAGTGGGACGCCCTCGGCTCTCTGACACATAGTCGCAGGGAAGCCCTGGAGAAA 1554
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Sbjct 1481 GGTGCCAGAAGATCTGTGACCAGTGGGACGCCCTCGGCTCTCTGACACATAGTCGCAGGGAAGCCCTGGAGAAA 1554
Query 1555 ACAGAGAAGCAGCTGGAGGCCATCGACCAGCTGCACCTGGAATACGCCAAGCGCGCGGCCCCCTTCAACAACTG 1628
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Sbjct 1555 ACAGAGAAGCAGCTGGAGGCCATCGACCAGCTGCACCTGGAATACGCCAAGCGCGCGGCCCCCTTCAACAACTG 1628
Query 1629 GATGGAGAGCGCCATGGAGGACCTCCAGGACATGTTCATCGTCCATACCATCGAGGAGATTGAGGGCCTGATCT 1702
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Sbjct 1629 GATGGAGAGCGCCATGGAGGACCTCCAGGACATGTTCATCGTCCATACCATCGAGGAGATTGAGGGCCTGATCT 1702
Query 1703 CAGCCCATGACCAGTTCAAGTCCACCCTGCCGGACGCCGATAGGGAGCGCGAGGCCATCCTGGCCATCCACAAG 1776
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Sbjct 1703 CAGCCCATGACCAGTTCAAGTCCACCCTGCCGGACGCCGATAGGGAGCGCGAGGCCATCCTGGCCATCCACAAG 1776
Query 1777 GAGGCCCAGAGGATCGCTGAGAGCAACCACATCAAGCTGTCGGGCAGCAACCCCTACACCACCGTCACCCCGCA 1850
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Sbjct 1777 GAGGCCCAGAGGATCGCTGAGAGCAACCACATCAAGCTGTCGGGCAGCAACCCCTACACCACCGTCACCCCGCA 1850
Query 1851 AATCATCAACTCCAAGTGGGAGAAGGTGCAGCAGCTGGTGCCAAAACGGGACCATGCCCTCCTGGAGGAGCAGA 1924
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Sbjct 1851 AATCATCAACTCCAAGTGGGAGAAGGTGCAGCAGCTGGTGCCAAAACGGGACCATGCCCTCCTGGAGGAGCAGA 1924
Query 1925 GCAAGCAGCAGTCCAACGAGCACCTGCGCCGCCAGTTCGCCAGCCAGGCCAATGTTGTGGGGCCCTGGATCCAG 1998
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Sbjct 1925 GCAAGCAGCAGTCCAACGAGCACCTGCGCCGCCAGTTCGCCAGCCAGGCCAATGTTGTGGGGCCCTGGATCCAG 1998
Query 1999 ACCAAGATGGAGGAGATCGGGCGCATCTCCATTGAGATGAACGGGACCCTGGAGGACCAGCTGAGCCACCTGAA 2072
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Sbjct 1999 ACCAAGATGGAGGAGATCGGGCGCATCTCCATTGAGATGAACGGGACCCTGGAGGACCAGCTGAGCCACCTGAA 2072
Query 2073 GCAGTATGAACGCAGCATCGTGGACTACAAGCCCAACCTGGACCTGCTGGAGCAGCAGCACCAGCTCATCCAGG 2146
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Sbjct 2073 GCAGTATGAACGCAGCATCGTGGACTACAAGCCCAACCTGGACCTGCTGGAGCAGCAGCACCAGCTCATCCAGG 2146
Query 2147 AGGCCCTCATCTTCGACAACAAGCACACCAACTATACCATGGAGCACATCCGCGTGGGCTGGGAGCAGCTGCTC 2220
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Sbjct 2147 AGGCCCTCATCTTCGACAACAAGCACACCAACTATACCATGGAGCACATCCGCGTGGGCTGGGAGCAGCTGCTC 2220
Query 2221 ACCACCATTGCCCGCACCATCAACGAGGTGGAGAACCAGATCCTCACCCGCGACGCCAAGGGCATCAGCCAGGA 2294
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Sbjct 2221 ACCACCATTGCCCGCACCATCAACGAGGTGGAGAACCAGATCCTCACCCGCGACGCCAAGGGCATCAGCCAGGA 2294
Query 2295 GCAGATGCAGGAGTTCCGGGCGTCCTTCAACCACTTCGACAAGGATCATGGCGGGGCGC-TGGGGCCCGAGGAG 2367
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Sbjct 2295 GCAGATGCAGGAGTTCCGGGCGTCCTTCAACCACTTCGACAAGAAGCA-GACAGGCAGCATGGACTCCGATGAC 2367
Query 2368 TTCAAGGC-CTGC----CTC------AT-CAGCCTGGGCTACGACGTGGAGAACGACCGGCAGGGTGAGGCCGA 2429
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Sbjct 2368 TTCAGGGCTCTGCTTATCTCCACAGGATACAGCCT---------------------------GGGTGAGGCCGA 2414
Query 2430 GTTCAACCGCATCATGAGCCTGGTCGACCCCAACCATAGCGGCCTTGTGACCTTCCAAGCCTTCATCGACTTCA 2503
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Sbjct 2415 GTTCAACCGCATCATGAGCCTGGTCGACCCCAACCATAGCGGCCTTGTGACCTTCCAAGCCTTCATCGACTTCA 2488
Query 2504 TGTCGCGGGAGACCACCGACACGGACACGGCTGACCAGGTCATCGCTTCCTTCAAGGTCTTAGCAGGGGACAAG 2577
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Sbjct 2489 TGTCGCGGGAGACCACCGACACGGACACGGCTGACCAGGTCATCGCTTCCTTCAAGGTCTTAGCAGGGGACAAG 2562
Query 2578 AACTTCATCACAGCTGAGGAGCTGCGGAGAGAGCTGCCCCCCGACCAGGCCGAGTACTGCATCGCCCGCATGGC 2651
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Sbjct 2563 AACTTCATCACAGCTGAGGAGCTGCGGAGAGAGCTGCCCCCCGACCAGGCCGAGTACTGCATCGCCCGCATGGC 2636
Query 2652 GCCATACCAGGGCCCTGACGCCGTGCCCGGTGCCCTCGACTACAAGTCCTTCTCCACGGCCTTGTATGGCGAGA 2725
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Sbjct 2637 GCCATACCAGGGCCCTGACGCCGTGCCCGGTGCCCTCGACTACAAGTCCTTCTCCACGGCCTTGTATGGCGAGA 2710
Query 2726 GCGACCTG 2733
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Sbjct 2711 GCGACCTG 2718