Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_00032
• Subject: NM_009634.6
• Aligned Length: 1456
• Identities: 1263
• Gaps: 8

Alignment

Query    1  ATGGCGGCTGGAGGCGATCATGGTTCGC----CCGACAGCTACCGCTCACCTCTTGCCTCCCGCTATGCCAGCC  70
            |||||.||....|||||.|.||    ||    |.||.||.|||||.||.||.||.||..|||||||.|||||||
Sbjct    1  ATGGCTGCATCCGGCGACCCTG----GCAGTGCTGAAAGTTACCGTTCTCCGCTGGCGGCCCGCTACGCCAGCC  70

Query   71  CGGAGATGTGCTTCGTGTTTAGCGACAGGTATAAATTCCGGACATGGCGGCAGCTGTGGCTGTGGCTGGCGGAG  144
            ..||||||||.|||.||||.|||||||||||.||.||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   71  GCGAGATGTGTTTCTTGTTCAGCGACAGGTACAAGTTCCAGACGTGGCGGCAGCTGTGGCTGTGGCTGGCGGAG  144

Query  145  GCCGAGCAGACATTGGGTTTGCCTATCACAGATGAACAAATCCAGGAGATGAAATCAAACCTGGAGAACATCGA  218
            |||||.|||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||.|.|||||.||
Sbjct  145  GCCGAACAGACGCTGGGTTTGCCTATCACAGATGAACAAATCCAGGAGATGAAGTCGAACCTGAACAACATTGA  218

Query  219  CTTCAAGATGGCAGCTGAGGAAGAGAAACGTTTACGACATGATGTGATGGCTCACGTGCACACATTTGGCCACT  292
            ||||.||||||||||||||||||||||.||..|.||.||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  219  CTTCCAGATGGCAGCTGAGGAAGAGAAGCGCCTGCGGCACGACGTGATGGCTCACGTGCACACGTTTGGCCACT  292

Query  293  GCTGTCCAAAAGCTGCAGGCATTATTCACCTTGGTGCTACTTCTTGCTATGTTGGAGACAATACTGACTTGATT  366
            |||||||.||||||||.|||||||||||.||.||.||.||.||.||||||||.|||||||||||.|||.|||||
Sbjct  293  GCTGTCCGAAAGCTGCGGGCATTATTCATCTGGGCGCCACCTCCTGCTATGTCGGAGACAATACGGACCTGATT  366

Query  367  ATTCTTAGAAATGCACTTGACCTGCTTTTGCCAAAGCTTGCCAGAGTGATCTCTCGGCTTGCCGACTTTGCTAA  440
            |||||.|||||||||.|||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||..|||||||||||||||||||
Sbjct  367  ATTCTGAGAAATGCATTTGACCTACTTTTGCCAAAGCTTGCTAGAGTGATCTCGAGGCTTGCCGACTTTGCTAA  440

Query  441  GGAACGAGCCAGTCTACCCACATTAGGTTTCACACATTTCCAGCCTGCACAGCTGACCACAGTTGGGAAACGTT  514
            |||.||.||...|||.|||||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct  441  GGATCGTGCTGATCTGCCCACGTTAGGTTTCACACACTTTCAGCCTGCTCAGCTGACCACGGTTGGGAAACGAT  514

Query  515  GCTGTCTTTGGATTCAGGATCTTTGCATGGATCTCCAGAACTTGAAGCGTGTCCGAGATGACCTGCGCTTCCGG  588
            ||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.
Sbjct  515  GCTGCCTTTGGATTCAAGATCTCTGCATGGATCTCCAGAACTTGAAGCGTGTCCGGGATGAGCTGCGCTTCCGA  588

Query  589  GGAGTAAAGGGTACCACTGGCACTCAGGCCAGTTTCCTGCAGCTCTTTGAGGGAGATGACCATAAGGTAGAGCA  662
            |||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.|||.||||.|||||.|||||
Sbjct  589  GGAGTAAAGGGCACCACTGGCACGCAGGCCAGCTTCCTGCAGCTCTTCGAGGGGGATCACCAGAAGGTGGAGCA  662

Query  663  GCTTGACAAGATGGTGACAGAAAAGGCAGGATTTAAGAGAGCTTTCATCATCACAGGGCAGACATATACACGAA  736
            |||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||.|
Sbjct  663  GCTGGACAAGATGGTGACAGAAAAGGCAGGGTTTAAAAGAGCCTTCATCATCACAGGACAGACGTACACACGGA  736

Query  737  AAGTGGATATTGAAGTACTGTCTGTGCTGGCTAGCTTGGGGGCATCAGTGCACAAGATTTGCACCGACATACGC  810
            |||||||.||.|||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  737  AAGTGGACATCGAAGTGCTGTCTGTGCTGGCCAGCTTAGGAGCATCGGTGCACAAGATTTGCACTGACATACGC  810

Query  811  CTCCTGGCAAACCTCAAGGAGATGGAGGAACCCTTTGAAAAACAGCAGATTGGCTCAAGTGCGATGCCATATAA  884
            ||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.||
Sbjct  811  CTGCTGGCAAACCTGAAGGAGATGGAGGAGCCCTTTGAGAAACAGCAGATTGGCTCCAGTGCGATGCCGTACAA  884

Query  885  GCGGAATCCCATGCGTTCAGAACGTTGCTGCAGTCTTGCCCGCCACCTGATGACCCTTGTCATGGACCCGCTAC  958
            ||||||.||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||.|||||..|||||||||.||||
Sbjct  885  GCGGAACCCCATGCGCTCCGAACGTTGCTGCAGCCTGGCCCGTCACCTGATGGCCCTTACCATGGACCCACTAC  958

Query  959  AGACAGCATCTGTCCAGTGGTTTGAACGCACACTGGATGATAGTGCCAACCGACGGATCTGTTTGGCCGAGGCA  1032
            |||||||.|||||.||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.
Sbjct  959  AGACAGCGTCTGTGCAGTGGTTTGAACGTACTCTGGATGACAGTGCCAACCGACGGATCTGTTTGGCTGAAGCG  1032

Query 1033  TTTCTTACCGCAGATACTATATTGAATACGCTGCAGAACATTTCTGAAGGATTGGTCGTGTACCCCAAAGTAAT  1106
            |||||.||.||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1033  TTTCTCACTGCAGATACTATATTAAACACCCTACAGAACATTTCTGAAGGATTGGTGGTGTACCCCAAAGTAAT  1106

Query 1107  TGAACGGCGCATTCGGCAAGAGCTGCCTTTCATGGCCACAGAGAACATCATCATGGCCATGGTCAAAGCTGGAG  1180
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.|
Sbjct 1107  TGAACGGCGCATTCGGCAAGAGCTGCCTTTCATGGCCACAGAGAACATCATCATGGCAATGGTGAAAGCCGGGG  1180

Query 1181  GTAGCCGCCAGGATTGCCATGAGAAAATCAGAGTGCTTTCTCAGCAGGCAGCTTCTGTGGTTAAGCAGGAAGGG  1254
            |.|||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||.|||||||.|||||||||||.
Sbjct 1181  GCAGCCGACAGGACTGCCATGAGAAAATTAGAGTGCTTTCCCAGCAGGCAGCTGCTGTGGTCAAGCAGGAAGGA  1254

Query 1255  GGTGACAATGACCTCATAGAGCGTATCCAGGTTGATGCCTACTTCAGTCCCATTCACTCCCAGTTGGATCATTT  1328
            ||||||||||||||.||||||||.||||.||..||||||||||||||.|||||.|||||.|||.||||.||.||
Sbjct 1255  GGTGACAATGACCTTATAGAGCGCATCCGGGCAGATGCCTACTTCAGCCCCATCCACTCACAGCTGGAGCACTT  1328

Query 1329  ACTGGATCCTTCTTCTTTCACTGGTCGTGCCTCCCAGCAGGTGCAGAGATTCTTAGAAGAGGAGGTGTATCCCC  1402
            .|||||.||.||||||||||||||.||.||..||||||||||.||.||||||.|.||||||||.|||...||||
Sbjct 1329  GCTGGACCCCTCTTCTTTCACTGGCCGAGCACCCCAGCAGGTCCACAGATTCCTGGAAGAGGAAGTGCGCCCCC  1402

Query 1403  TGTTAAAACCATATGAAAGCGTGATGAAGGTGAAAGCAGAATTATGTCTG  1452
            ||.||||.||.||||..|..|.||||..||||||||||||..|.||||||
Sbjct 1403  TGCTAAAGCCCTATGGGAATGAGATGGCGGTGAAAGCAGAGCTGTGTCTG  1452