Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_00050
- Subject:
- NM_001030010.3
- Aligned Length:
- 1404
- Identities:
- 1293
- Gaps:
- 111
Alignment
Query 1 ATGGACCCCCTTGGGGACACGCTGCGGCGACTGCGGGAGGCCTTCCACGCGGGGCGCACGCGGCCAGCTGAGTT 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGACCCCCTTGGGGACACGCTGCGGCGACTGCGGGAGGCCTTCCACGCGGGGCGCACGCGGCCAGCTGAGTT 74
Query 75 CCGGGCTGCGCAGCTCCAAGGCCTGGGCCGCTTCCTGCAAGAAAACAAGCAGCTTCTGCACGACGCACTGGCCC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CCGGGCTGCGCAGCTCCAAGGCCTGGGCCGCTTCCTGCAAGAAAACAAGCAGCTTCTGCACGACGCACTGGCCC 148
Query 149 AGGACCTGCACAAGTCAGCCTTCGAGTCGGAGGTGTCTGAGGTTGCCATCAGCCAGGGCGAGGTCACCCTGGCC 222
|||||||||||||
Sbjct 149 AGGACCTGCACAA------------------------------------------------------------- 161
Query 223 CTCAGGAACCTCCGGGCCTGGATGAAGGACGAGCGTGTGCCCAAGAACCTGGCCACGCAGCTGGACTCCGCCTT 296
||||||||||||||||||||||||
Sbjct 162 --------------------------------------------------GGCCACGCAGCTGGACTCCGCCTT 185
Query 297 CATCCGGAAGGAGCCCTTTGGCCTGGTCCTCATCATTGCGCCCTGGAACTATCCGCTGAACCTGACGCTGGTGC 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 186 CATCCGGAAGGAGCCCTTTGGCCTGGTCCTCATCATTGCGCCCTGGAACTATCCGCTGAACCTGACGCTGGTGC 259
Query 371 CCCTCGTGGGAGCCCTCGCTGCAGGGAACTGTGTGGTGCTGAAGCCATCGGAGATTAGCAAGAACGTCGAGAAG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 260 CCCTCGTGGGAGCCCTCGCTGCAGGGAACTGTGTGGTGCTGAAGCCATCGGAGATTAGCAAGAACGTCGAGAAG 333
Query 445 ATCCTGGCCGAGGTGCTGCCCCAATACGTGGACCAGAGCTGCTTTGCTGTGGTGCTGGGCGGGCCCCAGGAGAC 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 334 ATCCTGGCCGAGGTGCTGCCCCAATACGTGGACCAGAGCTGCTTTGCTGTGGTGCTGGGCGGGCCCCAGGAGAC 407
Query 519 GGGGCAGCTGCTAGAGCACAGGTTCGACTACATCTTCTTCACAGGGAGCCCTCGTGTGGGCAAGATTGTTATGA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 408 GGGGCAGCTGCTAGAGCACAGGTTCGACTACATCTTCTTCACAGGGAGCCCTCGTGTGGGCAAGATTGTTATGA 481
Query 593 CTGCTGCCGCCAAGCACCTGACACCTGTCACCCTGGAGCTGGGGGGCAAGAACCCTTGCTACGTGGACGACAAC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 482 CTGCTGCCGCCAAGCACCTGACACCTGTCACCCTGGAGCTGGGGGGCAAGAACCCTTGCTACGTGGACGACAAC 555
Query 667 TGCGACCCCCAGACCGTGGCCAACCGCGTGGCCTGGTTCCGCTACTTCAACGCCGGCCAGACCTGCGTGGCCCC 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 556 TGCGACCCCCAGACCGTGGCCAACCGCGTGGCCTGGTTCCGCTACTTCAACGCCGGCCAGACCTGCGTGGCCCC 629
Query 741 CGACTACGTCCTATGCAGCCCTGAGATGCAGGAGAGGCTGCTGCCTGCCCTGCAGAGCACCATCACCCGTTTCT 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 630 CGACTACGTCCTATGCAGCCCTGAGATGCAGGAGAGGCTGCTGCCTGCCCTGCAGAGCACCATCACCCGTTTCT 703
Query 815 ATGGCGACGACCCCCAGAGCTCCCCAAACCTGGGCCGCATCATCAACCAGAAACAGTTCCAGCGGCTGCGGGCA 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 704 ATGGCGACGACCCCCAGAGCTCCCCAAACCTGGGCCGCATCATCAACCAGAAACAGTTCCAGCGGCTGCGGGCA 777
Query 889 TTGCTGGGCTGCGGCCGTGTGGCCATTGGGGGCCAGAGCGATGAGAGCGATCGCTACATCGCCCCCACGGTGCT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 778 TTGCTGGGCTGCGGCCGTGTGGCCATTGGGGGCCAGAGCGATGAGAGCGATCGCTACATCGCCCCCACGGTGCT 851
Query 963 GGTGGATGTGCAGGAGATGGAGCCTGTGATGCAGGAGGAGATCTTCGGGCCCATCCTGCCCATCGTGAACGTGC 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 852 GGTGGATGTGCAGGAGATGGAGCCTGTGATGCAGGAGGAGATCTTCGGGCCCATCCTGCCCATCGTGAACGTGC 925
Query 1037 AGAGCTTGGACGAGGCCATCGAGTTCATCAACCGGCGGGAGAAGCCCCTGGCCCTGTACGCCTTCTCCAACAGC 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 926 AGAGCTTGGACGAGGCCATCGAGTTCATCAACCGGCGGGAGAAGCCCCTGGCCCTGTACGCCTTCTCCAACAGC 999
Query 1111 AGCCAGGTGGTCAAGCGGGTGCTGACCCAGACCAGCAGCGGGGGCTTCTGTGGGAACGACGGCTTCATGCACAT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1000 AGCCAGGTGGTCAAGCGGGTGCTGACCCAGACCAGCAGCGGGGGCTTCTGTGGGAACGACGGCTTCATGCACAT 1073
Query 1185 GACCCTGGCCAGCCTGCCTTTTGGAGGAGTGGGTGCCAGTGGGATGGGCCGGTACCATGGCAAGTTCTCCTTCG 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1074 GACCCTGGCCAGCCTGCCTTTTGGAGGAGTGGGTGCCAGTGGGATGGGCCGGTACCATGGCAAGTTCTCCTTCG 1147
Query 1259 ACACCTTCTCCCACCATCGCGCCTGCCTCCTGCGCAGCCCGGGGATGGAGAAGCTCAACGCCCTCCGCTACCCG 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1148 ACACCTTCTCCCACCATCGCGCCTGCCTCCTGCGCAGCCCGGGGATGGAGAAGCTCAACGCCCTCCGCTACCCG 1221
Query 1333 CCGCAATCGCCGCGCCGCCTGAGGATGCTGCTGGTGGCCATGGAGGCCCAAGGCTGCAGCTGCACACTGCTC 1404
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1222 CCGCAATCGCCGCGCCGCCTGAGGATGCTGCTGGTGGCCATGGAGGCCCAAGGCTGCAGCTGCACACTGCTC 1293