Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_00057
• Subject: NM_001139.3
• Aligned Length: 2103
• Identities: 2103
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGCCACCTACAAAGTCAGGGTGGCCACAGGCACCGACCTCTTGTCGGGAACACGGGACTCCATCTCACTGAC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCCACCTACAAAGTCAGGGTGGCCACAGGCACCGACCTCTTGTCGGGAACACGGGACTCCATCTCACTGAC  74

Query   75  CATTGTGGGGACACAAGGAGAGAGCCATAAGCAGCTGCTGAACCACTTTGGGAGAGACTTTGCAACTGGGGCGG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CATTGTGGGGACACAAGGAGAGAGCCATAAGCAGCTGCTGAACCACTTTGGGAGAGACTTTGCAACTGGGGCGG  148

Query  149  TGGGCCAGTACACCGTGCAGTGCCCTCAGGACCTGGGTGAGCTCATCATCATCCGCCTGCACAAAGAGCGGTAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGGGCCAGTACACCGTGCAGTGCCCTCAGGACCTGGGTGAGCTCATCATCATCCGCCTGCACAAAGAGCGGTAC  222

Query  223  GCCTTCTTCCCCAAGGACCCTTGGTACTGCAACTATGTGCAGATCTGTGCCCCCAACGGCCGTATCTACCACTT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GCCTTCTTCCCCAAGGACCCTTGGTACTGCAACTATGTGCAGATCTGTGCCCCCAACGGCCGTATCTACCACTT  296

Query  297  CCCCGCCTACCAGTGGATGGATGGCTACGAGACCCTGGCACTCCGGGAGGCCACAGGAAAGACAACAGCAGATG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCCCGCCTACCAGTGGATGGATGGCTACGAGACCCTGGCACTCCGGGAGGCCACAGGAAAGACAACAGCAGATG  370

Query  371  ACTCGCTCCCCGTCCTCCTGGAGCACAGAAAAGAGGAGATCAGAGCCAAGCAGGACTTCTACCACTGGCGAGTC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ACTCGCTCCCCGTCCTCCTGGAGCACAGAAAAGAGGAGATCAGAGCCAAGCAGGACTTCTACCACTGGCGAGTC  444

Query  445  TTTCTTCCTGGCCTGCCCAGCTATGTGCACATTCCCAGTTACCGCCCTCCGGTGCGGAGGCATCGCAACCCCAA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TTTCTTCCTGGCCTGCCCAGCTATGTGCACATTCCCAGTTACCGCCCTCCGGTGCGGAGGCATCGCAACCCCAA  518

Query  519  CCGGCCTGAGTGGAATGGCTATATTCCGGGATTCCCAATTCTCATCAACTTTAAGGCCACCAAGTTCCTGAACT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CCGGCCTGAGTGGAATGGCTATATTCCGGGATTCCCAATTCTCATCAACTTTAAGGCCACCAAGTTCCTGAACT  592

Query  593  TAAATCTCCGCTACTCCTTCCTCAAGACGGCCTCCTTCTTCGTCCGCCTGGGGCCCATGGCACTGGCTTTCAAA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TAAATCTCCGCTACTCCTTCCTCAAGACGGCCTCCTTCTTCGTCCGCCTGGGGCCCATGGCACTGGCTTTCAAA  666

Query  667  GTCCGCGGCCTGTTGGACTGCAAACATTCGTGGAAGAGGCTGAAGGACATTAGGAAAATTTTCCCTGGCAAGAA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GTCCGCGGCCTGTTGGACTGCAAACATTCGTGGAAGAGGCTGAAGGACATTAGGAAAATTTTCCCTGGCAAGAA  740

Query  741  ATCTGTCGTCTCCGAGTACGTGGCCGAGCACTGGGCAGAGGACACCTTCTTTGGGTACCAGTACCTCAACGGCG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  ATCTGTCGTCTCCGAGTACGTGGCCGAGCACTGGGCAGAGGACACCTTCTTTGGGTACCAGTACCTCAACGGCG  814

Query  815  TCAACCCCGGCCTGATCCGCCGCTGCACGCGGATCCCAGACAAGTTCCCCGTCACAGACGACATGGTGGCTCCG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TCAACCCCGGCCTGATCCGCCGCTGCACGCGGATCCCAGACAAGTTCCCCGTCACAGACGACATGGTGGCTCCG  888

Query  889  TTCCTGGGCGAGGGAACGTGCTTGCAAGCGGAGCTGGAGAAGGGGAACATTTACCTGGCCGACTACCGCATCAT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TTCCTGGGCGAGGGAACGTGCTTGCAAGCGGAGCTGGAGAAGGGGAACATTTACCTGGCCGACTACCGCATCAT  962

Query  963  GGAGGGCATCCCCACCGTGGAGCTCAGCGGCCGGAAGCAGCACCACTGCGCCCCCCTCTGCCTGCTGCACTTTG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GGAGGGCATCCCCACCGTGGAGCTCAGCGGCCGGAAGCAGCACCACTGCGCCCCCCTCTGCCTGCTGCACTTTG  1036

Query 1037  GACCCGAGGGCAAGATGATGCCCATCGCCATCCAGCTCAGCCAGACCCCTGGGCCAGATTGCCCCATCTTCCTG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GACCCGAGGGCAAGATGATGCCCATCGCCATCCAGCTCAGCCAGACCCCTGGGCCAGATTGCCCCATCTTCCTG  1110

Query 1111  CCCAGTGATTCTGAGTGGGACTGGCTGCTAGCCAAGACGTGGGTACGCTATGCGGAGTTCTACAGCCACGAGGC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CCCAGTGATTCTGAGTGGGACTGGCTGCTAGCCAAGACGTGGGTACGCTATGCGGAGTTCTACAGCCACGAGGC  1184

Query 1185  CATCGCCCACCTGCTGGAGACACACCTCATTGCTGAGGCCTTCTGCCTGGCCTTGCTGAGGAACCTGCCCATGT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CATCGCCCACCTGCTGGAGACACACCTCATTGCTGAGGCCTTCTGCCTGGCCTTGCTGAGGAACCTGCCCATGT  1258

Query 1259  GCCACCCCCTCTACAAGCTCCTCATCCCCCATACCCGATACACCGTCCAGATCAACAGCATTGGCCGGGCCGTT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GCCACCCCCTCTACAAGCTCCTCATCCCCCATACCCGATACACCGTCCAGATCAACAGCATTGGCCGGGCCGTT  1332

Query 1333  CTCCTCAATGAGGGGGGGCTCTCTGCCAAGGGCATGTCCCTGGGCGTGGAAGGCTTTGCTGGGGTGATGGTACG  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CTCCTCAATGAGGGGGGGCTCTCTGCCAAGGGCATGTCCCTGGGCGTGGAAGGCTTTGCTGGGGTGATGGTACG  1406

Query 1407  GGCTCTGTCGGAGCTCACCTATGACAGCCTCTACCTCCCCAATGACTTTGTGGAGCGTGGGGTCCAGGACCTGC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GGCTCTGTCGGAGCTCACCTATGACAGCCTCTACCTCCCCAATGACTTTGTGGAGCGTGGGGTCCAGGACCTGC  1480

Query 1481  CTGGATATTACTACCGCGATGACAGCTTGGCGGTGTGGAATGCACTGGAGAAGTATGTGACGGAGATCATCACC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CTGGATATTACTACCGCGATGACAGCTTGGCGGTGTGGAATGCACTGGAGAAGTATGTGACGGAGATCATCACC  1554

Query 1555  TATTATTACCCGAGTGACGCAGCCGTGGAGGGTGATCCGGAATTGCAGTCTTGGGTGCAGGAAATATTTAAAGA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  TATTATTACCCGAGTGACGCAGCCGTGGAGGGTGATCCGGAATTGCAGTCTTGGGTGCAGGAAATATTTAAAGA  1628

Query 1629  GTGCCTCCTGGGGCGGGAGAGCTCAGGCTTCCCTAGGTGCTTGCGAACCGTGCCTGAGCTGATCCGATATGTCA  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GTGCCTCCTGGGGCGGGAGAGCTCAGGCTTCCCTAGGTGCTTGCGAACCGTGCCTGAGCTGATCCGATATGTCA  1702

Query 1703  CTATAGTCATCTACACCTGCTCTGCCAAGCACGCTGCTGTCAACACAGGCCAGATGGAGTTCACCGCCTGGATG  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CTATAGTCATCTACACCTGCTCTGCCAAGCACGCTGCTGTCAACACAGGCCAGATGGAGTTCACCGCCTGGATG  1776

Query 1777  CCCAACTTCCCAGCGTCCATGCGGAATCCACCGATTCAGACTAAGGGGCTGACCACTCTGGAGACCTTCATGGA  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  CCCAACTTCCCAGCGTCCATGCGGAATCCACCGATTCAGACTAAGGGGCTGACCACTCTGGAGACCTTCATGGA  1850

Query 1851  CACGTTGCCGGATGTGAAGACCACGTGCATCACGCTGCTGGTGCTCTGGACCCTCAGCCGAGAGCCTGACGACA  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  CACGTTGCCGGATGTGAAGACCACGTGCATCACGCTGCTGGTGCTCTGGACCCTCAGCCGAGAGCCTGACGACA  1924

Query 1925  GGCGGCCCCTGGGACACTTCCCGGACATTCACTTCGTGGAGGAGGCCCCGCGGAGGAGCATAGAGGCGTTCCGC  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  GGCGGCCCCTGGGACACTTCCCGGACATTCACTTCGTGGAGGAGGCCCCGCGGAGGAGCATAGAGGCGTTCCGC  1998

Query 1999  CAGCGCCTGAACCAGATCTCACACGACATCCGCCAGCGCAACAAGTGCCTTCCCATCCCCTACTACTACCTGGA  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  CAGCGCCTGAACCAGATCTCACACGACATCCGCCAGCGCAACAAGTGCCTTCCCATCCCCTACTACTACCTGGA  2072

Query 2073  CCCGGTGCTGATTGAGAACAGCATTTCTATT  2103
            |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  CCCGGTGCTGATTGAGAACAGCATTTCTATT  2103