Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_00057
• Subject: NM_009659.2
• Aligned Length: 2115
• Identities: 1774
• Gaps: 24

Alignment

Query    1  ATGGCCACCTACAAAGTCAGGGTGGCCACAGGCACCGACCTCTTGTCGGGAACACGGGACTCCATCTCACTGAC  74
            |||||||||||.|||||||.|||||||||.|||||.|||.||||.|||||.||.|.|||.||.||.||||||||
Sbjct    1  ATGGCCACCTATAAAGTCAAGGTGGCCACGGGCACTGACTTCTTTTCGGGGACGCTGGATTCAATTTCACTGAC  74

Query   75  CATTGTGGGGACACAAGGAGAGAGCCATAAGCAGCTGCTGAACCACTTTGGGAGAGACTTTGCAACTGGGGCGG  148
            |||.||||||||.||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct   75  CATCGTGGGGACCCAAGGAGAGAGCCATAAGCAGCGGTTGAACCACTTTGGGAGAGACTTTGCCACGGGGGCGG  148

Query  149  TGGGCCAGTACACCGTGCAGTGCCCTCAGGACCTGGGTGAGCTCATCATCATCCGCCTGCACAAAGAGCGGTAC  222
            |||...|.|||||.||.|||||||..|||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||||    |
Sbjct  149  TGGATGACTACACGGTACAGTGCCAGCAGGACCTGGGGGAGCTTATCATCATCCGTCTGCACAAGGAGC----C  218

Query  223  GCCTT-CTTCC---CCAAGGACCCTTGGTACTGCAACTATGTGCAGATCTGTGCCCCCAACGGCCGTATCTACC  292
            .|.|| |||||   ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||.||.|||||.||||||
Sbjct  219  TCATTCCTTCCTAGCCAAGGACCCCTGGTACTGCAACTATGTGCAGATCTGTGCTCCCGACTGCCGTGTCTACC  292

Query  293  ACTTCCCCGCCTACCAGTGGATGGATGGCTACGAGACCCTGGCACTCCGGGAGGCCACAGGAAAGACAACAGCA  366
            |||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  293  ACTTCCCAGCTTACCAGTGGATGGATGGCTATGAGACCCTGGCACTCCGGGAGGCCACAGGAAAGATAACAGCA  366

Query  367  GATGACTCGCTCCCCGTCCTCCTGGAGCACAGAAAAGAGGAGATCAGAGCCAAGCAGGACTTCTACCACTGGCG  440
            ||.|||.|.|||||..||||..||||.||||||.||||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct  367  GACGACACACTCCCTATCCTTTTGGAACACAGACAAGAAGAGATCAGAGCCAAGAAGGACTTCTACCACTGGAG  440

Query  441  AGTCTTTCTTCCTGGCCTGCCCAGCTATGTGCACATTCCCAGTTACCGCCCTC--------CGGTGCGGAGGCA  506
            .||||||.||||||||||.||||.|||||||.|.||.||||||||||..||||        ||||||       
Sbjct  441  GGTCTTTGTTCCTGGCCTTCCCAACTATGTGGATATCCCCAGTTACCATCCTCCTCCCCGACGGTGC-------  507

Query  507  TCGCAACCCCAACCGGCCTGAGTGGAATGGCTATATTCCGGGATTCCCAATTCTCATCAACTTTAAGGCCACCA  580
             |||||.||||||||||||||||||.||||.||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||.||||
Sbjct  508  -CGCAATCCCAACCGGCCTGAGTGGGATGGTTATATTCCCGGATTCCCAATTCTCATCAACATTAAGGCTACCA  580

Query  581  AGTTCCTGAACTTAAATCTCCGCTACTCCTTCCTCAAGACGGCCTCCTTCTTCGTCCGCCTGGGGCCCATGGCA  654
            .||||.|.||||.||||||.||.|.|||||||.|||||||.||||||||||||..||||||.|||||||||||.
Sbjct  581  GGTTCTTAAACTCAAATCTTCGTTTCTCCTTCGTCAAGACAGCCTCCTTCTTCTACCGCCTAGGGCCCATGGCG  654

Query  655  CTGGCTTTCAAAGTCCGCGGCCTGTTGGACTGCAAACATTCGTGGAAGAGGCTGAAGGACATTAGGAAAATTTT  728
            |||||.||||||.|.||.||||||.||||..|.||||..||.||||||||.||.||||||||||.|||.|||||
Sbjct  655  CTGGCCTTCAAACTGCGTGGCCTGGTGGATCGAAAACGCTCCTGGAAGAGACTAAAGGACATTAAGAATATTTT  728

Query  729  CCCTGGCAAGAAATCTGTCGTCTCCGAGTACGTGGCCGAGCACTGGGCAGAGGACACCTTCTTTGGGTACCAGT  802
            |||||..|..||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  729  CCCTGCTACCAAGTCTGTCGTCTCAGAGTATGTGGCCGAGCACTGGACAGAGGACAGCTTCTTTGGGTACCAGT  802

Query  803  ACCTCAACGGCGTCAACCCCGGCCTGATCCGCCGCTGCACGCGGATCCCAGACAAGTTCCCCGTCACAGACGAC  876
            ||||.||.||..|.|||||.|||||||||||..|.||.||.|.||||||||||||.|||||.||||||||.||.
Sbjct  803  ACCTTAATGGTATTAACCCAGGCCTGATCCGAAGATGTACACAGATCCCAGACAAATTCCCAGTCACAGATGAA  876

Query  877  ATGGTGGCTCCGTTCCTGGGCGAGGGAACGTGCTTGCAAGCGGAGCTGGAGAAGGGGAACATTTACCTGGCCGA  950
            ||||||||.||.||||||||.||.|||||.|||.|||||||.||||||||||.||||||.|||||||||||.||
Sbjct  877  ATGGTGGCCCCATTCCTGGGTGAAGGAACATGCCTGCAAGCAGAGCTGGAGAGGGGGAATATTTACCTGGCAGA  950

Query  951  CTACCGCATCATGGAGGGCATCCCCACCGTGGAGCTCAGCGGCCGGAAGCAGCACCACTGCGCCCCCCTCTGCC  1024
            ||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||..||.|.|.|||||||.|||||.|||||..|.|||.
Sbjct  951  CTACCGCATCCTGGATGGCATCCCCACCGTGGAGCTCAATGGTCAGCAGCAGCATCACTGTGCCCCGATGTGCT  1024

Query 1025  TGCTGCACTTTGGACCCGAGGGCAAGATGATGCCCATCGCCATCCAGCTCAGCCAGACCCCTGGGCCAGATTGC  1098
            |||||||||||||.||.||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||.
Sbjct 1025  TGCTGCACTTTGGTCCTGATGGCAACATGATGCCCATCGCCATTCAGCTCAGTCAGACTCCTGGGCCTGATTGT  1098

Query 1099  CCCATCTTCCTGCCCAGTGATTCTGAGTGGGACTGGCTGCTAGCCAAGACGTGGGTACGCTATGCGGAGTTCTA  1172
            ||.|||||||||||.|.||||||||||||||||||||||.|.||.||.||||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct 1099  CCTATCTTCCTGCCGAATGATTCTGAGTGGGACTGGCTGTTGGCTAAAACGTGGGTGCGCTACGCGGAGTTCTA  1172

Query 1173  CAGCCACGAGGCCATCGCCCACCTGCTGGAGACACACCTCATTGCTGAGGCCTTCTGCCTGGCCTTGCTGAGGA  1246
            |||||||||||||.|.||.|||.|||||||||..||||||||.|..||.||.||||||.|||||.|.|||||||
Sbjct 1173  CAGCCACGAGGCCGTGGCACACTTGCTGGAGAGCCACCTCATCGGGGAAGCTTTCTGCTTGGCCCTCCTGAGGA  1246

Query 1247  ACCTGCCCATGTGCCACCCCCTCTACAAGCTCCTCATCCCCCATACCCGATACACCGTCCAGATCAACAGCATT  1320
            ||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||.||.||.||||.||||||||||||.||||||
Sbjct 1247  ACCTGCCCATGTGCCACCCCCTGTATAAGCTTCTCATCCCTCACACTCGGTACAACGTCCAGATCAATAGCATT  1320

Query 1321  GGCCGGGCCGTTCTCCTCAATGAGGGGGGGCTCTCTGCCAAGGGCATGTCCCTGGGCGTGGAAGGCTTTGCTGG  1394
            ||.||||||.|.||.|||||..||||.||.||||||||||.||.|||||||||||||.|.||.|||||.||...
Sbjct 1321  GGGCGGGCCCTCCTTCTCAACAAGGGAGGTCTCTCTGCCAGGGCCATGTCCCTGGGCCTAGAGGGCTTCGCACA  1394

Query 1395  GGTGATGGTACGGGCTCTGTCGGAGCTCACCTATGACAGCCTCTACCTCCCCAATGACTTTGTGGAGCGTGGGG  1468
            |||||||||.||||.||||||.|||||||||||..|.|||||||.|.|.|||||.||||||||||||||.||||
Sbjct 1395  GGTGATGGTTCGGGGTCTGTCTGAGCTCACCTACAAAAGCCTCTGCATTCCCAACGACTTTGTGGAGCGCGGGG  1468

Query 1469  TCCAGGACCTGCCTGGATATTACTACCGCGATGACAGCTTGGCGGTGTGGAATGCACTGGAGAAGTATGTGACG  1542
            ||||||||||||||||.|||||.|.|||.|||||||||.|||||||||||.|.||..||||||.|||.|||||.
Sbjct 1469  TCCAGGACCTGCCTGGGTATTATTTCCGTGATGACAGCCTGGCGGTGTGGTACGCGATGGAGAGGTACGTGACA  1542

Query 1543  GAGATCATCACCTATTATTACCCGAGTGACGCAGCCGTGGAGGGTGATCCGGAATTGCAGTCTTGGGTGCAGGA  1616
            |||||||||||.|||||||||||.|.||||||||||||.|||||.||.||||||.||||||..|||||.|||||
Sbjct 1543  GAGATCATCACTTATTATTACCCAAATGACGCAGCCGTAGAGGGCGACCCGGAACTGCAGTGCTGGGTACAGGA  1616

Query 1617  AATATTTAAAGAGTGCCTCCTGGGGCGGGAGAGCTCAGGCTTCCCTAGGTGCTTGCGAACCGTGCCTGAGCTGA  1690
            .|||||.||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|..|||||||||||..|.||||||||||
Sbjct 1617  GATATTCAAGGAGTGTCTCCTGGGGCGTGAGAGCTCAGGCTTCCCCACCTGCTTGCGAACTATACCTGAGCTGA  1690

Query 1691  TCCGATATGTCACTATAGTCATCTACACCTGCTCTGCCAAGCACGCTGCTGTCAACACAGGCCAGATGGAGTTC  1764
            ||..|||.|||||.||.|||||.|||||||||||.||||.|||.||.|||||||||.||||||||.||||||.|
Sbjct 1691  TCGAATACGTCACAATGGTCATGTACACCTGCTCGGCCAGGCATGCAGCTGTCAACTCAGGCCAGCTGGAGTAC  1764

Query 1765  ACCGCCTGGATGCCCAACTTCCCAGCGTCCATGCGGAATCCACCGATTCAGACTAAGGGGCTGACCACTCTGGA  1838
            |||.|.||||||||||||||||||.|.||||||.||||.||||||||.|||||.||||||||.||.||||||.|
Sbjct 1765  ACCTCTTGGATGCCCAACTTCCCATCATCCATGAGGAACCCACCGATGCAGACCAAGGGGCTAACTACTCTGCA  1838

Query 1839  GACCTTCATGGACACGTTGCCGGATGTGAAGACCACGTGCATCACGCTGCTGGTGCTCTGGACCCTCAGCCGAG  1912
            |||.|.|||||||||..|.|||||.|||||||||||.|||||...|||..|||||||||||||.|||.|.||.|
Sbjct 1839  GACATACATGGACACTCTTCCGGACGTGAAGACCACATGCATTGTGCTCTTGGTGCTCTGGACTCTCTGTCGGG  1912

Query 1913  AGCCTGACGACAGGCGGCCCCTGGGACACTTCCCGGACATTCACTTCGTGGAGGAGGCCCCGCGGAGGAGCATA  1986
            |||||||.|||||||||||.||.||.||||||||.|||||.||.||.||||||||||..||.||||||||.||.
Sbjct 1913  AGCCTGATGACAGGCGGCCGCTTGGCCACTTCCCAGACATCCATTTTGTGGAGGAGGGTCCTCGGAGGAGTATT  1986

Query 1987  GAGGCGTTCCGCCAGCGCCTGAACCAGATCTCACACGACATCCGCCAGCGCAACAAGTGCCTTCCCATCCCCTA  2060
            |||||.||.||.|||..|||.|||||||||||.|||.|||||||.||||||||.||||||||..||.||||.||
Sbjct 1987  GAGGCTTTTCGTCAGAACCTCAACCAGATCTCTCACAACATCCGACAGCGCAATAAGTGCCTCACCCTCCCGTA  2060

Query 2061  CTACTACCTGGACCCGGTGCTGATTGAGAACAGCATTTCTATT  2103
            |||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.
Sbjct 2061  CTACTACCTGGACCCAGTGCTGATTGAGAACAGTATTTCCATC  2103