Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_00073
• Subject: NM_001278409.2
• Aligned Length: 1515
• Identities: 1416
• Gaps: 99

Alignment

Query    1  ATGAGCTACCCTGGCTATCCCCCGCCCCCAGGTGGCTACCCACCAGCTGCACCAGGTGGTGGTCCCTGGGGAGG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  TGCTGCCTACCCTCCTCCGCCCAGCATGCCCCCCATCGGGCTGGATAACGTGGCCACCTATGCGGGGCAGTTCA  148
                                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  -------------------------ATGCCCCCCATCGGGCTGGATAACGTGGCCACCTATGCGGGGCAGTTCA  49

Query  149  ACCAGGACTATCTCTCGGGAATGGCGGCCAACATGTCTGGGACATTTGGAGGAGCCAACATGCCCAACCTGTAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   50  ACCAGGACTATCTCTCGGGAATGGCGGCCAACATGTCTGGGACATTTGGAGGAGCCAACATGCCCAACCTGTAC  123

Query  223  CCTGGGGCCCCTGGGGCTGGCTACCCACCAGTGCCCCCTGGCGGCTTTGGGCAGCCCCCCTCTGCCCAGCAGCC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  124  CCTGGGGCCCCTGGGGCTGGCTACCCACCAGTGCCCCCTGGCGGCTTTGGGCAGCCCCCCTCTGCCCAGCAGCC  197

Query  297  TGTTCCTCCCTATGGGATGTATCCACCCCCAGGAGGAAACCCACCCTCCAGGATGCCCTCATATCCGCCATACC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  198  TGTTCCTCCCTATGGGATGTATCCACCCCCAGGAGGAAACCCACCCTCCAGGATGCCCTCATATCCGCCATACC  271

Query  371  CAGGGGCCCCTGTGCCGGGCCAGCCCATGCCACCCCCCGGACAGCAGCCCCCAGGGGCCTACCCTGGGCAGCCA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  272  CAGGGGCCCCTGTGCCGGGCCAGCCCATGCCACCCCCCGGACAGCAGCCCCCAGGGGCCTACCCTGGGCAGCCA  345

Query  445  CCAGTGACCTACCCTGGTCAGCCTCCAGTGCCACTCCCTGGGCAGCAGCAGCCAGTGCCGAGCTACCCAGGATA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  346  CCAGTGACCTACCCTGGTCAGCCTCCAGTGCCACTCCCTGGGCAGCAGCAGCCAGTGCCGAGCTACCCAGGATA  419

Query  519  CCCGGGGTCTGGGACTGTCACCCCCGCTGTGCCCCCAACCCAGTTTGGAAGCCGAGGCACCATCACTGATGCTC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  420  CCCGGGGTCTGGGACTGTCACCCCCGCTGTGCCCCCAACCCAGTTTGGAAGCCGAGGCACCATCACTGATGCTC  493

Query  593  CCGGCTTTGACCCCCTGCGAGATGCCGAGGTCCTGCGGAAGGCCATGAAAGGCTTCGGGACGGATGAGCAGGCC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  494  CCGGCTTTGACCCCCTGCGAGATGCCGAGGTCCTGCGGAAGGCCATGAAAGGCTTCGGGACGGATGAGCAGGCC  567

Query  667  ATCATTGACTGCCTGGGGAGTCGCTCCAACAAGCAGCGGCAGCAGATCCTACTTTCCTTCAAGACGGCTTACGG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  568  ATCATTGACTGCCTGGGGAGTCGCTCCAACAAGCAGCGGCAGCAGATCCTACTTTCCTTCAAGACGGCTTACGG  641

Query  741  CAAGGATTTGATCAAAGATCTGAAATCTGAACTGTCAGGAAACTTTGAGAAGACAATCTTGGCTCTGATGAAGA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  642  CAAGGATTTGATCAAAGATCTGAAATCTGAACTGTCAGGAAACTTTGAGAAGACAATCTTGGCTCTGATGAAGA  715

Query  815  CCCCAGTCCTCTTTGACATTTATGAGATAAAGGAAGCCATCAAGGGGGTTGGCACTGATGAAGCCTGCCTGATT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  716  CCCCAGTCCTCTTTGACATTTATGAGATAAAGGAAGCCATCAAGGGGGTTGGCACTGATGAAGCCTGCCTGATT  789

Query  889  GAGATCCTCGCTTCCCGCAGCAATGAGCACATCCGAGAATTAAACAGAGCCTACAAAGCAGAATTCAAAAAGAC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  790  GAGATCCTCGCTTCCCGCAGCAATGAGCACATCCGAGAATTAAACAGAGCCTACAAAGCAGAATTCAAAAAGAC  863

Query  963  CCTGGAAGAGGCCATTCGAAGCGACACATCAGGGCACTTCCAGCGGCTCCTCATCTCTCTCTCTCAGGGAAACC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  864  CCTGGAAGAGGCCATTCGAAGCGACACATCAGGGCACTTCCAGCGGCTCCTCATCTCTCTCTCTCAGGGAAACC  937

Query 1037  GTGATGAAAGCACAAACGTGGACATGTCACTCGCCCAGAGAGATGCCCAGGAGCTGTATGCGGCCGGGGAGAAC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  938  GTGATGAAAGCACAAACGTGGACATGTCACTCGCCCAGAGAGATGCCCAGGAGCTGTATGCGGCCGGGGAGAAC  1011

Query 1111  CGCCTGGGAACAGACGAGTCCAAGTTCAATGCGGTTCTGTGCTCCCGGAGCCGGGCCCACCTGGTAGCAGTTTT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1012  CGCCTGGGAACAGACGAGTCCAAGTTCAATGCGGTTCTGTGCTCCCGGAGCCGGGCCCACCTGGTAGCAGTTTT  1085

Query 1185  CAATGAGTACCAGAGAATGACAGGCCGGGACATTGAGAAGAGCATCTGCCGGGAGATGTCCGGGGACCTGGAGG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1086  CAATGAGTACCAGAGAATGACAGGCCGGGACATTGAGAAGAGCATCTGCCGGGAGATGTCCGGGGACCTGGAGG  1159

Query 1259  AGGGCATGCTGGCCGTGGTGAAATGTCTCAAGAATACCCCAGCCTTCTTTGCGGAGAGGCTCAACAAGGCCATG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1160  AGGGCATGCTGGCCGTGGTGAAATGTCTCAAGAATACCCCAGCCTTCTTTGCGGAGAGGCTCAACAAGGCCATG  1233

Query 1333  AGGGGGGCAGGAACAAAGGACCGGACCCTGATTCGCATCATGGTGTCTCGCAGCGAGACCGACCTCCTGGACAT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1234  AGGGGGGCAGGAACAAAGGACCGGACCCTGATTCGCATCATGGTGTCTCGCAGCGAGACCGACCTCCTGGACAT  1307

Query 1407  CAGATCAGAGTATAAGCGGATGTACGGCAAGTCGCTGTACCACGACATCTCGGGAGATACTTCAGGGGATTACC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1308  CAGATCAGAGTATAAGCGGATGTACGGCAAGTCGCTGTACCACGACATCTCGGGAGATACTTCAGGGGATTACC  1381

Query 1481  GGAAGATTCTGCTGAAGATCTGTGGTGGCAATGAC  1515
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1382  GGAAGATTCTGCTGAAGATCTGTGGTGGCAATGAC  1416