Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_00073
- Subject:
- XM_005269741.4
- Aligned Length:
- 1822
- Identities:
- 1495
- Gaps:
- 314
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGTGTCCCACAACAGTCTGTCCTTGTCTGTCCTCCTGCTCCATGATGGTGAACTTGGGAGGGCAGAGCCTGC 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 CTGGGCTCTCCCAGCCTCCTTAATACCCCACAGAGGGTCTTGGGAGTGTTTGGGGAACTCCACCTTCCTCCCTG 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 GGAAGAGGGGAAGGTTTCCCCTCCTCTGCCAGTGGGATAGGGGGAGACTTTCCTCCTGGTGTTTTCATGTGGTC 222
Query 1 ----------------------------------------------------------ATGAGCT----ACCCT 12
..||||| .|.||
Sbjct 223 TGTGGTGTCCCGAGGCTCGAGGCTCGAGGCTTTACTGGGCCTCCCTTTCTGACCACCTGGGAGCTCTCATCTCT 296
Query 13 GGCTATCCCCCG------------CCCCCAGGTGGCTACCCACCA----------GCTGC-ACCAGGTGGTGGT 63
|.|| |.||||| |...||||.||||| | |.||| ..|||||||||||
Sbjct 297 GCCT-TTCCCCGTGTGGTGGGGGACTGGCAGGGGGCTA------AAGGGCTTGGTGTTGCTTTCAGGTGGTGGT 363
Query 64 CCCTGGGGAGGTGCTGCCTACCCTCCTCCGCCCAGCATGCCCCCCATCGGGCTGGATAACGTGGCCACCTATGC 137
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 364 CCCTGGGGAGGTGCTGCCTACCCTCCTCCGCCCAGCATGCCCCCCATCGGGCTGGATAACGTGGCCACCTATGC 437
Query 138 GGGGCAGTTCAACCAGGACTATCTCTCGGGAATGGCGGCCAACATGTCTGGGACATTTGGAGGAGCCAACATGC 211
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 438 GGGGCAGTTCAACCAGGACTATCTCTCGGGAATGGCGGCCAACATGTCTGGGACATTTGGAGGAGCCAACATGC 511
Query 212 CCAACCTGTACCCTGGGGCCCCTGGGGCTGGCTACCCACCAGTGCCCCCTGGCGGCTTTGGGCAGCCCCCCTCT 285
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 512 CCAACCTGTACCCTGGGGCCCCTGGGGCTGGCTACCCACCAGTGCCCCCTGGCGGCTTTGGGCAGCCCCCCTCT 585
Query 286 GCCCAGCAGCCTGTTCCTCCCTATGGGATGTATCCACCCCCAGGAGGAAACCCACCCTCCAGGATGCCCTCATA 359
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 586 GCCCAGCAGCCTGTTCCTCCCTATGGGATGTATCCACCCCCAGGAGGAAACCCACCCTCCAGGATGCCCTCATA 659
Query 360 TCCGCCATACCCAGGGGCCCCTGTGCCGGGCCAGCCCATGCCACCCCCCGGACAGCAGCCCCCAGGGGCCTACC 433
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 660 TCCGCCATACCCAGGGGCCCCTGTGCCGGGCCAGCCCATGCCACCCCCCGGACAGCAGCCCCCAGGGGCCTACC 733
Query 434 CTGGGCAGCCACCAGTGACCTACCCTGGTCAGCCTCCAGTGCCACTCCCTGGGCAGCAGCAGCCAGTGCCGAGC 507
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 734 CTGGGCAGCCACCAGTGACCTACCCTGGTCAGCCTCCAGTGCCACTCCCTGGGCAGCAGCAGCCAGTGCCGAGC 807
Query 508 TACCCAGGATACCCGGGGTCTGGGACTGTCACCCCCGCTGTGCCCCCAACCCAGTTTGGAAGCCGAGGCACCAT 581
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 808 TACCCAGGATACCCGGGGTCTGGGACTGTCACCCCCGCTGTGCCCCCAACCCAGTTTGGAAGCCGAGGCACCAT 881
Query 582 CACTGATGCTCCCGGCTTTGACCCCCTGCGAGATGCCGAGGTCCTGCGGAAGGCCATGAAAGGCTTCGGGACGG 655
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 882 CACTGATGCTCCCGGCTTTGACCCCCTGCGAGATGCCGAGGTCCTGCGGAAGGCCATGAAAGGCTTCGGGACGG 955
Query 656 ATGAGCAGGCCATCATTGACTGCCTGGGGAGTCGCTCCAACAAGCAGCGGCAGCAGATCCTACTTTCCTTCAAG 729
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 956 ATGAGCAGGCCATCATTGACTGCCTGGGGAGTCGCTCCAACAAGCAGCGGCAGCAGATCCTACTTTCCTTCAAG 1029
Query 730 ACGGCTTACGGCAAGGATTTGATCAAAGATCTGAAATCTGAACTGTCAGGAAACTTTGAGAAGACAATCTTGGC 803
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1030 ACGGCTTACGGCAAGGATTTGATCAAAGATCTGAAATCTGAACTGTCAGGAAACTTTGAGAAGACAATCTTGGC 1103
Query 804 TCTGATGAAGACCCCAGTCCTCTTTGACATTTATGAGATAAAGGAAGCCATCAAGGGGGTTGGCACTGATGAAG 877
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1104 TCTGATGAAGACCCCAGTCCTCTTTGACATTTATGAGATAAAGGAAGCCATCAAGGGGGTTGGCACTGATGAAG 1177
Query 878 CCTGCCTGATTGAGATCCTCGCTTCCCGCAGCAATGAGCACATCCGAGAATTAAACAGAGCCTACAAAGCAGAA 951
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1178 CCTGCCTGATTGAGATCCTCGCTTCCCGCAGCAATGAGCACATCCGAGAATTAAACAGAGCCTACAAAGCAGAA 1251
Query 952 TTCAAAAAGACCCTGGAAGAGGCCATTCGAAGCGACACATCAGGGCACTTCCAGCGGCTCCTCATCTCTCTCTC 1025
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1252 TTCAAAAAGACCCTGGAAGAGGCCATTCGAAGCGACACATCAGGGCACTTCCAGCGGCTCCTCATCTCTCTCTC 1325
Query 1026 TCAGGGAAACCGTGATGAAAGCACAAACGTGGACATGTCACTCGCCCAGAGAGATGCCCAGGAGCTGTATGCGG 1099
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1326 TCAGGGAAACCGTGATGAAAGCACAAACGTGGACATGTCACTCGCCCAGAGAGATGCCCAGGAGCTGTATGCGG 1399
Query 1100 CCGGGGAGAACCGCCTGGGAACAGACGAGTCCAAGTTCAATGCGGTTCTGTGCTCCCGGAGCCGGGCCCACCTG 1173
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1400 CCGGGGAGAACCGCCTGGGAACAGACGAGTCCAAGTTCAATGCGGTTCTGTGCTCCCGGAGCCGGGCCCACCTG 1473
Query 1174 GTAGCAGTTTTCAATGAGTACCAGAGAATGACAGGCCGGGACATTGAGAAGAGCATCTGCCGGGAGATGTCCGG 1247
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1474 GTAGCAGTTTTCAATGAGTACCAGAGAATGACAGGCCGGGACATTGAGAAGAGCATCTGCCGGGAGATGTCCGG 1547
Query 1248 GGACCTGGAGGAGGGCATGCTGGCCGTGGTGAAATGTCTCAAGAATACCCCAGCCTTCTTTGCGGAGAGGCTCA 1321
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1548 GGACCTGGAGGAGGGCATGCTGGCCGTGGTGAAATGTCTCAAGAATACCCCAGCCTTCTTTGCGGAGAGGCTCA 1621
Query 1322 ACAAGGCCATGAGGGGGGCAGGAACAAAGGACCGGACCCTGATTCGCATCATGGTGTCTCGCAGCGAGACCGAC 1395
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1622 ACAAGGCCATGAGGGGGGCAGGAACAAAGGACCGGACCCTGATTCGCATCATGGTGTCTCGCAGCGAGACCGAC 1695
Query 1396 CTCCTGGACATCAGATCAGAGTATAAGCGGATGTACGGCAAGTCGCTGTACCACGACATCTCGGGAGATACTTC 1469
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1696 CTCCTGGACATCAGATCAGAGTATAAGCGGATGTACGGCAAGTCGCTGTACCACGACATCTCGGGAGATACTTC 1769
Query 1470 AGGGGATTACCGGAAGATTCTGCTGAAGATCTGTGGTGGCAATGAC 1515
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1770 AGGGGATTACCGGAAGATTCTGCTGAAGATCTGTGGTGGCAATGAC 1815