Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_00076
• Subject: NM_001257325.2
• Aligned Length: 2137
• Identities: 1411
• Gaps: 725

Alignment

Query    1  ATGTCTGTTCCATCATCACTGAGCCAGTCGGCCATTAATGCCAACAGCCACGGAGGCCCCGCACTGAGCCTACC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CCTGCCTCTGCACGCTGCCCACAACCAGCTGCTCAACGCCAAGCTGCAGGCCACAGCTGTGGGACCCAAGGACC  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  TGCGCAGCGCCATGGGGGAGGGTGGTGGGCCTGAGCCAGGCCCTGCCAATGCCAAGTGGCTAAAAGAGGGCCAG  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  AACCAGCTCCGGCGGGCCGCCACGGCCCACCGTGACCAGAATCGCAATGTGACCTTGACCTTGGCGGAGGAGGC  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  CAGCCAGGAGCCTGAGATGGCACCCTTGGGCCCCAAAGGCCTGATACACCTGTACTCTGAGCTGGAGCTCTCAG  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  CTCACAACGCAGCCAACCGAGGCCTACGAGGACCTGGCCTGATCATCAGCACTCAAGAGCAGGGGCCAGATGAG  444
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  445  GGAGAGGAGAAGGCGGCCGGGGAGGCCGAGGAGGAGGAGGAGGATGATGATGATGAAGAGGAGGAGGAGGACTT  518
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  519  ATCTTCTCCCCCAGGGCTGCCTGAGCCCCTGGAGAGTGTGGAGGCCCCTCCCAGGCCCCAAGCCCTTACAGATG  592
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  593  GCCCCCGGGAACACAGCAAGAGTGCCAGCCTCCTGTTTGGCATGCGGAACAGTGCAGCCAGTGATGAGGACTCA  666
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  667  AGCTGGGCTACCTTATCCCAGGGCAGCCCCTCCTATGGCTCCCCAGAGGACAC-------AGATTCCTTCTGGA  733
                                                          |.|||||       ||||||||||||||
Sbjct    1  ----------------------------------------------ATGACACAGATGCGAGATTCCTTCTGGA  28

Query  734  ACCCCAACGCCTTCGAGACGGATTCCGACCTGCCGGCTGGATGGATGAGGGTCCAGGACACCTCAGGGACCTAT  807
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   29  ACCCCAACGCCTTCGAGACGGATTCCGACCTGCCGGCTGGATGGATGAGGGTCCAGGACACCTCAGGGACCTAT  102

Query  808  TACTGGCACATCCCAACAGGGACCACCCAGTGGGAACCCCCCGGCCGGGCCTCCCCCTCACAGGGGAGCAGCCC  881
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  103  TACTGGCACATCCCAACAGGGACCACCCAGTGGGAACCCCCCGGCCGGGCCTCCCCCTCACAGGGGAGCAGCCC  176

Query  882  CCAAGAGGAGTCCCAGCTCACCTGGACAGGTTTTGCTCATGGAGAAGGCTTTGAGGATGGAGAATTTTGGAAGG  955
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  177  CCAAGAGGAGTCCCAGCTCACCTGGACAGGTTTTGCTCATGGAGAAGGCTTTGAGGATGGAGAATTTTGGAAGG  250

Query  956  ATGAACCCAGTGATGAGGCCCCAATGGAGCTGGGACTGAAGGAACCTGAGGAGGGGACGTTGACCTTCCCAGCT  1029
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  251  ATGAACCCAGTGATGAGGCCCCAATGGAGCTGGGACTGAAGGAACCTGAGGAGGGGACGTTGACCTTCCCAGCT  324

Query 1030  CAGAGCCTCAGCCCAGAGCCGTTGCCCCAAGAGGAGGAGAAGCTTCCCCCACGGAATACCAACCCAGGGATCAA  1103
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  325  CAGAGCCTCAGCCCAGAGCCGTTGCCCCAAGAGGAGGAGAAGCTTCCCCCACGGAATACCAACCCAGGGATCAA  398

Query 1104  GTGTTTCGCCGTGCGCTCCCTAGGCTGGGTAGAGATGACCGAGGAGGAGCTGGCCCCTGGACGCAGCAGTGTGG  1177
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  399  GTGTTTCGCCGTGCGCTCCCTAGGCTGGGTAGAGATGACCGAGGAGGAGCTGGCCCCTGGACGCAGCAGTGTGG  472

Query 1178  CAGTCAACAATTGCATCCGTCAGCTCTCTTACCACAAAAACAACCTGCATGACCCCATGTCTGGGGGCTGGGGG  1251
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  473  CAGTCAACAATTGCATCCGTCAGCTCTCTTACCACAAAAACAACCTGCATGACCCCATGTCTGGGGGCTGGGGG  546

Query 1252  GAAGGAAAGGATCTGCTACTGCAGCTGGAGGATGAGACACTAAAGCTAGTGGAGCCACAGAGCCAGGCACTGCT  1325
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  547  GAAGGAAAGGATCTGCTACTGCAGCTGGAGGATGAGACACTAAAGCTAGTGGAGCCACAGAGCCAGGCACTGCT  620

Query 1326  GCACGCCCAACCCATCATCAGCATCCGCGTGTGGGGCGTCGGGCGGGACAGTGGA------AGGGACTTTGCCT  1393
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||
Sbjct  621  GCACGCCCAACCCATCATCAGCATCCGCGTGTGGGGCGTCGGGCGGGACAGTGGAAGAGAGAGGGACTTTGCCT  694

Query 1394  ACGTAGCTCGTGATAAGCTGACCCAGATGCTCAAGTGCCACGTGTTTCGCTGTGAGGCACCTGCCAAGAACATC  1467
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  695  ACGTAGCTCGTGATAAGCTGACCCAGATGCTCAAGTGCCACGTGTTTCGCTGTGAGGCACCTGCCAAGAACATC  768

Query 1468  GCCACCAGCCTGCATGAGATCTGCTCTAAGATCATGGCCGAACGGCGTAATGCCCGCTGCTTGGTAAATGGACT  1541
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  769  GCCACCAGCCTGCATGAGATCTGCTCTAAGATCATGGCCGAACGGCGTAATGCCCGCTGCTTGGTAAATGGACT  842

Query 1542  CTCCCTGGACCACTCTAAACTTGTGGATGTCCCTTTCCAAGTGGAATTCCCAGCGCCTAAGAATGAGTTGGTCC  1615
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  843  CTCCCTGGACCACTCTAAACTTGTGGATGTCCCTTTCCAAGTGGAATTCCCAGCGCCTAAGAATGAGTTGGTCC  916

Query 1616  AGAAGTTCCAAGTCTATTACCTGGGGAATGTACCTGTTGCTAAACCTGTTGGGGTAGATGTGATTAATGGGGCC  1689
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  917  AGAAGTTCCAAGTCTATTACCTGGGGAATGTACCTGTTGCTAAACCTGTTGGGGTAGATGTGATTAATGGGGCC  990

Query 1690  CTCGAGTCAGTCCTGTCCTCCAGCAGCCGTGAACAATGGACCCCAAGTCATGTCAGTGTGGCCCCTGCTACCCT  1763
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  991  CTCGAGTCAGTCCTGTCCTCCAGCAGCCGTGAACAATGGACCCCAAGTCATGTCAGTGTGGCCCCTGCTACCCT  1064

Query 1764  CACCATCTTGCACCAGCAGACAGAGGCAGTGCTGGGAGAGTGTCGGGTGCGTTTCCTCTCCTTCCTGGCCGTGG  1837
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1065  CACCATCTTGCACCAGCAGACAGAGGCAGTGCTGGGAGAGTGTCGGGTGCGTTTCCTCTCCTTCCTGGCCGTGG  1138

Query 1838  GCAGAGATGTCCACACGTTTGCATTCATCATGGCTGCCGGCCCAGCCTCCTTCTGCTGCCACATGTTCTGGTGC  1911
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1139  GCAGAGATGTCCACACGTTTGCATTCATCATGGCTGCCGGCCCAGCCTCCTTCTGCTGCCACATGTTCTGGTGC  1212

Query 1912  GAGCCCAATGCTGCCAGCCTCTCAGAGGCTGTGCAGGCTGCGTGCATGCTTCGCTACCAGAAGTGTCTGGATGC  1985
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1213  GAGCCCAATGCTGCCAGCCTCTCAGAGGCTGTGCAGGCTGCGTGCATGCTTCGCTACCAGAAGTGTCTGGATGC  1286

Query 1986  CCGTTCCCAGGCCTCCACCTCCTGCCTCCCAGCACCCCCTGCTGAGTCTGTGGCACGGCGTGTAGGGTGGACTG  2059
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1287  CCGTTCCCAGGCCTCCACCTCCTGCCTCCCAGCACCCCCTGCTGAGTCTGTGGCACGGCGTGTAGGGTGGACTG  1360

Query 2060  TCCGCAGGGGTGTTCAGTCGCTGTGGGGCTCCCTGAAGCCCAAACGGCTGGGGGCCCATACCCCA  2124
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1361  TCCGCAGGGGTGTTCAGTCGCTGTGGGGCTCCCTGAAGCCCAAACGGCTGGGGGCCCATACCCCA  1425