Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_00076
• Subject: XM_017321947.1
• Aligned Length: 2141
• Identities: 1319
• Gaps: 697

Alignment

Query    1  ATGTCTGTTCCATCATCACTGAGCCAGTCGGCCATTAATGCCAACAGCCACGGAGGCCCCGCACTGAGCCTACC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CCTGCCTCTGCACGCTGCCCACAACCAGCTGCTCAACGCCAAGCTGCAGGCCACAGCTGTGGGACCCAAGGACC  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  TGCGCAGCGCCATGGGGGAGGGTGGTGGGCCTGAGCCAGGCCCTGCCAATGCCAAGTGGCTAAAAGAGGGCCAG  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  AACCAGCTCCGGCGGGCCGCCACGGCCCACCGTGACCAGAATCGCAATGTGACCTTGACCTTGGCGGAGGAGGC  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  CAGCCAGGAGCCTGAGATGGCACCCTTGGGCCCCAAAGGCCTGATACACCTGTACTCTGAGCTGGAGCTCTCAG  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  CTCACAACGCAGCCAACCGAGGCCTACGAGGACCTGGCCTGATCATCAGCACTCAAGAGCAGGGGCCAGATGAG  444
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  445  GGAGAGGAGAAGGCGGCCGGGGAGGCCGAGGAGGAGGAGGAGGATGATGATGATGAAGAGGAGGAGGAGGACTT  518
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  519  ATCTTCTCCCCCAGGGCTGCCTGAGCCCCTGGAGAGTGTGGAGGCCCCTCCCAGGCCCCAAGCCCTTACAGATG  592
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  593  GCCCCCGGGAACACAGCAAGAGTGCCAGCCTCCTGTTTGGCATGCGGAACAGTGCAGCCAGTGATGAGGACTCA  666
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  667  AGCTGGGCTACCTTATCCCAGGGCAGCCCCTCCTATGGCT----CCCCAGAGGACA------CAGATTCCTTCT  730
                     |..||.|||||||  |...|.|||  |||||    .||...||||||      ||||||||||||
Sbjct    1  ---------ATGTTCTCCCAGG--ACTTCTTCC--TGGCTATCATCCTGCAGGACAACAGTCCAGATTCCTTCT  61

Query  731  GGAACCCCAACGCCTTCGAGACGGATTCCGACCTGCCGGCTGGATGGATGAGGGTCCAGGACACCTCAGGGACC  804
            |||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct   62  GGAACCCCAACGCTTTCGAGACGGATTCCGATCTACCGGCTGGATGGATGAGGGTACAGGACACCTCAGGGACC  135

Query  805  TATTACTGGCACATCCCAACAGGGACCACCCAGTGGGAACCCCCCGGCCGGGCCTCCCCCTCACAGGGGAGCAG  878
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  136  TACTACTGGCACATCCCAACAGGGACCACCCAGTGGGAACCCCCAGGCCGGGCCTCCCCCTCACAGGGGAGCAG  209

Query  879  CCCCCAAGAGGAGTCCCAGCTCACCTGGACAGGTTTTGCTCATGGAGAAGGCTTTGAGGATGGAGAATTTTGGA  952
            |||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||...|||||||||||||||.|||||.|||||||
Sbjct  210  CCCCCAAGAAGAGTCCCAGCTCACCTGGACTGGCTTTGCTCACCAAGAAGGCTTTGAGGAAGGAGAGTTTTGGA  283

Query  953  AGGATGAACCCAGTGATGAGGCCCCAATGGAGCTGGGACTGAAGGAACCTGAGGAGGGGACGTTGACCTTCCCA  1026
            ||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||.||.|||||||.|||.|||.||||||||
Sbjct  284  AGGATGAACCCAGTGAGGAGGCCCCAATGGAGTTGGGACTGAAGGACCCCGAGGAGGCGACATTGTCCTTCCCA  357

Query 1027  GCTCAGAGCCTCAGCCCAGAGCC-GTTGCCCCAAGAGGAGGAGAAGCTTCCCCCACGGAATACCAACCCAGGGA  1099
            ||||||||||||||||||||.|| ||| |||||.|||||.||||||||..|||.|||||||.||||||||||||
Sbjct  358  GCTCAGAGCCTCAGCCCAGAACCAGTT-CCCCAGGAGGAAGAGAAGCTGTCCCAACGGAATGCCAACCCAGGGA  430

Query 1100  TCAAGTGTTTCGCCGTGCGCTCCCTAGGCTGGGTAGAGATGACCGAGGAGGAGCTGGCCCCTGGACGCAGCAGT  1173
            |||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  431  TCAAGTGTTTCGCTGTGCGCTCCCTAGGCTGGGTAGAGATGACCGAGGAGGAGCTGGCCCCAGGACGCAGCAGT  504

Query 1174  GTGGCAGTCAACAATTGCATCCGTCAGCTCTCTTACCACAAAAACAACCTGCATGACCCCATGTCTGGGGGCTG  1247
            |||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||.|||||.||.|||.||||||||||
Sbjct  505  GTGGCAGTCAACAATTGTATCCGCCAGCTCTCCTACCACAAAAACAATCTACATGATCCGATGGCTGGGGGCTG  578

Query 1248  GGGGGAAGGAAAGGATCTGCTACTGCAGCTGGAGGATGAGACACTAAAGCTAGTGGAGCCACAGAGCCAGGCAC  1321
            |||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.||||||.|.|||||||||||||.||||.|.|
Sbjct  579  GGGAGAGGGAAAGGATCTGCTGCTCCAGCTGGAGGACGAGACTCTAAAGTTGGTGGAGCCACAGAACCAGACGC  652

Query 1322  TGCTGCACGCCCAACCCATCATCAGCATCCGCGTGTGGGGCGTCGGGCGGGACAGTGGA------AGGGACTTT  1389
            |||||||.||.||.||||||.|||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||      |||||||||
Sbjct  653  TGCTGCATGCACAGCCCATCGTCAGCATTCGTGTGTGGGGCGTTGGGCGGGACAGTGGAAGAGAGAGGGACTTT  726

Query 1390  GCCTACGTAGCTCGTGATAAGCTGACCCAGATGCTCAAGTGCCACGTGTTTCGCTGTGAGGCACCTGCCAAGAA  1463
            ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  727  GCCTACGTAGCTCGAGATAAGCTGACCCAGATGCTCAAGTGCCACGTGTTTCGCTGTGAGGCACCTGCCAAGAA  800

Query 1464  CATCGCCACCAGCCTGCATGAGATCTGCTCTAAGATCATGGCCGAACGGCGTAATGCCCGCTGCTTGGTAAATG  1537
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.|.||||||||.|||||.|||||||||||.||||
Sbjct  801  CATCGCCACCAGCCTGCATGAGATCTGCTCCAAGATCATGTCTGAACGGCGCAATGCTCGCTGCTTGGTCAATG  874

Query 1538  GACTCTCCCTGGACCACTCTAAACTTGTGGATGTCCCTTTCCAAGTGGAATTCCCAGCGCCTAAGAATGAGTTG  1611
            ||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||.||
Sbjct  875  GACTCTCCCTAGACCACTCTAAACTCGTGGATGTCCCTTTCCAAGTGGAATTCCCAGCACCAAAGAATGAGCTG  948

Query 1612  GTCCAGAAGTTCCAAGTCTATTACCTGGGGAATGTACCTGTTGCTAAACCTGTTGGGGTAGATGTGATTAATGG  1685
            ||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  949  GTGCAGAAGTTCCAAGTCTATTACCTGGGAAATGTGCCAGTTGCTAAACCTGTTGGGGTAGACGTGATTAATGG  1022

Query 1686  GGCCCTCGAGTCAGTCCTGTCCTCCAGCAGCCGTGAACAATGGACCCCAAGTCATGTCAGTGTGGCCCCTGCTA  1759
            ||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|
Sbjct 1023  GGCCCTGGAGTCAGTCCTGTCTTCCAGTAGCCGTGAGCAGTGGACTCCAAGTCACGTCAGCGTGGCCCCTGCCA  1096

Query 1760  CCCTCACCATCTTGCACCAGCAGACAGAGGCAGTGCTGGGAGAGTGTCGGGTGCGTTTCCTCTCCTTCCTGGCC  1833
            ||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||.
Sbjct 1097  CCCTCACCATCTTGCACCAGCAGACAGAAGCGGTGCTGGGGGAGTGCCGGGTGCGGTTTCTCTCCTTCCTGGCT  1170

Query 1834  GTGGGCAGAGATGTCCACACGTTTGCATTCATCATGGCTGCCGGCCCAGCCTCCTTCTGCTGCCACATGTTCTG  1907
            ||||||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct 1171  GTGGGCAGAGATGTGCACACATTCGCGTTCATCATGGCTGCCGGCCCAGCCTCCTTCTGCTGTCACATGTTTTG  1244

Query 1908  GTGCGAGCCCAATGCTGCCAGCCTCTCAGAGGCTGTGCAGGCTGCGTGCATGCTTCGCTACCAGAAGTGTCTGG  1981
            |||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1245  GTGTGAGCCCAATGCTGCCAGTCTCTCAGAGGCTGTGCAGGCTGCATGCATGCTCCGCTACCAGAAGTGTCTGG  1318

Query 1982  ATGCCCGTTCCCAGGCCTCCACCTCCTGCCTCCCAGCACCCCCTGCTGAGTCTGTGGCACGGCGTGTAGGGTGG  2055
            ||||.||.||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||.|.||||||||||||
Sbjct 1319  ATGCTCGCTCCCAGACCTCCACCTCCTGCCTCCCAGCACCCCCTGCGGAGTCAGTTGCAAGACGTGTAGGGTGG  1392

Query 2056  ACTGTCCGCAGGGGTGTTCAGTCGCTGTGGGGCTCCCTGAAGCCCAAACGGCTGGGGGCCCATACCCCA  2124
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||..||||.||||||
Sbjct 1393  ACAGTCCGCAGGGGTGTTCAGTCGCTGTGGGGTTCCCTCAAGCCCAAACGTCTGGGATCCCAGACCCCA  1461