Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_00105
• Subject: NR_147789.1
• Aligned Length: 3108
• Identities: 1875
• Gaps: 1233

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  GCGATTGGTGGGCGGGGGGCCGGGCCTGGGCCGGCGGGGAGCGGATTGGTCGGAAAGTAGGTTAGTGGTGCGAC  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  ATTTAGGGAAGGCAGAAAGTAGGTCAGGGACGGAGGTGCCTGTTTACCCGCGCCGGACTCACCGCCGCCGCCGC  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  CGCGGGATCCGAGTGCGGGCGCGGGCGCGGGCGCTCCCGGCGAGCCACGGTGGTGCTGGCTAGAGTGTATACGT  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  TTGGACCCAAGCTTAACTTTTCCAATGTGGAATCCTGGGCCTTCATTGGTTTTTGGAAGAAGCTGACCGCCTGA  296

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  297  AAAGAAATTATAAAACATGAAAATCGCTTTGAGGTGACCAAGTCCAGAGGCCCCTAACTCCTCCCAAGCTGGAT  370

Query    1  ----------------------------------ATGGCAGACCAGAGAATGGACATTTCTTCAACCATCAGTG  40
                                              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CTGGGGTGTAAGAACTGTGACTTCAGATCATCCAATGGCAGACCAGAGAATGGACATTTCTTCAACCATCAGTG  444

Query   41  ATTTCATGTCCCCGGGCCCCACCGACCTGCTTTCCAGCTCTCTTGGTACCAGTGGTGTGGATTGCAACCGCAAA  114
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ATTTCATGTCCCCGGGCCCCACCGACCTGCTTTCCAGCTCTCTTGGTACCAGTGGTGTGGATTGCAACCGCAAA  518

Query  115  CGGAAAGGCAGCTCCACTGACTACCA------------------------------------------------  140
            ||||||||||||||||||||||||||                                                
Sbjct  519  CGGAAAGGCAGCTCCACTGACTACCATTCACAGGTCGAATTTGGGGAGCACAATGGCTGGAGGTCAGATGCCCA  592

Query  141  -----------------------AGAAAGCATGGACACAGACAAAGATGACCCTCATGGAAGGTTAGAATATAC  191
                                   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CTAGGAGATGCTATGATTAATATAGAAAGCATGGACACAGACAAAGATGACCCTCATGGAAGGTTAGAATATAC  666

Query  192  AGAACACCAAGGAAGGATAAAAAATGCAAGGGAAGCTCACAGTCAGATTGAAAAGCGGCGTCGGGATAAAATGA  265
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AGAACACCAAGGAAGGATAAAAAATGCAAGGGAAGCTCACAGTCAGATTGAAAAGCGGCGTCGGGATAAAATGA  740

Query  266  ACAGTTTTATAGATGAATTGGCTTCTTTGGTACCAACATGCAACGCAATGTCCAGGAAATTAGATAAACTTACT  339
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  ACAGTTTTATAGATGAATTGGCTTCTTTGGTACCAACATGCAACGCAATGTCCAGGAAATTAGATAAACTTACT  814

Query  340  GTGCTAAGGATGGCTGTTCAGCACATGAAAACATTAAGAGGTGCCACCAATCCATACACAGAAGCAAACTACAA  413
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GTGCTAAGGATGGCTGTTCAGCACATGAAAACATTAAGAGGTGCCACCAATCCATACACAGAAGCAAACTACAA  888

Query  414  ACCAACTTTTCTATCAGACGATGAATTGAAACACCTCATTCTCAGGGCAGCAGATGGATTTTTGTTTGTCGTAG  487
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ACCAACTTTTCTATCAGACGATGAATTGAAACACCTCATTCTCAGGGCAGCAGATGGATTTTTGTTTGTCGTAG  962

Query  488  GATGTGACCGAGGGAAGATACTCTTTGTCTCAGAGTCTGTCTTCAAGATCCTCAACTACAGCCAGAATGATCTG  561
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GATGTGACCGAGGGAAGATACTCTTTGTCTCAGAGTCTGTCTTCAAGATCCTCAACTACAGCCAGAATGATCTG  1036

Query  562  ATTGGTCAGAGTTTGTTTGACTACCTGCATCCTAAAGATATTGCCAAAGTCAAGGAGCAGCTCTCCTCCTCTGA  635
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ATTGGTCAGAGTTTGTTTGACTACCTGCATCCTAAAGATATTGCCAAAGTCAAGGAGCAGCTCTCCTCCTCTGA  1110

Query  636  CACCGCACCCCGGGAGCGGCTCATAGATGCAAAAACTGGACTTCCAGTTAAAACAGATATAACCCCTGGGCCAT  709
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CACCGCACCCCGGGAGCGGCTCATAGATGCAAAAACTGGACTTCCAGTTAAAACAGATATAACCCCTGGGCCAT  1184

Query  710  CTCGATTATGTTCTGGAGCACGACGTTCTTTCTTCTGTAGGATGAAGTGTAACAGGCCTTCAGTAAAGGTTGAA  783
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CTCGATTATGTTCTGGAGCACGACGTTCTTTCTTCTGTAGGATGAAGTGTAACAGGCCTTCAGTAAAGGTTGAA  1258

Query  784  GACAAGGACTTCCCCTCTACCTGCTCAAAGAAAAAAGATCGAAAAAGCTTCTGCACAATCCACAGCACAGGCTA  857
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GACAAGGACTTCCCCTCTACCTGCTCAAAGAAAAAAGATCGAAAAAGCTTCTGCACAATCCACAGCACAGGCTA  1332

Query  858  TTTGAAAAGCTGGCCACCCACAAAGATGGGGCTGGATGAAGACAACGAACCAGACAATGAGGGGTGTAACCTCA  931
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TTTGAAAAGCTGGCCACCCACAAAGATGGGGCTGGATGAAGACAACGAACCAGACAATGAGGGGTGTAACCTCA  1406

Query  932  GCTGCCTCGTCGCAATTGGACGACTGCATTCTCATGTAGTTCCACAACCAGTGAACGGGGAAATCAGGGTGAAA  1005
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GCTGCCTCGTCGCAATTGGACGACTGCATTCTCATGTAGTTCCACAACCAGTGAACGGGGAAATCAGGGTGAAA  1480

Query 1006  TCTATGGAATATGTTTCTCGGCACGCGATAGATGGAAAGTTTGTTTTTGTAGACCAGAGGGCAACAGCTATTTT  1079
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TCTATGGAATATGTTTCTCGGCACGCGATAGATGGAAAGTTTGTTTTTGTAGACCAGAGGGCAACAGCTATTTT  1554

Query 1080  GGCATATTTACCACAAGAACTTCTAGGCACATCGTGTTATGAATATTTTCACCAAGATGACATAGGACATCTTG  1153
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GGCATATTTACCACAAGAACTTCTAGGCACATCGTGTTATGAATATTTTCACCAAGATGACATAGGACATCTTG  1628

Query 1154  CAGAATGTCATAGGCAAGTTTTACAGACGAGAGAAAAAATTACAACTAATTGCTATAAATTTAAAATCAAAGAT  1227
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CAGAATGTCATAGGCAAGTTTTACAGACGAGAGAAAAAATTACAACTAATTGCTATAAATTTAAAATCAAAGAT  1702

Query 1228  GGTTCTTTTATCACACTACGGAGTCGATGGTTCAGTTTCATGAACCCTTGGACCAAGGAAGTAGAATATATTGT  1301
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  GGTTCTTTTATCACACTACGGAGTCGATGGTTCAGTTTCATGAACCCTTGGACCAAGGAAGTAGAATATATTGT  1776

Query 1302  CTCAACTAACACTGTTGTTTTAGCCAACGTCCTGGAAGGCGGGGACCCAACCTTCCCACAGCTCACAGCATCCC  1375
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  CTCAACTAACACTGTTGTTTTAGCCAACGTCCTGGAAGGCGGGGACCCAACCTTCCCACAGCTCACAGCATCCC  1850

Query 1376  CCCACAGCATGGACAGCATGCTGCCCTCTGGAGAAGGTGGCCCAAAGAGGACCCACCCCACTGTTCCAGGGATT  1449
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  CCCACAGCATGGACAGCATGCTGCCCTCTGGAGAAGGTGGCCCAAAGAGGACCCACCCCACTGTTCCAGGGATT  1924

Query 1450  CCAGGGGGAACCCGGGCTGGGGCAGGAAAAATAGGCCGAATGATTGCTGAGGAAATCATGGAAATCCACAGGAT  1523
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  CCAGGGGGAACCCGGGCTGGGGCAGGAAAAATAGGCCGAATGATTGCTGAGGAAATCATGGAAATCCACAGGAT  1998

Query 1524  AAGAGGGTCATCGCCTTCTAGCTGTGGCTCCAGCCCATTGAACATCACGAGTACGCCTCCCCCTGATGCCTCTT  1597
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  AAGAGGGTCATCGCCTTCTAGCTGTGGCTCCAGCCCATTGAACATCACGAGTACGCCTCCCCCTGATGCCTCTT  2072

Query 1598  CTCCAGGAGGCAAGAAG---------------------------------------------------------  1614
            |||||||||||||||||                                                         
Sbjct 2073  CTCCAGGAGGCAAGAAGATTCCACATTGCAACTCACCTTTAAGAAACTTCTACGTGTCAAGTTTTGAAGTGGTA  2146

Query 1615  --------------------------------------------------------------------------  1614
                                                                                      
Sbjct 2147  TCAAAAAAGAATACAATTATTTGAAAAGTCTATTAAAATATGCCTCCCTTTTCCAACTACTTATCTGTGGGAGG  2220

Query 1615  --------------------------------------------------------------------------  1614
                                                                                      
Sbjct 2221  TTGGATTTCCTTCATATACTTGAATCACAAGACGTATCTAAATAGACTGAATGGAAAAACATATATGAGAATCC  2294

Query 1615  ----------------------------------------ATTTTAAATGGAGGGACTCCAGACATTCCTTCCA  1648
                                                    ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  AGTTGAAAATTATTAAGCCAGACATTAGATTTGCAAAAATATTTTAAATGGAGGGACTCCAGACATTCCTTCCA  2368

Query 1649  GTGGCCTACTATCAGGCCAGGCTCAGGAGAACCCAGGTTATCCATATTCTGATAGTTCTTCTATTCTTGGTGAG  1722
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  GTGGCCTACTATCAGGCCAGGCTCAGGAGAACCCAGGTTATCCATATTCTGATAGTTCTTCTATTCTTGGTGAG  2442

Query 1723  AACCCCCACATAGGTATAGACATGATTGACAACGACCAAGGATCAAGTAGTCCCAGTAATGATGAGGCAGCAAT  1796
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  AACCCCCACATAGGTATAGACATGATTGACAACGACCAAGGATCAAGTAGTCCCAGTAATGATGAGGCAGCAAT  2516

Query 1797  GGCTGTCATCATGAGCCTCTTGGAAGCAGATGCTGGACTGGGTGGCCCTGTTGACTTTAGTGACTTGCCATGGC  1870
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  GGCTGTCATCATGAGCCTCTTGGAAGCAGATGCTGGACTGGGTGGCCCTGTTGACTTTAGTGACTTGCCATGGC  2590

Query 1871  CGCTG---------------------------------------------------------------------  1875
            |||||                                                                     
Sbjct 2591  CGCTGTAAACACTACATGTTGCTTTGGCAACAGCTATAGTATCAAAGTGCATTACTGGTGGAGTTTTACAGTCT  2664

Query 1876  --------------------------------------------------------------------------  1875
                                                                                      
Sbjct 2665  GTGAAGCTTACTGGATAAGGAGAGAATAGCTTTTATGTACTGACTTCATAAAAGCCATCTCAGAGCCATTGATA  2738

Query 1876  --------------------------------------------------------------------------  1875
                                                                                      
Sbjct 2739  CAAGTCAATCTTACTATATGTAACTTCAGACAAAGTGGAACTAAGCCTGCTCCAGTGTTTCCTCATCATTGATT  2812

Query 1876  --------------------------------------------------------------------------  1875
                                                                                      
Sbjct 2813  ATTGGGCTAGCTGTGGATAGCTTGCATTAATTGTATATTTTGGATTCTGTTTGTGTTGAATTTTTTAATCATTG  2886

Query 1876  --------------------------------------------------------------------------  1875
                                                                                      
Sbjct 2887  TGCACAGAAGCATCATTGGTAGCTTTTATATGCAAATGGTCATTTCAGATGTATGGTGTTTTTACACTACAAAG  2960

Query 1876  --------------------------------------------------------------------------  1875
                                                                                      
Sbjct 2961  AAGTCCCCCATGTGGATATTTCTTATACTAATTGTATCATAAAGCCGTTTATTCTTCCTTGTAAGAATCCTTTA  3034

Query 1876  --------------------------------------------------------------------------  1875
                                                                                      
Sbjct 3035  CTATAAATATGGGTTAAAGTATAATGTACTAGACAGTTAAATATTTTTAATAAATGTTTCCCTTGTTCTATAAA  3108