Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_00154
• Subject: NM_001318975.1
• Aligned Length: 1176
• Identities: 966
• Gaps: 210

Alignment

Query    1  ATGGCGGTTGTAGCGGCGGCTGCCGGCTGGCTACTCAGGCTCAGGGCGGCAGGGGCTGAGGGGCACTGGCGTCG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GCTTCCTGGCGCGGGGCTGGCGCGGGGCTTTTTGCACCCCGCCGCGACTGTCGAGGATGCGGCCCAGAGGCGGC  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  AGGTGGCTCATTTTACTTTCCAGCCAGATCCGGAGCCCCGGGAGTACGGGCAAACTCAGAAAATGAATCTTTTC  222
                                                                          ||||||||||||
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------ATGAATCTTTTC  12

Query  223  CAGTCTGTAACAAGTGCCTTGGATAACTCATTGGCCAAAGATCCTACTGCAGTAATATTTGGTGAAGATGTTGC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   13  CAGTCTGTAACAAGTGCCTTGGATAACTCATTGGCCAAAGATCCTACTGCAGTAATATTTGGTGAAGATGTTGC  86

Query  297  CTTTGGTGGAGTCTTTAGATGCACTGTTGGCTTGCGAGACAAATATGGAAAAGATAGAGTTTTTAATACCCCAT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   87  CTTTGGTGGAGTCTTTAGATGCACTGTTGGCTTGCGAGACAAATATGGAAAAGATAGAGTTTTTAATACCCCAT  160

Query  371  TGTGTGAACAAGGAATTGTTGGATTTGGAATCGGAATTGCGGTCACTGGAGCTACTGCCATTGCGGAAATTCAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  161  TGTGTGAACAAGGAATTGTTGGATTTGGAATCGGAATTGCGGTCACTGGAGCTACTGCCATTGCGGAAATTCAG  234

Query  445  TTTGCAGATTATATTTTCCCTGCATTTGATCAGATTGTTAATGAAGCTGCCAAGTATCGCTATCGCTCTGGGGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  235  TTTGCAGATTATATTTTCCCTGCATTTGATCAGATTGTTAATGAAGCTGCCAAGTATCGCTATCGCTCTGGGGA  308

Query  519  TCTTTTTAACTGTGGAAGCCTCACTATCCGGTCCCCTTGGGGCTGTGTTGGTCATGGGGCTCTCTATCATTCTC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  309  TCTTTTTAACTGTGGAAGCCTCACTATCCGGTCCCCTTGGGGCTGTGTTGGTCATGGGGCTCTCTATCATTCTC  382

Query  593  AGAGTCCTGAAGCATTTTTTGCCCATTGCCCAGGAATCAAGGTGGTTATACCCAGAAGCCCTTTCCAGGCCAAA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  383  AGAGTCCTGAAGCATTTTTTGCCCATTGCCCAGGAATCAAGGTGGTTATACCCAGAAGCCCTTTCCAGGCCAAA  456

Query  667  GGACTTCTTTTGTCATGCATAGAGGATAAAAATCCTTGTATATTTTTTGAACCTAAAATACTTTACAGGGCAGC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  457  GGACTTCTTTTGTCATGCATAGAGGATAAAAATCCTTGTATATTTTTTGAACCTAAAATACTTTACAGGGCAGC  530

Query  741  AGCGGAAGAAGTCCCTATAGAACCATACAACATCCCACTGTCCCAGGCCGAAGTCATACAGGAAGGGAGTGATG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  531  AGCGGAAGAAGTCCCTATAGAACCATACAACATCCCACTGTCCCAGGCCGAAGTCATACAGGAAGGGAGTGATG  604

Query  815  TTACTCTAGTTGCCTGGGGCACTCAGGTTCATGTGATCCGAGAGGTAGCTTCCATGGCAAAAGAAAAGCTTGGA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  605  TTACTCTAGTTGCCTGGGGCACTCAGGTTCATGTGATCCGAGAGGTAGCTTCCATGGCAAAAGAAAAGCTTGGA  678

Query  889  GTGTCTTGTGAAGTCATTGATCTGAGGACTATAATACCTTGGGATGTGGACACAATTTGTAAGTCTGTGATCAA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  679  GTGTCTTGTGAAGTCATTGATCTGAGGACTATAATACCTTGGGATGTGGACACAATTTGTAAGTCTGTGATCAA  752

Query  963  AACAGGGCGACTGCTAATCAGTCACGAGGCTCCCTTGACAGGCGGCTTTGCATCGGAAATCAGCTCTACAGTTC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  753  AACAGGGCGACTGCTAATCAGTCACGAGGCTCCCTTGACAGGCGGCTTTGCATCGGAAATCAGCTCTACAGTTC  826

Query 1037  AGGAGGAATGTTTCTTGAACCTAGAGGCTCCTATATCAAGAGTATGTGGTTATGACACACCATTTCCTCACATT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  827  AGGAGGAATGTTTCTTGAACCTAGAGGCTCCTATATCAAGAGTATGTGGTTATGACACACCATTTCCTCACATT  900

Query 1111  TTTGAACCATTCTACATCCCAGACAAATGGAAGTGTTATGATGCCCTTCGAAAAATGATCAACTAT  1176
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  901  TTTGAACCATTCTACATCCCAGACAAATGGAAGTGTTATGATGCCCTTCGAAAAATGATCAACTAT  966