Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_00154
- Subject:
- NM_199195.1
- Aligned Length:
- 1176
- Identities:
- 854
- Gaps:
- 210
Alignment
Query 1 ATGGCGGTTGTAGCGGCGGCTGCCGGCTGGCTACTCAGGCTCAGGGCGGCAGGGGCTGAGGGGCACTGGCGTCG 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 GCTTCCTGGCGCGGGGCTGGCGCGGGGCTTTTTGCACCCCGCCGCGACTGTCGAGGATGCGGCCCAGAGGCGGC 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 AGGTGGCTCATTTTACTTTCCAGCCAGATCCGGAGCCCCGGGAGTACGGGCAAACTCAGAAAATGAATCTTTTC 222
|||||.||.|||
Sbjct 1 --------------------------------------------------------------ATGAACCTCTTC 12
Query 223 CAGTCTGTAACAAGTGCCTTGGATAACTCATTGGCCAAAGATCCTACTGCAGTAATATTTGGTGAAGATGTTGC 296
|||||..|||||||||||.|||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 13 CAGTCAATAACAAGTGCCCTGGATAACTCATTAGCCAAAGACCCCACTGCAGTAATATTTGGTGAAGATGTTGC 86
Query 297 CTTTGGTGGAGTCTTTAGATGCACTGTTGGCTTGCGAGACAAATATGGAAAAGATAGAGTTTTTAATACCCCAT 370
|||||||||||||||..|||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.|
Sbjct 87 CTTTGGTGGAGTCTTCCGATGCACTGTTGGTTTACGAGACAAATACGGAAAAGATAGAGTGTTTAACACCCCGT 160
Query 371 TGTGTGAACAAGGAATTGTTGGATTTGGAATCGGAATTGCGGTCACTGGAGCTACTGCCATTGCGGAAATTCAG 444
||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||||||||.||.|||||.||.|||||||||||.|||
Sbjct 161 TGTGTGAACAAGGAATAGTTGGATTTGGCATTGGAATCGCGGTCACCGGTGCTACAGCTATTGCGGAAATCCAG 234
Query 445 TTTGCAGATTATATTTTCCCTGCATTTGATCAGATTGTTAATGAAGCTGCCAAGTATCGCTATCGCTCTGGGGA 518
|||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||
Sbjct 235 TTTGCCGACTATATTTTCCCTGCCTTTGATCAGATTGTCAACGAAGCTGCCAAGTATCGCTACCGCTCAGGTGA 308
Query 519 TCTTTTTAACTGTGGAAGCCTCACTATCCGGTCCCCTTGGGGCTGTGTTGGTCATGGGGCTCTCTATCATTCTC 592
||||||.||||||||.||||||||.||||||.||||.|||||.|||||.||.||||||||||||||.|||||||
Sbjct 309 TCTTTTCAACTGTGGGAGCCTCACCATCCGGGCCCCGTGGGGTTGTGTGGGCCATGGGGCTCTCTACCATTCTC 382
Query 593 AGAGTCCTGAAGCATTTTTTGCCCATTGCCCAGGAATCAAGGTGGTTATACCCAGAAGCCCTTTCCAGGCCAAA 666
|||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||.|||||||||||||||||||.
Sbjct 383 AGAGTCCTGAAGCCTTTTTTGCCCATTGCCCAGGGATCAAGGTGGTAATACCCCGAAGCCCTTTCCAGGCCAAG 456
Query 667 GGACTTCTTTTGTCATGCATAGAGGATAAAAATCCTTGTATATTTTTTGAACCTAAAATACTTTACAGGGCAGC 740
||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 457 GGACTTCTGTTGTCATGCATAGAAGATAAAAATCCATGTATATTTTTTGAACCTAAAATACTTTACCGGGCAGC 530
Query 741 AGCGGAAGAAGTCCCTATAGAACCATACAACATCCCACTGTCCCAGGCCGAAGTCATACAGGAAGGGAGTGATG 814
||.||||.|.|||||..|||||||.|||||.|||||..||||.|||||.||||||||.|||||.||.||.||||
Sbjct 531 AGTGGAACAGGTCCCAGTAGAACCCTACAAGATCCCCTTGTCTCAGGCTGAAGTCATCCAGGAGGGCAGCGATG 604
Query 815 TTACTCTAGTTGCCTGGGGCACTCAGGTTCATGTGATCCGAGAGGTAGCTTCCATGGCAAAAGAAAAGCTTGGA 888
|.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||..||||||||||||||
Sbjct 605 TGACTCTGGTTGCCTGGGGCACTCAGGTTCATGTCATCCGGGAGGTGGCTTCCATGGCCCAAGAAAAGCTTGGA 678
Query 889 GTGTCTTGTGAAGTCATTGATCTGAGGACTATAATACCTTGGGATGTGGACACAATTTGTAAGTCTGTGATCAA 962
||.||||||||||||||.||||||.||||.||..|.||||||||||||||.|||.||||.||||||||||||||
Sbjct 679 GTATCTTGTGAAGTCATCGATCTGCGGACAATTGTGCCTTGGGATGTGGATACAGTTTGCAAGTCTGTGATCAA 752
Query 963 AACAGGGCGACTGCTAATCAGTCACGAGGCTCCCTTGACAGGCGGCTTTGCATCGGAAATCAGCTCTACAGTTC 1036
|||.|||||||||.|.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.||||||||.||.||.|
Sbjct 753 AACCGGGCGACTGTTGATCAGCCACGAGGCTCCCTTAACAGGCGGCTTTGCCTCTGAGATCAGCTCCACGGTCC 826
Query 1037 AGGAGGAATGTTTCTTGAACCTAGAGGCTCCTATATCAAGAGTATGTGGTTATGACACACCATTTCCTCACATT 1110
||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||..||||.||.||.||||||||.||.|||||||||||.
Sbjct 827 AGGAAGAATGTTTCTTGAACCTAGAGGCTCCAATATCTCGAGTTTGCGGATATGACACCCCGTTTCCTCACATC 900
Query 1111 TTTGAACCATTCTACATCCCAGACAAATGGAAGTGTTATGATGCCCTTCGAAAAATGATCAACTAT 1176
|||||.||.||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||||||||||||
Sbjct 901 TTTGAGCCCTTTTATATCCCAGACAAATGGAAGTGCTACGATGCCCTTCGCAAGATGATCAACTAT 966