Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_00218
• Subject: NM_001037761.2
• Aligned Length: 844
• Identities: 731
• Gaps: 41

Alignment

Query   1  ATGAGTGATCAGCAGCTGGACTGTGCCTTGGACCTAATGAGGCGCCTGCCTCCCCAGCAAATCGAGAAAAACCT  74
           |||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||
Sbjct   1  ATGAGCGATCAGCAGCTGGACTGCGCCTTGGACCTGATGAGGCGCCTGCCTCCACAGCAGATTGAGAAGAACCT  74

Query  75  CAGCGACCTGATCGACCTGGTCCCCAGTCTATGTGAGGATCTCCTGTCTTCTGTTGACCAGCCACTGAAAATTG  148
           ||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  75  CAGCGATCTGATCGACCTGGTCCCCAGTCTGTGTGAAGATCTCCTGTCATCTGTTGACCAGCCCCTGAAAATTG  148

Query 149  CCAGAGACAAGGTGGTGGGAAAGGATTACCTTTTGTGTGACTACAACAGAGATGGGGACTCCTATAGGTCACCA  222
           |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct 149  CCAGAGACAAGGTGGTGGGCAAGGATTACCTTTTGTGTGACTACAACAGAGACGGGGACTCCTATAGGTCACCG  222

Query 223  TGGAGTAACAAGTATGACCCTCCCTTGGAGGATGGGGCCATGCCGTCAGCTCGGCTGAGAAAGCTGGAGGTGGA  296
           |||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||
Sbjct 223  TGGAGTAACAAGTATGACCCTCCTTTGGAAGATGGGGCCATGCCATCTGCTCGGCTCAGAAAGCTGGAGGTAGA  296

Query 297  AGCCAACAATGCCTTTGACCAGTATCGAGACCTGTATTTTGAAGGTGGCGTCTCATCTGTCTACCTCTGGGATC  370
           .||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 297  GGCCAACAATGCCTTCGACCAATACCGAGACCTGTATTTTGAAGGTGGGGTCTCATCAGTCTACCTCTGGGATC  370

Query 371  TGGATCATGGCTTTGCTGGAGTGATCCTCATAAAGAAGGCTGGAGATGGATCAAAGAAGATCAAAGGCTGCTGG  444
           |.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 371  TTGATCATGGCTTTGCTGGAGTGATCCTCATAAAGAAAGCTGGAGATGGATCCAAGAAGATCAAAGGCTGCTGG  444

Query 445  GATTCCATCCACGTGGTAGAAGTGCAGGAGAAATCCAGCGGTCGCACCGCCCATTACAAGTTGACCTCCACGGT  518
           |||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445  GATTCCATCCACGTGGTGGAAGTGCAGGAGAAGTCCAGCGGCCGTACTGCCCATTACAAGTTGACCTCCACGGT  518

Query 519  GATGCTGTGGCTGCAGACCAACAAATCTGGCTCTGGCACCATGAACCTCGGAGGCAGCCTTACCAGACAGATGG  592
           ||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 519  GATGCTATGGCTGCAAACCAACAAATCCGGCTCGGGCACCATGAACCTGGGAGGCAGCCTAACCAGACAGATGG  592

Query 593  AGAAGGATGAAACTGTGAGTGACTGCTCCCCACACATAGCCAACATCGGGCGCCTGGTAGAGGACATGGAAAAT  666
           ||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.
Sbjct 593  AGAAAGACGAAACTGTGAGTGACTGTTCCCCACACATAGCCAACATCGGGCGCCTGGTGGAGGACATGGAAAAC  666

Query 667  AAAATCAGAAGTACGCTGAACGAGATCTACTTTGGAAAAACAAAGGATATCGTCAATGGGCTGAGGTCTGTGCA  740
           ||||||.||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||.|..|
Sbjct 667  AAAATCCGAAGCACGCTGAATGAGATCTACTTTGGAAAAACAAAGGACATCGTCAACGGGCTGAGATCTCTTGA  740

Query 741  GACTTTTGCAGACAAATCAAAACAAG---AAGC--TCTGAAGAATGACCT------GGTGGAGGCTTTGA---A  800
           ..||.|..|.||||    |..|||||   ||||  | ||.|||..||.||      .|||      .|||   |
Sbjct 741  TGCTATCCCCGACA----ACCACAAGTTTAAGCAGT-TGCAGAGGGAACTTTCTCAAGTG------CTGACCCA  803

Query 801  GAGAAAG---------CAGC-----AATGC  816
           |.|..||         ||||     |||  
Sbjct 804  GCGCCAGGTCTACATCCAGCCTGATAAT--  831