Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_00235
- Subject:
- NM_001350669.1
- Aligned Length:
- 2208
- Identities:
- 2064
- Gaps:
- 144
Alignment
Query 1 ATGGGAAATCCAGAAAACATAGAAGATGCATATGTTGCTGTTATTCGTCCAAAGAATACTGCCAGTCTCAATTC 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGGAAATCCAGAAAACATAGAAGATGCATATGTTGCTGTTATTCGTCCAAAGAATACTGCCAGTCTCAATTC 74
Query 75 TCGGGAATACAGAGCTAAGTCATATGAAATTTTGTTGCATGAAGTTCCCATTGAAGGACAGAAAAAAAAGAGAA 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TCGGGAATACAGAGCTAAGTCATATGAAATTTTGTTGCATGAAGTTCCCATTGAAGGACAGAAAAAAAAGAGAA 148
Query 149 AGAAAGTTTTATTGGAAACGAAACTTCAAGGCAACAGTGAAATAACACAAGGCATATTGGATTACGTAGTAGAA 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 AGAAAGTTTTATTGGAAACGAAACTTCAAGGCAACAGTGAAATAACACAAGGCATATTGGATTACGTAGTAGAA 222
Query 223 ACCACCAAACCAATTTCTCCTGCAAACCAGGGTATCAGAGGAAAACGAGTTGTACTAATGAAAAAATTTCCTCT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 ACCACCAAACCAATTTCTCCTGCAAACCAGGGTATCAGAGGAAAACGAGTTGTACTAATGAAAAAATTTCCTCT 296
Query 297 GGATGGAGAGAAGATGGGCAGAGAAGCATCATTATTTATTGTTCCATCAGTTGTCAAAGATAATACTAAATACA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GGATGGAGAGAAGATGGGCAGAGAAGCATCATTATTTATTGTTCCATCAGTTGTCAAAGATAATACTAAATACA 370
Query 371 CATATACCCCAGGATGCCCAATTTTTTACTGCTTACAAGATATTATGCGAGTCTGTAGTGAATCCAGTACTCAT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CATATACCCCAGGATGCCCAATTTTTTACTGCTTACAAGATATTATGCGAGTCTGTAGTGAATCCAGTACTCAT 444
Query 445 TTTGCTACACTTACAGCAAGGATGTTAATAGCCTTGGATAAGTGGTTAGATGAACGTCATGCACAATCTCACTT 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TTTGCTACACTTACAGCAAGGATGTTAATAGCCTTGGATAAGTGGTTAGATGAACGTCATGCACAATCTCACTT 518
Query 519 TATTCCAGCTTTATTCCGACCTTCTCCTCTTGAGCGGATAAAAACTAATGTCATAAATCCTGCATATGCTACTG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TATTCCAGCTTTATTCCGACCTTCTCCTCTTGAGCGGATAAAAACTAATGTCATAAATCCTGCATATGCTACTG 592
Query 593 AATCAGGTCAGACAGAAAACTCACTACATATGGGCTATAGTGCACTAGAAATAAAGAGTAAAATGTTAGCCCTA 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 AATCAGGTCAGACAGAAAACTCACTACATATGGGCTATAGTGCACTAGAAATAAAGAGTAAAATGTTAGCCCTA 666
Query 667 GAGAAAGCAGATACCTGTATTTACAACCCTTTGTTTGGATCAGATCTTCAGTATACAAATCGGGTAGATAAAGT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GAGAAAGCAGATACCTGTATTTACAACCCTTTGTTTGGATCAGATCTTCAGTATACAAATCGGGTAGATAAAGT 740
Query 741 GGTAATAAATCCATACTTTGGTCTAGGAGCTCCAGACTACTCAAAAATCCAAATACCTAAACAGGAAAAATGGC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GGTAATAAATCCATACTTTGGTCTAGGAGCTCCAGACTACTCAAAAATCCAAATACCTAAACAGGAAAAATGGC 814
Query 815 AGAGAAGCATGAGCAGTGTCACAGAAGACAAGGAACGACAGTGGGTAGATGATTTTCCTCTCCACCGAAGCGCC 888
|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 AGAGAAGCATGAGCAGTGTCACAGAAGACAA------------------------------------------- 845
Query 889 TGTGAAGGAGATTCAGAATTACTAAGCCGTCTTCTCAGTGAAAGATTTTCAGTCAACCAGTTAGATAGTGACCA 962
Sbjct 846 -------------------------------------------------------------------------- 845
Query 963 CTGGGCACCCATTCATTATGCATGCTGGTATGGAAAAGTTGAGGCCACTCGCATATTGTTAGAGAAAGGAAAGT 1036
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 846 ---------------------------GTATGGAAAAGTTGAGGCCACTCGCATATTGTTAGAGAAAGGAAAGT 892
Query 1037 GCAATCCAAACCTTTTAAATGGACAACTTAGTTCTCCTCTTCATTTTGCTGCTGGAGGAGGACATGCTGAAATA 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 893 GCAATCCAAACCTTTTAAATGGACAACTTAGTTCTCCTCTTCATTTTGCTGCTGGAGGAGGACATGCTGAAATA 966
Query 1111 GTACAGATTCTCCTAAACCACCCAGAAACGGATAGACATATAACAGACCAACAAGGAAGATCTCCATTAAATAT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 967 GTACAGATTCTCCTAAACCACCCAGAAACGGATAGACATATAACAGACCAACAAGGAAGATCTCCATTAAATAT 1040
Query 1185 TTGTGAAGAAAACAAACAAAACAACTGGGAAGAAGCTGCAAAATTGTTGAAGGAAGCAATTAACAAACCATATG 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1041 TTGTGAAGAAAACAAACAAAACAACTGGGAAGAAGCTGCAAAATTGTTGAAGGAAGCAATTAACAAACCATATG 1114
Query 1259 AAAAAGTTCGAATATACAGAATGGATGGGTCATATCGTTCTGTTGAATTGAAGCATGGAAATAATACCACAGTG 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1115 AAAAAGTTCGAATATACAGAATGGATGGGTCATATCGTTCTGTTGAATTGAAGCATGGAAATAATACCACAGTG 1188
Query 1333 CAGCAGATAATGGAAGGAATGCGTCTCTCTCAAGAAACTCAGCAATATTTCACTATATGGATTTGTTCAGAAAA 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1189 CAGCAGATAATGGAAGGAATGCGTCTCTCTCAAGAAACTCAGCAATATTTCACTATATGGATTTGTTCAGAAAA 1262
Query 1407 CCTCAGCCTTCAACTCAAACCATATCATAAACCCTTGCAACATGTTCGTGACTGGCCAGAAATACTTGCTGAAT 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1263 CCTCAGCCTTCAACTCAAACCATATCATAAACCCTTGCAACATGTTCGTGACTGGCCAGAAATACTTGCTGAAT 1336
Query 1481 TGACTAATCTGGATCCTCAAAGGGAAACACCTCAGCTTTTTCTAAGAAGAGATGTGAGACTTCCCTTGGAAGTT 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1337 TGACTAATCTGGATCCTCAAAGGGAAACACCTCAGCTTTTTCTAAGAAGAGATGTGAGACTTCCCTTGGAAGTT 1410
Query 1555 GAAAAACAGATTGAAGACCCACTAGCTATTCTTATTCTCTTTGATGAAGCCAGATATAATTTATTGAAGGGCTT 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1411 GAAAAACAGATTGAAGACCCACTAGCTATTCTTATTCTCTTTGATGAAGCCAGATATAATTTATTGAAGGGCTT 1484
Query 1629 TTATACAGCTCCTGATGCTAAGCTGATAACATTGGCAAGTCTGCTTTTGCAAATAGTCTATGGAAATTATGAGA 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1485 TTATACAGCTCCTGATGCTAAGCTGATAACATTGGCAAGTCTGCTTTTGCAAATAGTCTATGGAAATTATGAGA 1558
Query 1703 GTAAAAAACACAAGCAAGGTTTCCTAAATGAAGAAAATCTAAAATCCATCGTACCTGTTACCAAACTGAAAAGT 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1559 GTAAAAAACACAAGCAAGGTTTCCTAAATGAAGAAAATCTAAAATCCATCGTACCTGTTACCAAACTGAAAAGT 1632
Query 1777 AAGGCACCTCACTGGACAAATCGCATACTTCATGAATACAAGAATCTCAGTACAAGTGAAGGTGTCAGTAAAGA 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1633 AAGGCACCTCACTGGACAAATCGCATACTTCATGAATACAAGAATCTCAGTACAAGTGAAGGTGTCAGTAAAGA 1706
Query 1851 AATGCATCACCTTCAGCGCATGTTCTTACAGAATTGCTGGGAAATTCCTACTTATGGAGCAGCATTTTTCACAG 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1707 AATGCATCACCTTCAGCGCATGTTCTTACAGAATTGCTGGGAAATTCCTACTTATGGAGCAGCATTTTTCACAG 1780
Query 1925 GACAGATATTTACAAAGGCAAGCCCCAGCAATCATAAAGTCATCCCTGTGTATGTAGGAGTGAATATAAAAGGA 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1781 GACAGATATTTACAAAGGCAAGCCCCAGCAATCATAAAGTCATCCCTGTGTATGTAGGAGTGAATATAAAAGGA 1854
Query 1999 CTTCATCTCCTCAACATGGAAACTAAGGCTTTACTCATCAGTCTTAAGTATGGTTGTTTTATGTGGCAATTGGG 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1855 CTTCATCTCCTCAACATGGAAACTAAGGCTTTACTCATCAGTCTTAAGTATGGTTGTTTTATGTGGCAATTGGG 1928
Query 2073 AGATACTGATACTTGTTTTCAGATCCATAGCATGGAAAATAAAATGAGCTTTATAGTACATACAAAACAGGCTG 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1929 AGATACTGATACTTGTTTTCAGATCCATAGCATGGAAAATAAAATGAGCTTTATAGTACATACAAAACAGGCTG 2002
Query 2147 GTCTCGTGGTAAAACTGTTAATGAAGCTAAATGGACAGTTAATGCCCACTGAAAGAAATTCA 2208
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2003 GTCTCGTGGTAAAACTGTTAATGAAGCTAAATGGACAGTTAATGCCCACTGAAAGAAATTCA 2064