Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_00235
- Subject:
- NM_001350671.1
- Aligned Length:
- 2209
- Identities:
- 1490
- Gaps:
- 716
Alignment
Query 1 ATGGGAAATCCAGAAAACATAGAAGATGCATATGTTGCTGTTATTCGTCCAAAGAATACTGCCAGTCTCAATTC 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 TCGGGAATACAGAGCTAAGTCATATGAAATTTTGTTGCATGAAGTTCCCATTGAAGGACAGAAAAAAAAGAGAA 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 AGAAAGTTTTATTGGAAACGAAACTTCAAGGCAACAGTGAAATAACACAAGGCATATTGGATTACGTAGTAGAA 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 ACCACCAAACCAATTTCTCCTGCAAACCAGGGTATCAGAGGAAAACGAGTTGTACTAATGAAAAAATTTCCTCT 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 GGATGGAGAGAAGATGGGCAGAGAAGCATCATTATTTATTGTTCCATCAGTTGTCAAAGATAATACTAAATACA 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 CATATACCCCAGGATGCCCAATTTTTTACTGCTTACAAGATATTATGCGAGTCTGTAGTGAATCCAGTACTCAT 444
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 445 TTTGCTACACTTACAGCAAGGATGTTAATAGCCTTGGATAAGTGGTTAGATGAACGTCATGCACAATCTCACTT 518
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 519 TATTCCAGCTTTATTCCGACCTTCTCCTCTTGAGCGGATAAAAACTAATGTCATAAATCCTGCATATGCTACTG 592
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 593 AATCAGGTCAGACAGAAAACTCACTACATATGGGCTATAGTGCACTAGAAATAAAGAGTAAAATGTTAGCCCTA 666
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 667 GAGAAAGCAGATACCTGTATTTACAACCCTTTGTTTGGATCAGAT-CTTCAGTATACAAATCGGGTAGATAAAG 739
|| ||.|.| ||||.|||||||||||
Sbjct 1 -------------------------------------------ATGCTACTG------AATCAGGTAGATAAAG 25
Query 740 TGGTAATAAATCCATACTTTGGTCTAGGAGCTCCAGACTACTCAAAAATCCAAATACCTAAACAGGAAAAATGG 813
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 26 TGGTAATAAATCCATACTTTGGTCTAGGAGCTCCAGACTACTCAAAAATCCAAATACCTAAACAGGAAAAATGG 99
Query 814 CAGAGAAGCATGAGCAGTGTCACAGAAGACAAGGAACGACAGTGGGTAGATGATTTTCCTCTCCACCGAAGCGC 887
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 100 CAGAGAAGCATGAGCAGTGTCACAGAAGACAAGGAACGACAGTGGGTAGATGATTTTCCTCTCCACCGAAGCGC 173
Query 888 CTGTGAAGGAGATTCAGAATTACTAAGCCGTCTTCTCAGTGAAAGATTTTCAGTCAACCAGTTAGATAGTGACC 961
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 174 CTGTGAAGGAGATTCAGAATTACTAAGCCGTCTTCTCAGTGAAAGATTTTCAGTCAACCAGTTAGATAGTGACC 247
Query 962 ACTGGGCACCCATTCATTATGCATGCTGGTATGGAAAAGTTGAGGCCACTCGCATATTGTTAGAGAAAGGAAAG 1035
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 248 ACTGGGCACCCATTCATTATGCATGCTGGTATGGAAAAGTTGAGGCCACTCGCATATTGTTAGAGAAAGGAAAG 321
Query 1036 TGCAATCCAAACCTTTTAAATGGACAACTTAGTTCTCCTCTTCATTTTGCTGCTGGAGGAGGACATGCTGAAAT 1109
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 322 TGCAATCCAAACCTTTTAAATGGACAACTTAGTTCTCCTCTTCATTTTGCTGCTGGAGGAGGACATGCTGAAAT 395
Query 1110 AGTACAGATTCTCCTAAACCACCCAGAAACGGATAGACATATAACAGACCAACAAGGAAGATCTCCATTAAATA 1183
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 396 AGTACAGATTCTCCTAAACCACCCAGAAACGGATAGACATATAACAGACCAACAAGGAAGATCTCCATTAAATA 469
Query 1184 TTTGTGAAGAAAACAAACAAAACAACTGGGAAGAAGCTGCAAAATTGTTGAAGGAAGCAATTAACAAACCATAT 1257
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 470 TTTGTGAAGAAAACAAACAAAACAACTGGGAAGAAGCTGCAAAATTGTTGAAGGAAGCAATTAACAAACCATAT 543
Query 1258 GAAAAAGTTCGAATATACAGAATGGATGGGTCATATCGTTCTGTTGAATTGAAGCATGGAAATAATACCACAGT 1331
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 544 GAAAAAGTTCGAATATACAGAATGGATGGGTCATATCGTTCTGTTGAATTGAAGCATGGAAATAATACCACAGT 617
Query 1332 GCAGCAGATAATGGAAGGAATGCGTCTCTCTCAAGAAACTCAGCAATATTTCACTATATGGATTTGTTCAGAAA 1405
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 618 GCAGCAGATAATGGAAGGAATGCGTCTCTCTCAAGAAACTCAGCAATATTTCACTATATGGATTTGTTCAGAAA 691
Query 1406 ACCTCAGCCTTCAACTCAAACCATATCATAAACCCTTGCAACATGTTCGTGACTGGCCAGAAATACTTGCTGAA 1479
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 692 ACCTCAGCCTTCAACTCAAACCATATCATAAACCCTTGCAACATGTTCGTGACTGGCCAGAAATACTTGCTGAA 765
Query 1480 TTGACTAATCTGGATCCTCAAAGGGAAACACCTCAGCTTTTTCTAAGAAGAGATGTGAGACTTCCCTTGGAAGT 1553
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 766 TTGACTAATCTGGATCCTCAAAGGGAAACACCTCAGCTTTTTCTAAGAAGAGATGTGAGACTTCCCTTGGAAGT 839
Query 1554 TGAAAAACAGATTGAAGACCCACTAGCTATTCTTATTCTCTTTGATGAAGCCAGATATAATTTATTGAAGGGCT 1627
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 840 TGAAAAACAGATTGAAGACCCACTAGCTATTCTTATTCTCTTTGATGAAGCCAGATATAATTTATTGAAGGGCT 913
Query 1628 TTTATACAGCTCCTGATGCTAAGCTGATAACATTGGCAAGTCTGCTTTTGCAAATAGTCTATGGAAATTATGAG 1701
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 914 TTTATACAGCTCCTGATGCTAAGCTGATAACATTGGCAAGTCTGCTTTTGCAAATAGTCTATGGAAATTATGAG 987
Query 1702 AGTAAAAAACACAAGCAAGGTTTCCTAAATGAAGAAAATCTAAAATCCATCGTACCTGTTACCAAACTGAAAAG 1775
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 988 AGTAAAAAACACAAGCAAGGTTTCCTAAATGAAGAAAATCTAAAATCCATCGTACCTGTTACCAAACTGAAAAG 1061
Query 1776 TAAGGCACCTCACTGGACAAATCGCATACTTCATGAATACAAGAATCTCAGTACAAGTGAAGGTGTCAGTAAAG 1849
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1062 TAAGGCACCTCACTGGACAAATCGCATACTTCATGAATACAAGAATCTCAGTACAAGTGAAGGTGTCAGTAAAG 1135
Query 1850 AAATGCATCACCTTCAGCGCATGTTCTTACAGAATTGCTGGGAAATTCCTACTTATGGAGCAGCATTTTTCACA 1923
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1136 AAATGCATCACCTTCAGCGCATGTTCTTACAGAATTGCTGGGAAATTCCTACTTATGGAGCAGCATTTTTCACA 1209
Query 1924 GGACAGATATTTACAAAGGCAAGCCCCAGCAATCATAAAGTCATCCCTGTGTATGTAGGAGTGAATATAAAAGG 1997
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1210 GGACAGATATTTACAAAGGCAAGCCCCAGCAATCATAAAGTCATCCCTGTGTATGTAGGAGTGAATATAAAAGG 1283
Query 1998 ACTTCATCTCCTCAACATGGAAACTAAGGCTTTACTCATCAGTCTTAAGTATGGTTGTTTTATGTGGCAATTGG 2071
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1284 ACTTCATCTCCTCAACATGGAAACTAAGGCTTTACTCATCAGTCTTAAGTATGGTTGTTTTATGTGGCAATTGG 1357
Query 2072 GAGATACTGATACTTGTTTTCAGATCCATAGCATGGAAAATAAAATGAGCTTTATAGTACATACAAAACAGGCT 2145
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1358 GAGATACTGATACTTGTTTTCAGATCCATAGCATGGAAAATAAAATGAGCTTTATAGTACATACAAAACAGGCT 1431
Query 2146 GGTCTCGTGGTAAAACTGTTAATGAAGCTAAATGGACAGTTAATGCCCACTGAAAGAAATTCA 2208
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1432 GGTCTCGTGGTAAAACTGTTAATGAAGCTAAATGGACAGTTAATGCCCACTGAAAGAAATTCA 1494