Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_00281
- Subject:
- NM_001346501.2
- Aligned Length:
- 1392
- Identities:
- 873
- Gaps:
- 519
Alignment
Query 1 ATGGACTATGACTTTAAAGTGAAGCTGAGCAGCGAGCGGGAGCGGGTCGAGGACCTGTTTGAATACGAGGGCTG 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CAAAGTTGGCCGAGGCACTTATGGTCACGTCTACAAAGCCAAGAGGAAAGATGGGAAGGATGATAAAGACTATG 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 CTTTAAAACAAATAGAAGGAACTGGGATCTCTATGTCGGCATGTAGAGAAATAGCATTACTTCGAGAGCTTAAG 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 CATCCAAACGTCATTTCTCTTCAAAAGGTGTTTCTGTCTCATGCTGATAGGAAGGTGTGGCTTCTGTTTGACTA 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 TGCTGAACATGACCTCTGGCATATAATCAAGTTTCACAGAGCTTCTAAAGCAAACAAGAAGCCAGTTCAGTTAC 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 CTCGGGGAATGGTGAAGTCACTATTATATCAGATCCTAGATGGTATTCACTACCTGCATGCTAACTGGGTGTTG 444
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 445 CACAGAGATTTGAAACCTGCTAATATTTTAGTTATGGGTGAAGGTCCTGAGCGAGGAAGAGTAAAAATTGCTGA 518
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 519 CATGGGCTTTGCCCGATTATTTAATTCACCTTTGAAGCCTTTAGCAGATTTGGATCCAGTGGTTGTTACATTCT 592
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 -ATGGGCTTTGCCCGATTATTTAATTCACCTTTGAAGCCTTTAGCAGATTTGGATCCAGTGGTTGTTACATTCT 73
Query 593 GGTACCGAGCCCCTGAACTACTTCTTGGAGCAAGGCATTATACCAAAGCTATTGATATTTGGGCTATAGGGTGT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 74 GGTACCGAGCCCCTGAACTACTTCTTGGAGCAAGGCATTATACCAAAGCTATTGATATTTGGGCTATAGGGTGT 147
Query 667 ATATTTGCAGAACTACTAACGTCAGAACCAATATTTCACTGTCGACAAGAGGACATCAAAACTAGTAATCCTTA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 148 ATATTTGCAGAACTACTAACGTCAGAACCAATATTTCACTGTCGACAAGAGGACATCAAAACTAGTAATCCTTA 221
Query 741 TCACCATGACCAGCTGGACAGAATATTCAATGTAATGGGATTTCCTGCAGATAAAGATTGGGAAGATATAAAAA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 222 TCACCATGACCAGCTGGACAGAATATTCAATGTAATGGGATTTCCTGCAGATAAAGATTGGGAAGATATAAAAA 295
Query 815 AGATGCCTGAACATTCAACATTAATGAAAGATTTCAGAAGAAATACGTATACCAACTGCAGCCTTATCAAGTAT 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 296 AGATGCCTGAACATTCAACATTAATGAAAGATTTCAGAAGAAATACGTATACCAACTGCAGCCTTATCAAGTAT 369
Query 889 ATGGAAAAACATAAAGTTAAACCAGATAGTAAAGCATTCCACTTGCTTCAGAAGCTGCTTACCATGGACCCAAT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 370 ATGGAAAAACATAAAGTTAAACCAGATAGTAAAGCATTCCACTTGCTTCAGAAGCTGCTTACCATGGACCCAAT 443
Query 963 AAAGCGAATTACCTCAGAACAGGCTATGCAGGACCCCTATTTCTTAGAAGACCCACTTCCTACATCAGACGTTT 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 444 AAAGCGAATTACCTCAGAACAGGCTATGCAGGACCCCTATTTCTTAGAAGACCCACTTCCTACATCAGACGTTT 517
Query 1037 TTGCCGGTTGTCAAATCCCTTACCCAAAACGAGAATTTTTAACGGAAGAAGAACCTGATGACAAAGGAGACAAA 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 518 TTGCCGGTTGTCAAATCCCTTACCCAAAACGAGAATTTTTAACGGAAGAAGAACCTGATGACAAAGGAGACAAA 591
Query 1111 AAGAACCAGCAGCAGCAGCAGGGCAATAACCACACTAATGGAACTGGCCACCCAGGGAATCAAGACAGCAGTCA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 592 AAGAACCAGCAGCAGCAGCAGGGCAATAACCACACTAATGGAACTGGCCACCCAGGGAATCAAGACAGCAGTCA 665
Query 1185 CACACAGGGACCCCCGTTGAAGAAAGTGAGAGTTGTTCCTCCTACCACTACCTCAGGTGGACTTATCATGACCT 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 666 CACACAGGGACCCCCGTTGAAGAAAGTGAGAGTTGTTCCTCCTACCACTACCTCAGGTGGACTTATCATGACCT 739
Query 1259 CAGACTATCAGCGTTCCAATCCACATGCTGCCTATCCCAACCCTGGACCAAGCACATCACAGCCGCAGAGCAGC 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 740 CAGACTATCAGCGTTCCAATCCACATGCTGCCTATCCCAACCCTGGACCAAGCACATCACAGCCGCAGAGCAGC 813
Query 1333 ATGGGATACTCAGCTACCTCCCAGCAGCCTCCACAGTACTCACATCAGACACATCGGTAC 1392
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 814 ATGGGATACTCAGCTACCTCCCAGCAGCCTCCACAGTACTCACATCAGACACATCGGTAC 873