Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_00281
• Subject: XM_017020317.2
• Aligned Length: 1392
• Identities: 1014
• Gaps: 378

Alignment

Query    1  ATGGACTATGACTTTAAAGTGAAGCTGAGCAGCGAGCGGGAGCGGGTCGAGGACCTGTTTGAATACGAGGGCTG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CAAAGTTGGCCGAGGCACTTATGGTCACGTCTACAAAGCCAAGAGGAAAGATGGGAAGGATGATAAAGACTATG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  CTTTAAAACAAATAGAAGGAACTGGGATCTCTATGTCGGCATGTAGAGAAATAGCATTACTTCGAGAGCTTAAG  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  CATCCAAACGTCATTTCTCTTCAAAAGGTGTTTCTGTCTCATGCTGATAGGAAGGTGTGGCTTCTGTTTGACTA  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  TGCTGAACATGACCTCTGGCATATAATCAAGTTTCACAGAGCTTCTAAAGCAAACAAGAAGCCAGTTCAGTTAC  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  CTCGGGGAATGGTGAAGTCACTATTATATCAGATCCTAGATGGTATTCACTACCTGCATGCTAACTGGGTGTTG  444
                    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  --------ATGGTGAAGTCACTATTATATCAGATCCTAGATGGTATTCACTACCTGCATGCTAACTGGGTGTTG  66

Query  445  CACAGAGATTTGAAACCTGCTAATATTTTAGTTATGGGTGAAGGTCCTGAGCGAGGAAGAGTAAAAATTGCTGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   67  CACAGAGATTTGAAACCTGCTAATATTTTAGTTATGGGTGAAGGTCCTGAGCGAGGAAGAGTAAAAATTGCTGA  140

Query  519  CATGGGCTTTGCCCGATTATTTAATTCACCTTTGAAGCCTTTAGCAGATTTGGATCCAGTGGTTGTTACATTCT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  141  CATGGGCTTTGCCCGATTATTTAATTCACCTTTGAAGCCTTTAGCAGATTTGGATCCAGTGGTTGTTACATTCT  214

Query  593  GGTACCGAGCCCCTGAACTACTTCTTGGAGCAAGGCATTATACCAAAGCTATTGATATTTGGGCTATAGGGTGT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  215  GGTACCGAGCCCCTGAACTACTTCTTGGAGCAAGGCATTATACCAAAGCTATTGATATTTGGGCTATAGGGTGT  288

Query  667  ATATTTGCAGAACTACTAACGTCAGAACCAATATTTCACTGTCGACAAGAGGACATCAAAACTAGTAATCCTTA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  289  ATATTTGCAGAACTACTAACGTCAGAACCAATATTTCACTGTCGACAAGAGGACATCAAAACTAGTAATCCTTA  362

Query  741  TCACCATGACCAGCTGGACAGAATATTCAATGTAATGGGATTTCCTGCAGATAAAGATTGGGAAGATATAAAAA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  363  TCACCATGACCAGCTGGACAGAATATTCAATGTAATGGGATTTCCTGCAGATAAAGATTGGGAAGATATAAAAA  436

Query  815  AGATGCCTGAACATTCAACATTAATGAAAGATTTCAGAAGAAATACGTATACCAACTGCAGCCTTATCAAGTAT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  437  AGATGCCTGAACATTCAACATTAATGAAAGATTTCAGAAGAAATACGTATACCAACTGCAGCCTTATCAAGTAT  510

Query  889  ATGGAAAAACATAAAGTTAAACCAGATAGTAAAGCATTCCACTTGCTTCAGAAGCTGCTTACCATGGACCCAAT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  511  ATGGAAAAACATAAAGTTAAACCAGATAGTAAAGCATTCCACTTGCTTCAGAAGCTGCTTACCATGGACCCAAT  584

Query  963  AAAGCGAATTACCTCAGAACAGGCTATGCAGGACCCCTATTTCTTAGAAGACCCACTTCCTACATCAGACGTTT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  585  AAAGCGAATTACCTCAGAACAGGCTATGCAGGACCCCTATTTCTTAGAAGACCCACTTCCTACATCAGACGTTT  658

Query 1037  TTGCCGGTTGTCAAATCCCTTACCCAAAACGAGAATTTTTAACGGAAGAAGAACCTGATGACAAAGGAGACAAA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  659  TTGCCGGTTGTCAAATCCCTTACCCAAAACGAGAATTTTTAACGGAAGAAGAACCTGATGACAAAGGAGACAAA  732

Query 1111  AAGAACCAGCAGCAGCAGCAGGGCAATAACCACACTAATGGAACTGGCCACCCAGGGAATCAAGACAGCAGTCA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  733  AAGAACCAGCAGCAGCAGCAGGGCAATAACCACACTAATGGAACTGGCCACCCAGGGAATCAAGACAGCAGTCA  806

Query 1185  CACACAGGGACCCCCGTTGAAGAAAGTGAGAGTTGTTCCTCCTACCACTACCTCAGGTGGACTTATCATGACCT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  807  CACACAGGGACCCCCGTTGAAGAAAGTGAGAGTTGTTCCTCCTACCACTACCTCAGGTGGACTTATCATGACCT  880

Query 1259  CAGACTATCAGCGTTCCAATCCACATGCTGCCTATCCCAACCCTGGACCAAGCACATCACAGCCGCAGAGCAGC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  881  CAGACTATCAGCGTTCCAATCCACATGCTGCCTATCCCAACCCTGGACCAAGCACATCACAGCCGCAGAGCAGC  954

Query 1333  ATGGGATACTCAGCTACCTCCCAGCAGCCTCCACAGTACTCACATCAGACACATCGGTAC  1392
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  955  ATGGGATACTCAGCTACCTCCCAGCAGCCTCCACAGTACTCACATCAGACACATCGGTAC  1014