Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_00303
- Subject:
- XM_006498557.2
- Aligned Length:
- 1702
- Identities:
- 1196
- Gaps:
- 404
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGCGGCGCGCTCTGGCAAGATGGCGTCGGCGAGGTCGCGGGGTGCGCGGTGAGCGCCGGCCGCCGTCGCTCCG 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 CCCGGCCGGTCGCGCCTCAGGTCCGCCCGCCCGCGCGCGCCCCGCGGGCCCATGGCGGCGACAGGTGCGGGCGC 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 GCGGCGGCTTGCCGGGCTGCCGCGGGCCGGGCGCGCCCCTCGCTAACGCGCGCGTAACTTTTCCTCGCTGCGGC 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 CCCCCGCGGCCTCCGCGCCACGCCCCCCGGGCCGCCGCCCCGCCGAGGTGCCGTCTGCCGGCCGCCGCGGGAGC 296
Query 1 ----------------------------ATGGCCCTGACCCTGTTTGATACAGATGAATATAGACCTCCTGTTT 46
|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GAGGAGCGCTGGGCGGCGCGGCTCCACCATGGCTCTGACCCTGTTCGATACAGATGAATATAGACCTCCTGTTT 370
Query 47 GGAAATCTTACTTATATCAGCTACAACAGGAAGCCCCTCATCCTCGAAGAATTACCTGTACTTGCGAGGTGGAA 120
||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||..|.|||||.|||||.|||||.|||
Sbjct 371 GGAAATCTTACTTATACCAGCTGCAGCAGGAAGCCCCTCACCCTCGAAGGGTCACCTGCACTTGTGAGGTAGAA 444
Query 121 AACAGACCAAAGTATTATGGAAGAGAGTTTCATGGCATGATCTCCAGAGAAGCAG-CCGACCAGCTCTTGATTG 193
||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||| || |.|||||||||.|||.||
Sbjct 445 AACAGACCAAAGTATTATGGAAGAGAGTATCATGGCATGATCTCTAGAGAAG-AGACTGACCAGCTCCTGAGTG 517
Query 194 TGGCTGAGGGGAGCTACCTCATCCGGGAGAGCCAGCGGCAGCCAGGGACCTACACTTTGGCTTTAAGATTTGGA 267
|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 518 TGGCTGAGGGGAGCTACCTCATCCGTGAGAGCCAGCGGCAGCCAGGAACGTACACTTTGGCTTTAAGATTTGGA 591
Query 268 AGTCAAACCAGAAACTTCAGGCTCTACTACGATGGCAAGCACTTTGTTGGGGAGAAACGCTTTGAGTCCATCCA 341
|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 592 AGTCAGACCAGAAACTTCAGGCTGTACTACGATGGAAAGCACTTTGTTGGGGAGAAACGCTTTGAGTCCATCCA 665
Query 342 CGATCTGGTGACTGATGGCTTGATTACTCTCTATATTGAAACCAAGGCAGCAGAATACATTGCCAAGATGACGA 415
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 666 CGATCTGGTGACTGATGGCTTGATTACTCTCTATATTGAAACCAAGGCAGCAGAATACATTGCCAAGATGACGA 739
Query 416 TAAACCCAATTTATGAGCACGTAGGATACACAACCTTAAACAGAGAGCCAGCATACAAAAAACATATGCCAGTC 489
||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||.|||.|||||
Sbjct 740 TAAACCCAATTTATGAGCACATAGGATACACAACCTTAAACAGAGAGCCAGCATACAAACAGCACATGGCAGTC 813
Query 490 CTGAAAGAGACACATGATGAGAGAGATTCTACAGGCCAGGATGGGGTGTCAGAGAAAAGGTTGACATCACTTGT 563
||||||||||||||||||||||.|||..|||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 814 CTGAAAGAGACACATGATGAGAAAGAGGCTACAGGCCAGGATGGGGTATCAGAGAAAAG--------------- 872
Query 564 TAGAAGAGCAACTCTGAAAGAAAACGAGCAAATTCCAAAATATGAAAAGATTCACAATTTCAAGGTGCATACAT 637
|||||||||.|
Sbjct 873 ---------------------------------------------------------------GGTGCATACGT 883
Query 638 TCAGAGGGCCACACTGGTGTGAATACTGTGCCAACTTTATGTGGGGTCTCATTGCTCAGGGAGTGAAATGTGCA 711
||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 884 TCCGAGGGCCACACTGGTGTGAATACTGTGCCAACTTCATGTGGGGCCTCATTGCTCAGGGAGTGAAATGTGCA 957
Query 712 GATTGTGGTTTGAATGTTCATAAGCAGTGTTCCAAGATGGTCCCAAATGACTGTAAGCCAGACTTGAAGCATGT 785
||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||..|||||||.||
Sbjct 958 GATTGTGGGTTGAATGTTCACAAGCAGTGTTCCAAGATGGTCCCCAATGACTGTAAGCCAGATCTGAAGCACGT 1031
Query 786 CAAAAAGGTGTACAGCTGTGACCTTACGACGCTCGTGAAAGCACATACCACTAAGCGGCCAATGGTGGTAGACA 859
.||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||.|.|||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1032 GAAGAAGGTGTACAGCTGTGACCTGACAACGCTCGTGAAAGCTCACATCACCAAGCGGCCAATGGTGGTAGACA 1105
Query 860 TGTGCATCAGGGAGATTGAGTCTAGAGGTCTTAATTCTGAAGGACTATACCGAGTATCAGGATTTAGTGACCTA 933
||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.
Sbjct 1106 TGTGCATCAGGGAGATCGAGTCCAGAGGTCTTAATTCTGAAGGACTCTACCGAGTGTCAGGATTTAGTGACCTG 1179
Query 934 ATTGAAGATGTCAAGATGGCTTTCGACAGAGATGGTGAGAAGGCAGATATTTCTGTGAACATGTATGAAGATAT 1007
|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct 1180 ATTGAAGATGTCAAGATGGCTTTTGATAGAGATGGTGAGAAGGCGGATATTTCTGTGAACATGTATGAGGACAT 1253
Query 1008 CAACATTATCACTGGTGCACTTAAACTGTACTTCAGGGATTTGCCAATTCCACTCATTACATATGATGCCTACC 1081
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||.|||||.||||||||||
Sbjct 1254 CAACATTATCACTGGTGCACTTAAACTGTACTTCAGGGATCTGCCAATTCCTCTCATCACATACGATGCCTACC 1327
Query 1082 CTAAGTTTATAGAATCTGCCAAAATTATGGATCCGGATGAGCAATTGGAAACCCTTCATGAAGCACTGAAACTA 1155
|.|||||.||.||.|||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||.||||||||||.|...
Sbjct 1328 CCAAGTTCATTGAGTCTGCCAAAATTATGGACCCTGACGAGCAATTGGAGACCCTTCACGAAGCACTGAGATCG 1401
Query 1156 CTGCCACCTGCTCACTGCGAAACCCTCCGGTACCTCATGGCACATCTAAAGAGAGTGACCCTCCACGAAAAGGA 1229
|||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.||.|||||
Sbjct 1402 CTGCCGCCTGCCCACTGCGAGACGCTCCGGTACCTCATGGCGCATCTCAAGAGAGTGACCCTTCATGAGAAGGA 1475
Query 1230 GAATCTTATGAATGCAGAGAACCTTGGAATCGTCTTTGGACCCACCCTTATGAGATCTCCAGAACTAGACGCCA 1303
||||||.||||.|||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||.||.|||.|||
Sbjct 1476 GAATCTGATGAGTGCAGAGAACCTTGGGATCGTGTTTGGACCAACCCTCATGAGATCCCCAGAGCTCGACCCCA 1549
Query 1304 TGGCTGCATTGAATGATATACGGTATCAGAGACTGGTGGTGGAGCTGCTTATCAAAAACGAAGACATTTTATTT 1377
||||.||..||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1550 TGGCCGCCCTGAACGACATACGCTATCAGAGACTGGTGGTGGAGCTGCTTATCAAAAACGAAGACATTTTATTT 1623
