Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_00322
• Subject: NM_016691.4
• Aligned Length: 2238
• Identities: 2050
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGACTTCTTGGAGGAGCCAATCCCTGGTGTAGGGACCTATGATGATTTCAATACAATTGATTGGGTGAGAGA  74
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGACTTCTTGGAGGAGCCAATCCCTGGTGTAGGGACCTATGATGATTTCAACACAATTGATTGGGTGAGAGA  74

Query   75  GAAGTCTCGAGACCGGGATAGGCACCGAGAGATTACCAATAAAAGCAAAGAGTCAACATGGGCCTTAATTCACA  148
            |||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GAAATCTCGAGACCGAGATAGGCACCGAGAGATTACCAATAAAAGCAAAGAGTCAACATGGGCCTTAATTCACA  148

Query  149  GTGTGAGTGATGCTTTTTCCGGCTGGTTGTTGATGCTCCTTATTGGGCTTTTATCAGGTTCGTTAGCTGGTTTG  222
            |||||||.||||||||.||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||..||
Sbjct  149  GTGTGAGCGATGCTTTCTCTGGTTGGTTGTTAATGCTCCTTATTGGCCTTTTATCAGGTTCCTTAGCTGGCCTG  222

Query  223  ATAGACATCTCTGCTCATTGGATGACAGACTTAAAAGAAGGTATATGCACAGGGGGATTCTGGTTTAACCATGA  296
            |||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  223  ATAGACATCTCTGCTCACTGGATGACAGACTTAAAAGAAGGGATATGTACAGGGGGGTTCTGGTTTAACCATGA  296

Query  297  ACATTGTTGCTGGAACTCTGAGCATGTCACCTTTGAAGAGAGAGACAAATGTCCAGAGTGGAATAGTTGGTCCC  370
            .||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||.|||.|||
Sbjct  297  GCACTGTTGCTGGAATTCTGAGCATGTTACCTTTGAACACAGAGACAAATGTCCAGAGTGGAATAGCTGGGCCC  370

Query  371  AGCTTATCATCAGCACAGATGAGGGAGCCTTTGCCTACATAGTCAATTATTTCATGTACGTCCTCTGGGCTCTC  444
            ||||.|||||||..||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.
Sbjct  371  AGCTCATCATCAATACAGATCAGGGAGCCTTTGCCTACATAGTCAATTACTTCATGTACGTCCTCTGGGCTCTT  444

Query  445  CTATTTGCCTTCCTTGCCGTATCTCTTGTCAAGGTGTTTGCGCCTTATGCCTGTGGCTCTGGAATCCCTGAGAT  518
            ||.|||||.||||||||.||||||||||||||||..|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  445  CTGTTTGCTTTCCTTGCTGTATCTCTTGTCAAGGCATTTGCACCTTATGCCTGTGGTTCTGGAATCCCTGAGAT  518

Query  519  AAAAACTATCTTGAGTGGTTTCATTATTAGGGGCTATTTGGGTAAGTGGACTCTGGTTATCAAAACCATCACCT  592
            .|||||.|||.|||||||||||||||||||.||||||.|||||||||||||.||.||.||||||||.|||||.|
Sbjct  519  CAAAACCATCCTGAGTGGTTTCATTATTAGAGGCTATCTGGGTAAGTGGACCCTTGTCATCAAAACTATCACTT  592

Query  593  TGGTGCTGGCAGTGTCGTCTGGCTTGAGCCTGGGCAAAGAGGGCCCTCTAGTGCACGTGGCTTGCTGCTGTGGG  666
            |||||.||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGGTGTTGGCGGTGTCATCTGGCTTGAGCCTGGGCAAGGAGGGCCCCCTGGTGCACGTGGCTTGCTGCTGTGGG  666

Query  667  AACATCCTGTGCCACTGCTTCAACAAATACAGGAAGAATGAAGCCAAGCGCAGAGAGGTCTTGTCGGCTGCAGC  740
            ||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||
Sbjct  667  AACATCTTGTGCCACTGCTTCAACAAATACCGGAAGAATGAAGCCAAGCGGAGAGAGGTCTTATCAGCTGCAGC  740

Query  741  AGCAGCTGGTGTATCTGTAGCCTTTGGAGCACCTATAGGTGGAGTATTATTCAGCCTTGAAGAGGTCAGCTACT  814
            .||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  741  GGCTGCCGGTGTATCTGTAGCCTTTGGGGCCCCTATTGGTGGAGTATTATTCAGCCTGGAAGAGGTCAGCTACT  814

Query  815  ATTTTCCCCTCAAAACATTGTGGCGTTCATTCTTTGCTGCCTTGGTGGCAGCATTCACTCTACGCTCCATCAAT  888
            |.|||||||||||||||.|.||||||||.|||||.|||||..||||||||||.|||||.||.||||||||||||
Sbjct  815  ACTTTCCCCTCAAAACACTATGGCGTTCTTTCTTCGCTGCTCTGGTGGCAGCGTTCACACTCCGCTCCATCAAT  888

Query  889  CCATTTGGGAACAGCCGCCTGGTACTATTTTATGTGGAGTTTCACACCCCATGGCATCTCTTTGAGCTCGTGCC  962
            |||||.||.|||||||||.|.||.||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CCATTCGGAAACAGCCGCTTAGTTCTGTTTTATGTGGAGTTCCACACCCCGTGGCATCTCTTTGAGCTCGTGCC  962

Query  963  ATTCATTCTGCTGGGCATATTTGGTGGTCTGTGGGGAGCACTGTTTATCCGCACAAACATTGCCTGGTGTCGGA  1036
            |||||||.|.||.||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  ATTCATTGTACTAGGCATATTCGGTGGCCTCTGGGGAGCTCTGTTTATCCGCACAAACATTGCCTGGTGTCGGA  1036

Query 1037  AGCGAAAGACCACCCAGTTGGGCAAGTATCCTGTTATAGAGGTACTCGTCGTGACAGCCATCACTGCCATCCTG  1110
            ||||.||.|||||.||||||||||||||||||||..|.|||||||||.|.|||||.|||||||||||||||.||
Sbjct 1037  AGCGTAAAACCACACAGTTGGGCAAGTATCCTGTCGTCGAGGTACTCATTGTGACGGCCATCACTGCCATCTTG  1110

Query 1111  GCTTTCCCCAATGAATACACTCGGATGAGCACAAGTGAGCTCATTTCTGAGCTGTTTAATGACTGTGGCCTTCT  1184
            |||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||
Sbjct 1111  GCTTTCCCCAATGAATATACCCGGATGAGCACAAGTGAGCTCATTTCTGAGCTGTTCAATGACTGCGGCCTCCT  1184

Query 1185  GGACTCCTCCAAGCTCTGTGATTATGAGAACCGTTTCAACACAAGCAAAGGGGGTGAACTGCCTGACAGACCGG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|
Sbjct 1185  GGACTCCTCCAAGCTCTGTGATTATGAGAACCACTTCAACACAAGCAAAGGCGGTGAGCTGCCTGACAGACCTG  1258

Query 1259  CTGGCGTGGGAGTCTACAGTGCAATGTGGCAGCTGGCTTTAACACTCATACTGAAAATTGTCATTACTATATTC  1332
            ||||||||||..||||||||||.|||||||||||||||.|.|||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1259  CTGGCGTGGGCATCTACAGTGCCATGTGGCAGCTGGCTCTGACACTCATACTGAAAATAGTCATTACTATATTC  1332

Query 1333  ACCTTTGGCATGAAGATCCCTTCTGGCCTCTTTATCCCTAGCATGGCTGTTGGTGCTATAGCAGGTCGACTTCT  1406
            |||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.|||.|
Sbjct 1333  ACCTTTGGCATGAAGATTCCTTCTGGTCTCTTTATCCCCAGCATGGCTGTCGGTGCTATAGCAGGCCGTCTTTT  1406

Query 1407  AGGAGTAGGAATGGAACAGCTGGCTTATTACCACCAGGAATGGACCGTCTTCAATAGCTGGTGTAGTCAGGGAG  1480
            ||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||.|||..|.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  AGGAGTCGGAATGGAGCAACTGGCTTATTACCACCACGACTGGGGCATCTTCAATAGCTGGTGTAGTCAGGGAG  1480

Query 1481  CTGATTGCATCACCCCCGGCCTTTATGCAATGGTTGGGGCTGCAGCCTGCTTAGGTGGGGTGACTCGGATGACT  1554
            |||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CTGATTGTATCACCCCTGGCCTTTATGCCATGGTTGGGGCTGCTGCCTGCTTAGGTGGGGTGACTCGGATGACT  1554

Query 1555  GTTTCTCTTGTTGTCATAATGTTTGAACTGACTGGTGGCTTAGAATACATCGTGCCTCTGATGGCTGCAGCCAT  1628
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||.||.||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1555  GTTTCTCTTGTTGTCATAATGTTTGAACTGACTGGTGGCCTGGAATATATTGTGCCTCTGATGGCTGCAGCTAT  1628

Query 1629  GACAAGCAAGTGGGTGGCAGATGCTCTTGGGCGGGAGGGCATCTATGATGCCCACATCCGTCTCAATGGATACC  1702
            ||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GACAAGCAAGTGGGTGGCCGATGCTCTTGGGCGAGAGGGCATTTATGATGCCCACATCCGTCTCAATGGATACC  1702

Query 1703  CCTTTCTTGAAGCCAAAGAAGAGTTTGCTCATAAGACCCTGGCAATGGATGTGATGAAACCCCGGAGAAATGAT  1776
            ||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.
Sbjct 1703  CCTTTCTTGAAGCCAAAGAAGAATTTGCTCATAAGACTCTGGCAATGGATGTGATGAAGCCCCGGAGAAATGAC  1776

Query 1777  CCTTTGTTGACTGTCCTTACTCAGGACAGTATGACTGTGGAAGATGTAGAGACCATAATCAGTGAAACCACTTA  1850
            ||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct 1777  CCCTTGCTGACTGTCCTTACTCAGGACAGTATGACTGTGGAGGATGTCGAGACCATAATCAGCGAAACCACGTA  1850

Query 1851  CAGTGGCTTCCCAGTGGTGGTATCCCGGGAGTCCCAAAGACTTGTGGGCTTTGTCCTCCGAAGAGATCTCATTA  1924
            |||||||||.||.|||||.||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||
Sbjct 1851  CAGTGGCTTTCCGGTGGTAGTGTCCCGAGAGTCGCAAAGACTTGTAGGCTTTGTTCTTCGAAGAGATCTCATTA  1924

Query 1925  TTTCAATTGAAAATGCTCGAAAGAAACAGGATGGGGTTGTTAGCACTTCCATCATTTATTTCACGGAGCATTCT  1998
            |||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1925  TTTCAATTGAAAATGCTCGGAAGAAACAGGACGGGGTTGTGAGCACTTCCATCATTTATTTCACGGAGCATTCG  1998

Query 1999  CCTCCATTGCCACCATACACTCCACCCACTCTAAAGCTTCGGAACATCCTCGATCTCAGCCCCTTCACTGTGAC  2072
            ||||||.||||.||||||||.|||||.||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  CCTCCAATGCCTCCATACACCCCACCTACCCTGAAGCTTCGGAACATCCTGGACCTCAGCCCCTTCACTGTGAC  2072

Query 2073  TGACCTTACACCCATGGAGATCGTAGTGGATATTTTCCGAAAGCTGGGACTGCGGCAGTGCCTGGTTACACACA  2146
            .||||||||.||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 2073  AGACCTTACGCCAATGGAGATCGTGGTGGACATCTTCCGCAAGCTGGGCCTGCGCCAGTGCCTGGTTACACACA  2146

Query 2147  ACGGGCGATTGCTTGGAATCATTACCAAAAAGGATGTGTTAAAGCATATAGCACAGATGGCGAACCAAGATCCT  2220
            |||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct 2147  ACGGGCGCTTACTTGGAATCATCACCAAAAAGGATGTGTTAAAGCATATAGCACAGATGGCAAACCAAGACCCT  2220

Query 2221  GATTCCATTCTCTTCAAC  2238
            ||||||||||||||||||
Sbjct 2221  GATTCCATTCTCTTCAAC  2238