Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_00322
- Subject:
- XM_006527562.3
- Aligned Length:
- 2484
- Identities:
- 2050
- Gaps:
- 246
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGCCATGTGGCAGGGGAGCTCGGAGTGGAACCCAGGACCTTACATGTTAGGAGCCATGGATAACAGAGGCTT 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 TCATCAGGGGAGTTTTAGTAGCTTCCAGAGCAGCTCTAGTGATGAAGACTTGATGGACATCCCAGGGACTGCTA 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 TGGACTTCTCTATGAGAGATGACGTGCCGCCTTTAGATCGAGAAATAGAAGGGAACAAGTCATACAATGGTGGT 222
Query 1 ------------------------ATGGACTTCTTGGAGGAGCCAATCCCTGGTGTAGGGACCTATGATGATTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GGAATAGGCTCTTCAAATAGAGTCATGGACTTCTTGGAGGAGCCAATCCCTGGTGTAGGGACCTATGATGATTT 296
Query 51 CAATACAATTGATTGGGTGAGAGAGAAGTCTCGAGACCGGGATAGGCACCGAGAGATTACCAATAAAAGCAAAG 124
|||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CAACACAATTGATTGGGTGAGAGAGAAATCTCGAGACCGAGATAGGCACCGAGAGATTACCAATAAAAGCAAAG 370
Query 125 AGTCAACATGGGCCTTAATTCACAGTGTGAGTGATGCTTTTTCCGGCTGGTTGTTGATGCTCCTTATTGGGCTT 198
|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.||||||||.||||||||||||||.|||
Sbjct 371 AGTCAACATGGGCCTTAATTCACAGTGTGAGCGATGCTTTCTCTGGTTGGTTGTTAATGCTCCTTATTGGCCTT 444
Query 199 TTATCAGGTTCGTTAGCTGGTTTGATAGACATCTCTGCTCATTGGATGACAGACTTAAAAGAAGGTATATGCAC 272
|||||||||||.||||||||..|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||
Sbjct 445 TTATCAGGTTCCTTAGCTGGCCTGATAGACATCTCTGCTCACTGGATGACAGACTTAAAAGAAGGGATATGTAC 518
Query 273 AGGGGGATTCTGGTTTAACCATGAACATTGTTGCTGGAACTCTGAGCATGTCACCTTTGAAGAGAGAGACAAAT 346
||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||.|.||||||||||
Sbjct 519 AGGGGGGTTCTGGTTTAACCATGAGCACTGTTGCTGGAATTCTGAGCATGTTACCTTTGAACACAGAGACAAAT 592
Query 347 GTCCAGAGTGGAATAGTTGGTCCCAGCTTATCATCAGCACAGATGAGGGAGCCTTTGCCTACATAGTCAATTAT 420
||||||||||||||||.|||.|||||||.|||||||..||||||.||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 593 GTCCAGAGTGGAATAGCTGGGCCCAGCTCATCATCAATACAGATCAGGGAGCCTTTGCCTACATAGTCAATTAC 666
Query 421 TTCATGTACGTCCTCTGGGCTCTCCTATTTGCCTTCCTTGCCGTATCTCTTGTCAAGGTGTTTGCGCCTTATGC 494
|||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||||..|||||.||||||||
Sbjct 667 TTCATGTACGTCCTCTGGGCTCTTCTGTTTGCTTTCCTTGCTGTATCTCTTGTCAAGGCATTTGCACCTTATGC 740
Query 495 CTGTGGCTCTGGAATCCCTGAGATAAAAACTATCTTGAGTGGTTTCATTATTAGGGGCTATTTGGGTAAGTGGA 568
||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||.|||||||||||||||||||.||||||.||||||||||||
Sbjct 741 CTGTGGTTCTGGAATCCCTGAGATCAAAACCATCCTGAGTGGTTTCATTATTAGAGGCTATCTGGGTAAGTGGA 814
Query 569 CTCTGGTTATCAAAACCATCACCTTGGTGCTGGCAGTGTCGTCTGGCTTGAGCCTGGGCAAAGAGGGCCCTCTA 642
|.||.||.||||||||.|||||.||||||.||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||.
Sbjct 815 CCCTTGTCATCAAAACTATCACTTTGGTGTTGGCGGTGTCATCTGGCTTGAGCCTGGGCAAGGAGGGCCCCCTG 888
Query 643 GTGCACGTGGCTTGCTGCTGTGGGAACATCCTGTGCCACTGCTTCAACAAATACAGGAAGAATGAAGCCAAGCG 716
||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 889 GTGCACGTGGCTTGCTGCTGTGGGAACATCTTGTGCCACTGCTTCAACAAATACCGGAAGAATGAAGCCAAGCG 962
Query 717 CAGAGAGGTCTTGTCGGCTGCAGCAGCAGCTGGTGTATCTGTAGCCTTTGGAGCACCTATAGGTGGAGTATTAT 790
.|||||||||||.||.||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||
Sbjct 963 GAGAGAGGTCTTATCAGCTGCAGCGGCTGCCGGTGTATCTGTAGCCTTTGGGGCCCCTATTGGTGGAGTATTAT 1036
Query 791 TCAGCCTTGAAGAGGTCAGCTACTATTTTCCCCTCAAAACATTGTGGCGTTCATTCTTTGCTGCCTTGGTGGCA 864
|||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||.|.||||||||.|||||.|||||..||||||||
Sbjct 1037 TCAGCCTGGAAGAGGTCAGCTACTACTTTCCCCTCAAAACACTATGGCGTTCTTTCTTCGCTGCTCTGGTGGCA 1110
Query 865 GCATTCACTCTACGCTCCATCAATCCATTTGGGAACAGCCGCCTGGTACTATTTTATGTGGAGTTTCACACCCC 938
||.|||||.||.|||||||||||||||||.||.|||||||||.|.||.||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1111 GCGTTCACACTCCGCTCCATCAATCCATTCGGAAACAGCCGCTTAGTTCTGTTTTATGTGGAGTTCCACACCCC 1184
Query 939 ATGGCATCTCTTTGAGCTCGTGCCATTCATTCTGCTGGGCATATTTGGTGGTCTGTGGGGAGCACTGTTTATCC 1012
.||||||||||||||||||||||||||||||.|.||.||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||||
Sbjct 1185 GTGGCATCTCTTTGAGCTCGTGCCATTCATTGTACTAGGCATATTCGGTGGCCTCTGGGGAGCTCTGTTTATCC 1258
Query 1013 GCACAAACATTGCCTGGTGTCGGAAGCGAAAGACCACCCAGTTGGGCAAGTATCCTGTTATAGAGGTACTCGTC 1086
||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||..|.|||||||||.|.
Sbjct 1259 GCACAAACATTGCCTGGTGTCGGAAGCGTAAAACCACACAGTTGGGCAAGTATCCTGTCGTCGAGGTACTCATT 1332
Query 1087 GTGACAGCCATCACTGCCATCCTGGCTTTCCCCAATGAATACACTCGGATGAGCACAAGTGAGCTCATTTCTGA 1160
|||||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GTGACGGCCATCACTGCCATCTTGGCTTTCCCCAATGAATATACCCGGATGAGCACAAGTGAGCTCATTTCTGA 1406
Query 1161 GCTGTTTAATGACTGTGGCCTTCTGGACTCCTCCAAGCTCTGTGATTATGAGAACCGTTTCAACACAAGCAAAG 1234
||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||
Sbjct 1407 GCTGTTCAATGACTGCGGCCTCCTGGACTCCTCCAAGCTCTGTGATTATGAGAACCACTTCAACACAAGCAAAG 1480
Query 1235 GGGGTGAACTGCCTGACAGACCGGCTGGCGTGGGAGTCTACAGTGCAATGTGGCAGCTGGCTTTAACACTCATA 1308
|.|||||.||||||||||||||.|||||||||||..||||||||||.|||||||||||||||.|.|||||||||
Sbjct 1481 GCGGTGAGCTGCCTGACAGACCTGCTGGCGTGGGCATCTACAGTGCCATGTGGCAGCTGGCTCTGACACTCATA 1554
Query 1309 CTGAAAATTGTCATTACTATATTCACCTTTGGCATGAAGATCCCTTCTGGCCTCTTTATCCCTAGCATGGCTGT 1382
||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1555 CTGAAAATAGTCATTACTATATTCACCTTTGGCATGAAGATTCCTTCTGGTCTCTTTATCCCCAGCATGGCTGT 1628
Query 1383 TGGTGCTATAGCAGGTCGACTTCTAGGAGTAGGAATGGAACAGCTGGCTTATTACCACCAGGAATGGACCGTCT 1456
.||||||||||||||.||.|||.|||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||.|||..|.|||
Sbjct 1629 CGGTGCTATAGCAGGCCGTCTTTTAGGAGTCGGAATGGAGCAACTGGCTTATTACCACCACGACTGGGGCATCT 1702
Query 1457 TCAATAGCTGGTGTAGTCAGGGAGCTGATTGCATCACCCCCGGCCTTTATGCAATGGTTGGGGCTGCAGCCTGC 1530
|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||
Sbjct 1703 TCAATAGCTGGTGTAGTCAGGGAGCTGATTGTATCACCCCTGGCCTTTATGCCATGGTTGGGGCTGCTGCCTGC 1776
Query 1531 TTAGGTGGGGTGACTCGGATGACTGTTTCTCTTGTTGTCATAATGTTTGAACTGACTGGTGGCTTAGAATACAT 1604
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||.||
Sbjct 1777 TTAGGTGGGGTGACTCGGATGACTGTTTCTCTTGTTGTCATAATGTTTGAACTGACTGGTGGCCTGGAATATAT 1850
Query 1605 CGTGCCTCTGATGGCTGCAGCCATGACAAGCAAGTGGGTGGCAGATGCTCTTGGGCGGGAGGGCATCTATGATG 1678
.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||
Sbjct 1851 TGTGCCTCTGATGGCTGCAGCTATGACAAGCAAGTGGGTGGCCGATGCTCTTGGGCGAGAGGGCATTTATGATG 1924
Query 1679 CCCACATCCGTCTCAATGGATACCCCTTTCTTGAAGCCAAAGAAGAGTTTGCTCATAAGACCCTGGCAATGGAT 1752
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1925 CCCACATCCGTCTCAATGGATACCCCTTTCTTGAAGCCAAAGAAGAATTTGCTCATAAGACTCTGGCAATGGAT 1998
Query 1753 GTGATGAAACCCCGGAGAAATGATCCTTTGTTGACTGTCCTTACTCAGGACAGTATGACTGTGGAAGATGTAGA 1826
||||||||.||||||||||||||.||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||
Sbjct 1999 GTGATGAAGCCCCGGAGAAATGACCCCTTGCTGACTGTCCTTACTCAGGACAGTATGACTGTGGAGGATGTCGA 2072
Query 1827 GACCATAATCAGTGAAACCACTTACAGTGGCTTCCCAGTGGTGGTATCCCGGGAGTCCCAAAGACTTGTGGGCT 1900
||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||.|||||.||.|||||.|||||.|||||||||||.||||
Sbjct 2073 GACCATAATCAGCGAAACCACGTACAGTGGCTTTCCGGTGGTAGTGTCCCGAGAGTCGCAAAGACTTGTAGGCT 2146
Query 1901 TTGTCCTCCGAAGAGATCTCATTATTTCAATTGAAAATGCTCGAAAGAAACAGGATGGGGTTGTTAGCACTTCC 1974
||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct 2147 TTGTTCTTCGAAGAGATCTCATTATTTCAATTGAAAATGCTCGGAAGAAACAGGACGGGGTTGTGAGCACTTCC 2220
Query 1975 ATCATTTATTTCACGGAGCATTCTCCTCCATTGCCACCATACACTCCACCCACTCTAAAGCTTCGGAACATCCT 2048
|||||||||||||||||||||||.||||||.||||.||||||||.|||||.||.||.|||||||||||||||||
Sbjct 2221 ATCATTTATTTCACGGAGCATTCGCCTCCAATGCCTCCATACACCCCACCTACCCTGAAGCTTCGGAACATCCT 2294
Query 2049 CGATCTCAGCCCCTTCACTGTGACTGACCTTACACCCATGGAGATCGTAGTGGATATTTTCCGAAAGCTGGGAC 2122
.||.||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||.|
Sbjct 2295 GGACCTCAGCCCCTTCACTGTGACAGACCTTACGCCAATGGAGATCGTGGTGGACATCTTCCGCAAGCTGGGCC 2368
Query 2123 TGCGGCAGTGCCTGGTTACACACAACGGGCGATTGCTTGGAATCATTACCAAAAAGGATGTGTTAAAGCATATA 2196
||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 TGCGCCAGTGCCTGGTTACACACAACGGGCGCTTACTTGGAATCATCACCAAAAAGGATGTGTTAAAGCATATA 2442
Query 2197 GCACAGATGGCGAACCAAGATCCTGATTCCATTCTCTTCAAC 2238
|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 GCACAGATGGCAAACCAAGACCCTGATTCCATTCTCTTCAAC 2484