Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_00322
- Subject:
- XM_011247446.2
- Aligned Length:
- 2436
- Identities:
- 2050
- Gaps:
- 198
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGGAGCCATGGATAACAGAGGCTTTCATCAGGGGAGTTTTAGTAGCTTCCAGAGCAGCTCTAGTGATGAAGA 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 CTTGATGGACATCCCAGGGACTGCTATGGACTTCTCTATGAGAGATGACGTGCCGCCTTTAGATCGAGAAATAG 148
Query 1 --------------------------------------------------ATGGACTTCTTGGAGGAGCCAATC 24
||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 AAGGGAACAAGTCATACAATGGTGGTGGAATAGGCTCTTCAAATAGAGTCATGGACTTCTTGGAGGAGCCAATC 222
Query 25 CCTGGTGTAGGGACCTATGATGATTTCAATACAATTGATTGGGTGAGAGAGAAGTCTCGAGACCGGGATAGGCA 98
|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 223 CCTGGTGTAGGGACCTATGATGATTTCAACACAATTGATTGGGTGAGAGAGAAATCTCGAGACCGAGATAGGCA 296
Query 99 CCGAGAGATTACCAATAAAAGCAAAGAGTCAACATGGGCCTTAATTCACAGTGTGAGTGATGCTTTTTCCGGCT 172
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.|
Sbjct 297 CCGAGAGATTACCAATAAAAGCAAAGAGTCAACATGGGCCTTAATTCACAGTGTGAGCGATGCTTTCTCTGGTT 370
Query 173 GGTTGTTGATGCTCCTTATTGGGCTTTTATCAGGTTCGTTAGCTGGTTTGATAGACATCTCTGCTCATTGGATG 246
|||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||..|||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 371 GGTTGTTAATGCTCCTTATTGGCCTTTTATCAGGTTCCTTAGCTGGCCTGATAGACATCTCTGCTCACTGGATG 444
Query 247 ACAGACTTAAAAGAAGGTATATGCACAGGGGGATTCTGGTTTAACCATGAACATTGTTGCTGGAACTCTGAGCA 320
|||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 445 ACAGACTTAAAAGAAGGGATATGTACAGGGGGGTTCTGGTTTAACCATGAGCACTGTTGCTGGAATTCTGAGCA 518
Query 321 TGTCACCTTTGAAGAGAGAGACAAATGTCCAGAGTGGAATAGTTGGTCCCAGCTTATCATCAGCACAGATGAGG 394
|||.|||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||||.|||||||..||||||.|||
Sbjct 519 TGTTACCTTTGAACACAGAGACAAATGTCCAGAGTGGAATAGCTGGGCCCAGCTCATCATCAATACAGATCAGG 592
Query 395 GAGCCTTTGCCTACATAGTCAATTATTTCATGTACGTCCTCTGGGCTCTCCTATTTGCCTTCCTTGCCGTATCT 468
|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||||||
Sbjct 593 GAGCCTTTGCCTACATAGTCAATTACTTCATGTACGTCCTCTGGGCTCTTCTGTTTGCTTTCCTTGCTGTATCT 666
Query 469 CTTGTCAAGGTGTTTGCGCCTTATGCCTGTGGCTCTGGAATCCCTGAGATAAAAACTATCTTGAGTGGTTTCAT 542
||||||||||..|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||.|||||||||||||
Sbjct 667 CTTGTCAAGGCATTTGCACCTTATGCCTGTGGTTCTGGAATCCCTGAGATCAAAACCATCCTGAGTGGTTTCAT 740
Query 543 TATTAGGGGCTATTTGGGTAAGTGGACTCTGGTTATCAAAACCATCACCTTGGTGCTGGCAGTGTCGTCTGGCT 616
||||||.||||||.|||||||||||||.||.||.||||||||.|||||.||||||.||||.|||||.|||||||
Sbjct 741 TATTAGAGGCTATCTGGGTAAGTGGACCCTTGTCATCAAAACTATCACTTTGGTGTTGGCGGTGTCATCTGGCT 814
Query 617 TGAGCCTGGGCAAAGAGGGCCCTCTAGTGCACGTGGCTTGCTGCTGTGGGAACATCCTGTGCCACTGCTTCAAC 690
|||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 815 TGAGCCTGGGCAAGGAGGGCCCCCTGGTGCACGTGGCTTGCTGCTGTGGGAACATCTTGTGCCACTGCTTCAAC 888
Query 691 AAATACAGGAAGAATGAAGCCAAGCGCAGAGAGGTCTTGTCGGCTGCAGCAGCAGCTGGTGTATCTGTAGCCTT 764
||||||.|||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||.||.|||||||||||||||||
Sbjct 889 AAATACCGGAAGAATGAAGCCAAGCGGAGAGAGGTCTTATCAGCTGCAGCGGCTGCCGGTGTATCTGTAGCCTT 962
Query 765 TGGAGCACCTATAGGTGGAGTATTATTCAGCCTTGAAGAGGTCAGCTACTATTTTCCCCTCAAAACATTGTGGC 838
|||.||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||.|.||||
Sbjct 963 TGGGGCCCCTATTGGTGGAGTATTATTCAGCCTGGAAGAGGTCAGCTACTACTTTCCCCTCAAAACACTATGGC 1036
Query 839 GTTCATTCTTTGCTGCCTTGGTGGCAGCATTCACTCTACGCTCCATCAATCCATTTGGGAACAGCCGCCTGGTA 912
||||.|||||.|||||..||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.||.|||||||||.|.||.
Sbjct 1037 GTTCTTTCTTCGCTGCTCTGGTGGCAGCGTTCACACTCCGCTCCATCAATCCATTCGGAAACAGCCGCTTAGTT 1110
Query 913 CTATTTTATGTGGAGTTTCACACCCCATGGCATCTCTTTGAGCTCGTGCCATTCATTCTGCTGGGCATATTTGG 986
||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|.||.||||||||.||
Sbjct 1111 CTGTTTTATGTGGAGTTCCACACCCCGTGGCATCTCTTTGAGCTCGTGCCATTCATTGTACTAGGCATATTCGG 1184
Query 987 TGGTCTGTGGGGAGCACTGTTTATCCGCACAAACATTGCCTGGTGTCGGAAGCGAAAGACCACCCAGTTGGGCA 1060
|||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||
Sbjct 1185 TGGCCTCTGGGGAGCTCTGTTTATCCGCACAAACATTGCCTGGTGTCGGAAGCGTAAAACCACACAGTTGGGCA 1258
Query 1061 AGTATCCTGTTATAGAGGTACTCGTCGTGACAGCCATCACTGCCATCCTGGCTTTCCCCAATGAATACACTCGG 1134
||||||||||..|.|||||||||.|.|||||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||.||.|||
Sbjct 1259 AGTATCCTGTCGTCGAGGTACTCATTGTGACGGCCATCACTGCCATCTTGGCTTTCCCCAATGAATATACCCGG 1332
Query 1135 ATGAGCACAAGTGAGCTCATTTCTGAGCTGTTTAATGACTGTGGCCTTCTGGACTCCTCCAAGCTCTGTGATTA 1208
||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 ATGAGCACAAGTGAGCTCATTTCTGAGCTGTTCAATGACTGCGGCCTCCTGGACTCCTCCAAGCTCTGTGATTA 1406
Query 1209 TGAGAACCGTTTCAACACAAGCAAAGGGGGTGAACTGCCTGACAGACCGGCTGGCGTGGGAGTCTACAGTGCAA 1282
||||||||..|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||..||||||||||.|
Sbjct 1407 TGAGAACCACTTCAACACAAGCAAAGGCGGTGAGCTGCCTGACAGACCTGCTGGCGTGGGCATCTACAGTGCCA 1480
Query 1283 TGTGGCAGCTGGCTTTAACACTCATACTGAAAATTGTCATTACTATATTCACCTTTGGCATGAAGATCCCTTCT 1356
||||||||||||||.|.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1481 TGTGGCAGCTGGCTCTGACACTCATACTGAAAATAGTCATTACTATATTCACCTTTGGCATGAAGATTCCTTCT 1554
Query 1357 GGCCTCTTTATCCCTAGCATGGCTGTTGGTGCTATAGCAGGTCGACTTCTAGGAGTAGGAATGGAACAGCTGGC 1430
||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.|||.|||||||.||||||||.||.|||||
Sbjct 1555 GGTCTCTTTATCCCCAGCATGGCTGTCGGTGCTATAGCAGGCCGTCTTTTAGGAGTCGGAATGGAGCAACTGGC 1628
Query 1431 TTATTACCACCAGGAATGGACCGTCTTCAATAGCTGGTGTAGTCAGGGAGCTGATTGCATCACCCCCGGCCTTT 1504
||||||||||||.||.|||..|.||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||
Sbjct 1629 TTATTACCACCACGACTGGGGCATCTTCAATAGCTGGTGTAGTCAGGGAGCTGATTGTATCACCCCTGGCCTTT 1702
Query 1505 ATGCAATGGTTGGGGCTGCAGCCTGCTTAGGTGGGGTGACTCGGATGACTGTTTCTCTTGTTGTCATAATGTTT 1578
||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 ATGCCATGGTTGGGGCTGCTGCCTGCTTAGGTGGGGTGACTCGGATGACTGTTTCTCTTGTTGTCATAATGTTT 1776
Query 1579 GAACTGACTGGTGGCTTAGAATACATCGTGCCTCTGATGGCTGCAGCCATGACAAGCAAGTGGGTGGCAGATGC 1652
|||||||||||||||.|.|||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1777 GAACTGACTGGTGGCCTGGAATATATTGTGCCTCTGATGGCTGCAGCTATGACAAGCAAGTGGGTGGCCGATGC 1850
Query 1653 TCTTGGGCGGGAGGGCATCTATGATGCCCACATCCGTCTCAATGGATACCCCTTTCTTGAAGCCAAAGAAGAGT 1726
|||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1851 TCTTGGGCGAGAGGGCATTTATGATGCCCACATCCGTCTCAATGGATACCCCTTTCTTGAAGCCAAAGAAGAAT 1924
Query 1727 TTGCTCATAAGACCCTGGCAATGGATGTGATGAAACCCCGGAGAAATGATCCTTTGTTGACTGTCCTTACTCAG 1800
|||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||.|||||||||||||||||
Sbjct 1925 TTGCTCATAAGACTCTGGCAATGGATGTGATGAAGCCCCGGAGAAATGACCCCTTGCTGACTGTCCTTACTCAG 1998
Query 1801 GACAGTATGACTGTGGAAGATGTAGAGACCATAATCAGTGAAACCACTTACAGTGGCTTCCCAGTGGTGGTATC 1874
|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||.|||||.||.||
Sbjct 1999 GACAGTATGACTGTGGAGGATGTCGAGACCATAATCAGCGAAACCACGTACAGTGGCTTTCCGGTGGTAGTGTC 2072
Query 1875 CCGGGAGTCCCAAAGACTTGTGGGCTTTGTCCTCCGAAGAGATCTCATTATTTCAATTGAAAATGCTCGAAAGA 1948
|||.|||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 2073 CCGAGAGTCGCAAAGACTTGTAGGCTTTGTTCTTCGAAGAGATCTCATTATTTCAATTGAAAATGCTCGGAAGA 2146
Query 1949 AACAGGATGGGGTTGTTAGCACTTCCATCATTTATTTCACGGAGCATTCTCCTCCATTGCCACCATACACTCCA 2022
|||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||.||||||||.|||
Sbjct 2147 AACAGGACGGGGTTGTGAGCACTTCCATCATTTATTTCACGGAGCATTCGCCTCCAATGCCTCCATACACCCCA 2220
Query 2023 CCCACTCTAAAGCTTCGGAACATCCTCGATCTCAGCCCCTTCACTGTGACTGACCTTACACCCATGGAGATCGT 2096
||.||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||
Sbjct 2221 CCTACCCTGAAGCTTCGGAACATCCTGGACCTCAGCCCCTTCACTGTGACAGACCTTACGCCAATGGAGATCGT 2294
Query 2097 AGTGGATATTTTCCGAAAGCTGGGACTGCGGCAGTGCCTGGTTACACACAACGGGCGATTGCTTGGAATCATTA 2170
.|||||.||.|||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|
Sbjct 2295 GGTGGACATCTTCCGCAAGCTGGGCCTGCGCCAGTGCCTGGTTACACACAACGGGCGCTTACTTGGAATCATCA 2368
Query 2171 CCAAAAAGGATGTGTTAAAGCATATAGCACAGATGGCGAACCAAGATCCTGATTCCATTCTCTTCAAC 2238
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 CCAAAAAGGATGTGTTAAAGCATATAGCACAGATGGCAAACCAAGACCCTGATTCCATTCTCTTCAAC 2436