Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_00322
• Subject: XM_017029258.1
• Aligned Length: 2460
• Identities: 2237
• Gaps: 222

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGCCATGTGGCAGGGTGCCATGGATAACAGAGGCTTTCAGCAGGGGAGTTTTAGTAGCTTCCAGAACAGCTC  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  CAGTGATGAAGACCTGATGGACATTCCAGCAACCGCTATGGATTTCTCCATGAGAGATGATGTTCCTCCCTTAG  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  ACCGAGAAGTAGGAGGTATCATTATTGAGGACAAGTCGTACAATGGTGGAGGAATAGGTTCTTCAAATAGGATC  222

Query    1  ATGGACTTCTTGGAGGAGCCAATCCCTGGTGTAGGGACCTATGATGATTTCAATACAATTGATTGGGTGAGAGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ATGGACTTCTTGGAGGAGCCAATCCCTGGTGTAGGGACCTATGATGATTTCAATACAATTGATTGGGTGAGAGA  296

Query   75  GAAGTCTCGAGACCGGGATAGGCACCGAGAGATTACCAATAAAAGCAAAGAGTCAACATGGGCCTTAATTCACA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GAAGTCTCGAGACCGGGATAGGCACCGAGAGATTACCAATAAAAGCAAAGAGTCAACATGGGCCTTAATTCACA  370

Query  149  GTGTGAGTGATGCTTTTTCCGGCTGGTTGTTGATGCTCCTTATTGGGCTTTTATCAGGTTCGTTAGCTGGTTTG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GTGTGAGTGATGCTTTTTCCGGCTGGTTGTTGATGCTCCTTATTGGGCTTTTATCAGGTTCGTTAGCTGGTTTG  444

Query  223  ATAGACATCTCTGCTCATTGGATGACAGACTTAAAAGAAGGTATATGCACAGGGGGATTCTGGTTTAACCATGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ATAGACATCTCTGCTCATTGGATGACAGACTTAAAAGAAGGTATATGCACAGGGGGATTCTGGTTTAACCATGA  518

Query  297  ACATTGTTGCTGGAACTCTGAGCATGTCACCTTTGAAGAGAGAGACAAATGTCCAGAGTGGAATAGTTGGTCCC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  ACATTGTTGCTGGAACTCTGAGCATGTCACCTTTGAAGAGAGAGACAAATGTCCAGAGTGGAATAGTTGGTCCC  592

Query  371  AGCTTATCATCAGCACAGATGAGGGAGCCTTTGCCTACATAGTCAATTATTTCATGTACGTCCTCTGGGCTCTC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGCTTATCATCAGCACAGATGAGGGAGCCTTTGCCTACATAGTCAATTATTTCATGTACGTCCTCTGGGCTCTC  666

Query  445  CTATTTGCCTTCCTTGCCGTATCTCTTGTCAAGGTGTTTGCGCCTTATGCCTGTGGCTCTGGAATCCCTGAGAT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CTATTTGCCTTCCTTGCCGTATCTCTTGTCAAGGTGTTTGCGCCTTATGCCTGTGGCTCTGGAATCCCTGAGAT  740

Query  519  AAAAACTATCTTGAGTGGTTTCATTATTAGGGGCTATTTGGGTAAGTGGACTCTGGTTATCAAAACCATCACCT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AAAAACTATCTTGAGTGGTTTCATTATTAGGGGCTATTTGGGTAAGTGGACTCTGGTTATCAAAACCATCACCT  814

Query  593  TGGTGCTGGCAGTGTCGTCTGGCTTGAGCCTGGGCAAAGAGGGCCCTCTAGTGCACGTGGCTTGCTGCTGTGGG  666
            ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGGTGCTGGCAGTGTCATCTGGCTTGAGCCTGGGCAAAGAGGGCCCTCTAGTGCACGTGGCTTGCTGCTGTGGG  888

Query  667  AACATCCTGTGCCACTGCTTCAACAAATACAGGAAGAATGAAGCCAAGCGCAGAGAGGTCTTGTCGGCTGCAGC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AACATCCTGTGCCACTGCTTCAACAAATACAGGAAGAATGAAGCCAAGCGCAGAGAGGTCTTGTCGGCTGCAGC  962

Query  741  AGCAGCTGGTGTATCTGTAGCCTTTGGAGCACCTATAGGTGGAGTATTATTCAGCCTTGAAGAGGTCAGCTACT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AGCAGCTGGTGTATCTGTAGCCTTTGGAGCACCTATAGGTGGAGTATTATTCAGCCTTGAAGAGGTCAGCTACT  1036

Query  815  ATTTTCCCCTCAAAACATTGTGGCGTTCATTCTTTGCTGCCTTGGTGGCAGCATTCACTCTACGCTCCATCAAT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ATTTTCCCCTCAAAACATTGTGGCGTTCATTCTTTGCTGCCTTGGTGGCAGCATTCACTCTACGCTCCATCAAT  1110

Query  889  CCATTTGGGAACAGCCGCCTGGTACTATTTTATGTGGAGTTTCACACCCCATGGCATCTCTTTGAGCTCGTGCC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CCATTTGGGAACAGCCGCCTGGTACTATTTTATGTGGAGTTTCACACCCCATGGCATCTCTTTGAGCTCGTGCC  1184

Query  963  ATTCATTCTGCTGGGCATATTTGGTGGTCTGTGGGGAGCACTGTTTATCCGCACAAACATTGCCTGGTGTCGGA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  ATTCATTCTGCTGGGCATATTTGGTGGTCTGTGGGGAGCACTGTTTATCCGCACAAACATTGCCTGGTGTCGGA  1258

Query 1037  AGCGAAAGACCACCCAGTTGGGCAAGTATCCTGTTATAGAGGTACTCGTCGTGACAGCCATCACTGCCATCCTG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AGCGAAAGACCACCCAGTTGGGCAAGTATCCTGTTATAGAGGTACTCGTCGTGACAGCCATCACTGCCATCCTG  1332

Query 1111  GCTTTCCCCAATGAATACACTCGGATGAGCACAAGTGAGCTCATTTCTGAGCTGTTTAATGACTGTGGCCTTCT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GCTTTCCCCAATGAATACACTCGGATGAGCACAAGTGAGCTCATTTCTGAGCTGTTTAATGACTGTGGCCTTCT  1406

Query 1185  GGACTCCTCCAAGCTCTGTGATTATGAGAACCGTTTCAACACAAGCAAAGGGGGTGAACTGCCTGACAGACCGG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GGACTCCTCCAAGCTCTGTGATTATGAGAACCGTTTCAACACAAGCAAAGGGGGTGAACTGCCTGACAGACCGG  1480

Query 1259  CTGGCGTGGGAGTCTACAGTGCAATGTGGCAGCTGGCTTTAACACTCATACTGAAAATTGTCATTACTATATTC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CTGGCGTGGGAGTCTACAGTGCAATGTGGCAGCTGGCTTTAACACTCATACTGAAAATTGTCATTACTATATTC  1554

Query 1333  ACCTTTGGCATGAAGATCCCTTCTGGCCTCTTTATCCCTAGCATGGCTGTTGGTGCTATAGCAGGTCGACTTCT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  ACCTTTGGCATGAAGATCCCTTCTGGCCTCTTTATCCCTAGCATGGCTGTTGGTGCTATAGCAGGTCGACTTCT  1628

Query 1407  AGGAGTAGGAATGGAACAGCTGGCTTATTACCACCAGGAATGGACCGTCTTCAATAGCTGGTGTAGTCAGGGAG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  AGGAGTAGGAATGGAACAGCTGGCTTATTACCACCAGGAATGGACCGTCTTCAATAGCTGGTGTAGTCAGGGAG  1702

Query 1481  CTGATTGCATCACCCCCGGCCTTTATGCAATGGTTGGGGCTGCAGCCTGCTTAGGTGGGGTGACTCGGATGACT  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CTGATTGCATCACCCCCGGCCTTTATGCAATGGTTGGGGCTGCAGCCTGCTTAGGTGGGGTGACTCGGATGACT  1776

Query 1555  GTTTCTCTTGTTGTCATAATGTTTGAACTGACTGGTGGCTTAGAATACATCGTGCCTCTGATGGCTGCAGCCAT  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GTTTCTCTTGTTGTCATAATGTTTGAACTGACTGGTGGCTTAGAATACATCGTGCCTCTGATGGCTGCAGCCAT  1850

Query 1629  GACAAGCAAGTGGGTGGCAGATGCTCTTGGGCGGGAGGGCATCTATGATGCCCACATCCGTCTCAATGGATACC  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GACAAGCAAGTGGGTGGCAGATGCTCTTGGGCGGGAGGGCATCTATGATGCCCACATCCGTCTCAATGGATACC  1924

Query 1703  CCTTTCTTGAAGCCAAAGAAGAGTTTGCTCATAAGACCCTGGCAATGGATGTGATGAAACCCCGGAGAAATGAT  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  CCTTTCTTGAAGCCAAAGAAGAGTTTGCTCATAAGACCCTGGCAATGGATGTGATGAAACCCCGGAGAAATGAT  1998

Query 1777  CCTTTGTTGACTGTCCTTACTCAGGACAGTATGACTGTGGAAGATGTAGAGACCATAATCAGTGAAACCACTTA  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  CCTTTGTTGACTGTCCTTACTCAGGACAGTATGACTGTGGAAGATGTAGAGACCATAATCAGTGAAACCACTTA  2072

Query 1851  CAGTGGCTTCCCAGTGGTGGTATCCCGGGAGTCCCAAAGACTTGTGGGCTTTGTCCTCCGAAGAGATCTCATTA  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  CAGTGGCTTCCCAGTGGTGGTATCCCGGGAGTCCCAAAGACTTGTGGGCTTTGTCCTCCGAAGAGATCTCATTA  2146

Query 1925  TTTCAATTGAAAATGCTCGAAAGAAACAGGATGGGGTTGTTAGCACTTCCATCATTTATTTCACGGAGCATTCT  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  TTTCAATTGAAAATGCTCGAAAGAAACAGGATGGGGTTGTTAGCACTTCCATCATTTATTTCACGGAGCATTCT  2220

Query 1999  CCTCCATTGCCACCATACACTCCACCCACTCTAAAGCTTCGGAACATCCTCGATCTCAGCCCCTTCACTGTGAC  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  CCTCCATTGCCACCATACACTCCACCCACTCTAAAGCTTCGGAACATCCTCGATCTCAGCCCCTTCACTGTGAC  2294

Query 2073  TGACCTTACACCCATGGAGATCGTAGTGGATATTTTCCGAAAGCTGGGACTGCGGCAGTGCCTGGTTACACACA  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  TGACCTTACACCCATGGAGATCGTAGTGGATATTTTCCGAAAGCTGGGACTGCGGCAGTGCCTGGTTACACACA  2368

Query 2147  ACGGGCGATTGCTTGGAATCATTACCAAAAAGGATGTGTTAAAGCATATAGCACAGATGGCGAACCAAGATCCT  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  ACGGGCGATTGCTTGGAATCATTACCAAAAAGGATGTGTTAAAGCATATAGCACAGATGGCGAACCAAGATCCT  2442

Query 2221  GATTCCATTCTCTTCAAC  2238
            ||||||||||||||||||
Sbjct 2443  GATTCCATTCTCTTCAAC  2460