Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_00338
• Subject: NM_009922.4
• Aligned Length: 891
• Identities: 793
• Gaps: 0

Alignment

Query   1  ATGTCCTCTGCTCACTTCAACCGAGGCCCTGCCTACGGGCTGTCAGCCGAGGTTAAGAACAAGCTGGCCCAGAA  74
           |||||.|||||.||.||.||||||||.|||||||||||..||||.||.||.||.||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGTCTTCTGCACATTTTAACCGAGGTCCTGCCTACGGCTTGTCTGCTGAAGTAAAGAACAAGCTGGCCCAGAA  74

Query  75  GTATGACCACCAGCGGGAGCAGGAGCTGAGAGAGTGGATCGAGGGGGTGACAGGCCGTCGCATCGGCAACAACT  148
           .||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||
Sbjct  75  ATACGACCATCAGCGGGAGCAGGAGCTGAGAGAGTGGATTGAGGGGGTGACAGGCCGGCGCATCGGGAACAACT  148

Query 149  TCATGGACGGCCTCAAAGATGGCATCATTCTTTGCGAATTCATCAATAAGCTGCAGCCAGGCTCCGTGAAGAAG  222
           |||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||.|||||||||
Sbjct 149  TCATGGATGGCCTCAAAGACGGGATCATTCTTTGCGAATTTATCAACAAGCTGCAGCCGGGTTCTGTGAAGAAG  222

Query 223  ATCAATGAGTCAACCCAAAATTGGCACCAGCTGGAGAACATCGGCAACTTCATCAAGGCCATCACCAAGTATGG  296
           .|||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct 223  GTCAATGAGTCAACTCAGAACTGGCACCAGCTGGAGAACATAGGTAATTTCATCAAAGCCATTACCAAGTATGG  296

Query 297  GGTGAAGCCCCACGACATTTTTGAGGCCAACGACCTGTTTGAGAACACCAACCATACACAGGTGCAGTCCACCC  370
           ||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.|
Sbjct 297  GGTGAAACCCCACGACATCTTTGAGGCCAACGACCTGTTTGAAAACACCAACCATACACAAGTTCAGTCCACTC  370

Query 371  TCCTGGCTTTGGCCAGCATGGCGAAGACGAAAGGAAACAAGGTGAACGTGGGAGTGAAGTACGCAGAGAAGCAG  444
           ||||||||.|||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||.||||||||.|||||.||||||||.||.
Sbjct 371  TCCTGGCTCTGGCCAGCATGGCCAAGACAAAAGGAAACAAAGTCAATGTGGGAGTCAAGTATGCAGAGAAACAA  444

Query 445  GAGCGGAAATTCGAGCCGGGGAAGCTAAGAGAAGGGCGGAACATCATTGGGCTGCAGATGGGCACCAACAAGTT  518
           |||||||.|||.|||||||.||||.|.||||||||..|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 445  GAGCGGAGATTTGAGCCGGAGAAGTTGAGAGAAGGCAGGAACATCATTGGACTGCAGATGGGCACCAACAAGTT  518

Query 519  TGCCAGCCAGCAGGGCATGACGGCCTATGGCACCCGGCGCCACCTCTACGACCCCAAGCTGGGCACAGACCAGC  592
           ||||||.||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||||||||.||.|||||.|||||.|||||.||||
Sbjct 519  TGCCAGTCAGCAGGGCATGACGGCCTACGGTACACGGCGTCACCTCTATGATCCCAAACTGGGTACAGATCAGC  592

Query 593  CTCTGGACCAGGCGACCATCAGCCTGCAGATGGGCACCAACAAAGGAGCCAGCCAGGCTGGCATGACTGCGCCA  666
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 593  CTCTGGACCAGGCGACCATCAGCCTGCAGATGGGCACCAACAAGGGTGCCAGCCAGGCTGGCATGACTGCACCA  666

Query 667  GGGACCAAGCGGCAGATCTTCGAGCCGGGGCTGGGCATGGAGCACTGCGACACGCTCAATGTCAGCCTGCAGAT  740
           ||.|||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||.|||||||
Sbjct 667  GGCACCAAGCGGCAGATCTTTGAGCCAGGTCTGGGCATGGAACACTGCGACACACTCAACGTCAGCTTGCAGAT  740

Query 741  GGGCAGCAACAAGGGCGCCTCGCAGCGGGGCATGACGGTGTATGGGCTGCCACGCCAGGTCTACGACCCCAAGT  814
           |||||||||||||||.|||||.|||.||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||
Sbjct 741  GGGCAGCAACAAGGGGGCCTCCCAGAGGGGCATGACAGTGTATGGGCTTCCTCGCCAGGTGTACGATCCCAAGT  814

Query 815  ACTGTCTGACTCCCGAGTACCCAGAGCTGGGTGAGCCCGCCCACAACCACCACGCACACAACTACTACAATTCC  888
           ||||.||||..||.|||||||||||||||.||||||||.|||||||.||||||.|.||||||||||||||.||.
Sbjct 815  ACTGCCTGAACCCGGAGTACCCAGAGCTGAGTGAGCCCACCCACAATCACCACCCGCACAACTACTACAACTCT  888

Query 889  GCC  891
           |||
Sbjct 889  GCC  891