Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_00343
Subject:
XM_017010248.1
Aligned Length:
2040
Identities:
2040
Gaps:
0

Alignment

Query    1  ATGCTGCCACAAATACCCTTTTTGCTGCTAGTATCCTTGAACTTGGTTCATGGAGTGTTTTACGCTGAACGATA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCTGCCACAAATACCCTTTTTGCTGCTAGTATCCTTGAACTTGGTTCATGGAGTGTTTTACGCTGAACGATA  74

Query   75  CCAAATGCCCACAGGCATAAAAGGCCCACTACCCAACACCAAGACACAGTTCTTCATTCCCTACACCATAAAGA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCAAATGCCCACAGGCATAAAAGGCCCACTACCCAACACCAAGACACAGTTCTTCATTCCCTACACCATAAAGA  148

Query  149  GTAAAGGTATAGCAGTAAGAGGAGAGCAAGGTACTCCTGGTCCACCAGGCCCTGCTGGACCTCGAGGGCACCCA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GTAAAGGTATAGCAGTAAGAGGAGAGCAAGGTACTCCTGGTCCACCAGGCCCTGCTGGACCTCGAGGGCACCCA  222

Query  223  GGTCCTTCTGGACCACCAGGAAAACCAGGCTACGGAAGTCCTGGACTCCAAGGAGAGCCAGGGTTGCCAGGACC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GGTCCTTCTGGACCACCAGGAAAACCAGGCTACGGAAGTCCTGGACTCCAAGGAGAGCCAGGGTTGCCAGGACC  296

Query  297  ACCGGGACCATCAGCTGTAGGGAAACCAGGTGTGCCAGGACTCCCAGGAAAACCAGGAGAGAGAGGACCATATG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ACCGGGACCATCAGCTGTAGGGAAACCAGGTGTGCCAGGACTCCCAGGAAAACCAGGAGAGAGAGGACCATATG  370

Query  371  GACCAAAAGGAGATGTTGGACCAGCTGGCCTACCAGGACCCCGGGGCCCACCAGGACCACCTGGAATCCCTGGA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GACCAAAAGGAGATGTTGGACCAGCTGGCCTACCAGGACCCCGGGGCCCACCAGGACCACCTGGAATCCCTGGA  444

Query  445  CCGGCTGGAATTTCTGTGCCAGGAAAACCTGGACAACAGGGACCCACAGGAGCCCCAGGACCCAGGGGCTTTCC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CCGGCTGGAATTTCTGTGCCAGGAAAACCTGGACAACAGGGACCCACAGGAGCCCCAGGACCCAGGGGCTTTCC  518

Query  519  TGGAGAAAAGGGTGCACCAGGAGTCCCTGGTATGAATGGACAGAAAGGGGAAATGGGATATGGTGCTCCTGGTC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGGAGAAAAGGGTGCACCAGGAGTCCCTGGTATGAATGGACAGAAAGGGGAAATGGGATATGGTGCTCCTGGTC  592

Query  593  GTCCAGGTGAGAGGGGTCTTCCAGGCCCTCAGGGTCCCACAGGACCATCTGGCCCTCCTGGAGTGGGAAAAAGA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GTCCAGGTGAGAGGGGTCTTCCAGGCCCTCAGGGTCCCACAGGACCATCTGGCCCTCCTGGAGTGGGAAAAAGA  666

Query  667  GGTGAAAATGGGGTTCCAGGACAGCCAGGCATCAAAGGTGATAGAGGTTTTCCGGGAGAAATGGGACCAATTGG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GGTGAAAATGGGGTTCCAGGACAGCCAGGCATCAAAGGTGATAGAGGTTTTCCGGGAGAAATGGGACCAATTGG  740

Query  741  CCCACCAGGTCCCCAAGGCCCTCCTGGGGAACGAGGGCCAGAAGGCATTGGAAAGCCAGGAGCTGCTGGAGCCC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CCCACCAGGTCCCCAAGGCCCTCCTGGGGAACGAGGGCCAGAAGGCATTGGAAAGCCAGGAGCTGCTGGAGCCC  814

Query  815  CAGGCCAGCCAGGGATTCCAGGAACAAAAGGTCTCCCTGGGGCTCCAGGAATAGCTGGGCCCCCAGGGCCTCCT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CAGGCCAGCCAGGGATTCCAGGAACAAAAGGTCTCCCTGGGGCTCCAGGAATAGCTGGGCCCCCAGGGCCTCCT  888

Query  889  GGCTTTGGGAAACCAGGCTTGCCAGGCCTGAAGGGAGAAAGAGGACCTGCTGGCCTTCCTGGGGGTCCAGGTGC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GGCTTTGGGAAACCAGGCTTGCCAGGCCTGAAGGGAGAAAGAGGACCTGCTGGCCTTCCTGGGGGTCCAGGTGC  962

Query  963  CAAAGGGGAACAAGGGCCAGCAGGTCTTCCTGGGAAGCCAGGTCTGACTGGACCCCCTGGGAATATGGGACCCC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CAAAGGGGAACAAGGGCCAGCAGGTCTTCCTGGGAAGCCAGGTCTGACTGGACCCCCTGGGAATATGGGACCCC  1036

Query 1037  AAGGACCAAAAGGCATCCCGGGTAGCCATGGTCTCCCAGGCCCTAAAGGTGAGACAGGGCCAGCTGGGCCTGCA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AAGGACCAAAAGGCATCCCGGGTAGCCATGGTCTCCCAGGCCCTAAAGGTGAGACAGGGCCAGCTGGGCCTGCA  1110

Query 1111  GGATACCCTGGGGCTAAGGGTGAAAGGGGTTCCCCTGGGTCAGATGGAAAACCAGGGTACCCAGGAAAACCAGG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GGATACCCTGGGGCTAAGGGTGAAAGGGGTTCCCCTGGGTCAGATGGAAAACCAGGGTACCCAGGAAAACCAGG  1184

Query 1185  TCTCGATGGTCCTAAGGGTAACCCAGGGTTACCAGGTCCAAAAGGTGATCCTGGAGTTGGAGGACCTCCTGGTC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TCTCGATGGTCCTAAGGGTAACCCAGGGTTACCAGGTCCAAAAGGTGATCCTGGAGTTGGAGGACCTCCTGGTC  1258

Query 1259  TCCCAGGCCCTGTGGGCCCAGCAGGAGCAAAGGGAATGCCCGGACACAATGGAGAGGCTGGCCCAAGAGGTGCC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TCCCAGGCCCTGTGGGCCCAGCAGGAGCAAAGGGAATGCCCGGACACAATGGAGAGGCTGGCCCAAGAGGTGCC  1332

Query 1333  CCTGGAATACCAGGTACTAGAGGCCCTATTGGGCCACCAGGCATTCCAGGATTCCCTGGGTCTAAAGGGGATCC  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CCTGGAATACCAGGTACTAGAGGCCCTATTGGGCCACCAGGCATTCCAGGATTCCCTGGGTCTAAAGGGGATCC  1406

Query 1407  AGGAAGTCCCGGTCCTCCTGGCCCAGCTGGCATAGCAACTAAGGGCCTCAATGGACCCACCGGGCCACCAGGGC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  AGGAAGTCCCGGTCCTCCTGGCCCAGCTGGCATAGCAACTAAGGGCCTCAATGGACCCACCGGGCCACCAGGGC  1480

Query 1481  CTCCAGGTCCAAGAGGCCACTCTGGAGAGCCTGGTCTTCCAGGGCCCCCTGGGCCTCCAGGCCCACCAGGTCAA  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CTCCAGGTCCAAGAGGCCACTCTGGAGAGCCTGGTCTTCCAGGGCCCCCTGGGCCTCCAGGCCCACCAGGTCAA  1554

Query 1555  GCAGTCATGCCTGAGGGTTTTATAAAGGCAGGCCAAAGGCCCAGTCTTTCTGGGACCCCTCTTGTTAGTGCCAA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GCAGTCATGCCTGAGGGTTTTATAAAGGCAGGCCAAAGGCCCAGTCTTTCTGGGACCCCTCTTGTTAGTGCCAA  1628

Query 1629  CCAGGGGGTAACAGGAATGCCTGTGTCTGCTTTTACTGTTATTCTCTCCAAAGCTTACCCAGCAATAGGAACTC  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CCAGGGGGTAACAGGAATGCCTGTGTCTGCTTTTACTGTTATTCTCTCCAAAGCTTACCCAGCAATAGGAACTC  1702

Query 1703  CCATACCATTTGATAAAATTTTGTATAACAGGCAACAGCATTATGACCCAAGGACTGGAATCTTTACTTGTCAG  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CCATACCATTTGATAAAATTTTGTATAACAGGCAACAGCATTATGACCCAAGGACTGGAATCTTTACTTGTCAG  1776

Query 1777  ATACCAGGAATATACTATTTTTCATACCACGTGCATGTGAAAGGGACTCATGTTTGGGTAGGCCTGTATAAGAA  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  ATACCAGGAATATACTATTTTTCATACCACGTGCATGTGAAAGGGACTCATGTTTGGGTAGGCCTGTATAAGAA  1850

Query 1851  TGGCACCCCTGTAATGTACACCTATGATGAATACACCAAAGGCTACCTGGATCAGGCTTCAGGGAGTGCCATCA  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  TGGCACCCCTGTAATGTACACCTATGATGAATACACCAAAGGCTACCTGGATCAGGCTTCAGGGAGTGCCATCA  1924

Query 1925  TCGATCTCACAGAAAATGACCAGGTGTGGCTCCAGCTTCCCAATGCCGAGTCAAATGGCCTATACTCCTCTGAG  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  TCGATCTCACAGAAAATGACCAGGTGTGGCTCCAGCTTCCCAATGCCGAGTCAAATGGCCTATACTCCTCTGAG  1998

Query 1999  TATGTCCACTCCTCTTTCTCAGGATTCCTAGTGGCTCCAATG  2040
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  TATGTCCACTCCTCTTTCTCAGGATTCCTAGTGGCTCCAATG  2040