Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_00379
- Subject:
- XM_011245651.1
- Aligned Length:
- 1303
- Identities:
- 1114
- Gaps:
- 71
Alignment
Query 1 ATGGAGCTACGTGTGGGGAACAAGTACCGCCTGGGACGGAAGATCGGGAGCGGGTCCTTCGGAGATATCTACCT 74
||||||.|.||||||||.||.|||||.||||||||.||.||||||||.||.||.|||||.|||||.||||||||
Sbjct 1 ATGGAGTTGCGTGTGGGAAATAAGTATCGCCTGGGCCGAAAGATCGGCAGTGGCTCCTTTGGAGACATCTACCT 74
Query 75 GGGTGCCAACATCGCCTCTGGTGAGGAAGTCGCCATCAAGCTGGAGTGTGTGAAGACAAAGCACCCCCAGCTGC 148
||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.||.||.||||||||.|
Sbjct 75 GGGTGCCAACATTGCCTCTGGTGAGGAAGTAGCCATCAAGCTCGAATGTGTGAAGACGAAACATCCCCAGCTCC 148
Query 149 ACATCGAGAGCAAGTTCTACAAGATGATGCAGGGTGGCGTGGGGATCCCGTCCATCAAGTGGTGCGGAGCTGAG 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 149 ACATCGAGAGCAAGTTCTACAAGATGATGCAGGGCGGAGTGGGGATCCCGTCCATCAAGTGGTGCGGGGCTGAG 222
Query 223 GGCGACTACAACGTGATGGTCATGGAGCTGCTGGGGCCTAGCCTCGAGGACCTGTTCAACTTCTGTTCCCGCAA 296
||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 223 GGAGACTATAACGTGATGGTCATGGAGCTGCTGGGGCCCAGCCTGGAGGACCTCTTCAACTTCTGTTCCCGGAA 296
Query 297 ATTCAGCCTCAAGACGGTGCTGCTCTTGGCCGACCAGATGATCAGCCGCATCGAGTATATCCACTCCAAGAACT 370
.|||||||||||||||||||||.|..|||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct 297 GTTCAGCCTCAAGACGGTGCTGTTGCTGGCCGACCAGATGATCAGCCGCATCGAGTACATACACTCCAAGAACT 370
Query 371 TCATCCACCGGGACGTCAAGCCCGACAACTTCCTCATGGGGCTGGGGAAGAAGGGCAACCTGGTCTACATCATC 444
|||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.
Sbjct 371 TCATCCACCGGGATGTGAAGCCCGACAACTTCCTCATGGGCCTGGGGAAGAAAGGCAACCTGGTGTACATCATT 444
Query 445 GACTTCGGCCTGGCCAAGAAGTACCGGGACGCCCGCACCCACCAGCACATTCCCTACCGGGAAAACAAGAACCT 518
||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GACTTCGGCCTGGCCAAGAAGTACCGCGATGCCCGCACACACCAGCATATTCCCTACCGGGAAAACAAGAACCT 518
Query 519 GACCGGCACGGCCCGCTACGCTTCCATCAACACGCACCTGGGCATTGAGCAAAGCCGTCGAGATGACCTGGAGA 592
|||||||||.||||||||.||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 519 GACCGGCACTGCCCGCTATGCCTCTATCAACACCCACCTGGGCATTGAGCAAAGCCGTCGAGATGACCTAGAGA 592
Query 593 GCCTGGGCTACGTGCTCATGTACTTCAACCTGGGCTCCCTGCCCTGGCAGGGGCTCAAAGCAGCCACCAAGCGC 666
||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct 593 GCTTGGGCTATGTGCTCATGTACTTCAACCTGGGCTCCCTGCCCTGGCAGGGCCTCAAAGCAGCCACCAAGCGT 666
Query 667 CAGAAGTATGAACGGATCAGCGAGAAGAAGATGTCAACGCCCATCGAGGTCCTCTGCAAAGGCTATCCCTCCGA 740
||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 667 CAGAAGTACGAGCGGATTAGCGAGAAGAAGATGTCAACGCCAATCGAGGTCCTCTGCAAAGGCTACCCCTCCGA 740
Query 741 ATTCTCAACATACCTCAACTTCTGCCGCTCCCTGCGGTTTGACGACAAGCCCGACTACTCTTACCTACGTCAGC 814
.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||||||||.|||||.||.||||
Sbjct 741 GTTCTCAACATACCTCAACTTCTGCCGCTCCCTGCGGTTCGATGATAAGCCTGACTACTCCTACCTGCGCCAGC 814
Query 815 TCTTCCGCAACCTCTTCCACCGGCAGGGCTTCTCCTATGACTACGTCTTTGACTGGAACATGCTGAAATTC--- 885
|||||||.||.|||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||
Sbjct 815 TCTTCCGAAATCTCTTTCACCGGCAGGGTTTCTCCTACGACTACGTCTTCGACTGGAACATGCTCAAATTCATG 888
Query 886 ----------------------------------------------------------GGTGCAGCCCGGAATC 901
||||||||||||||||
Sbjct 889 CGGCCCCCCTTCCACCAGCCCCCTGCCCTTCCCTGTGGACGGCCCCAGGACCAGCTAGGGTGCAGCCCGGAATC 962
Query 902 CCGAGGATGTGGACCGGGAGCGGCGAGAACACGAACGCGAGGAGAGGATGGGGCAGCTACGGGGGTCCGCGACC 975
||||||||||.||||||||..|.||.||.||||||||.||.|||||||||||||||.|.||.||||||||||||
Sbjct 963 CCGAGGATGTAGACCGGGAAAGACGGGAGCACGAACGGGAAGAGAGGATGGGGCAGTTGCGAGGGTCCGCGACC 1036
Query 976 CGAGCCCTGCCCCCTGGCCCACCCACGGGGGCCACTGCCAACCGGCTCCGCAGTGCCGCCGAGCCCGTGGCTTC 1049
.||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||
Sbjct 1037 AGAGCCCTGCCCCCTGGCCCACCTACAGGGGCTACCGCCAACCGACTCCGAAGTGCAGCCGAGCCTGTGGCTTC 1110
Query 1050 CACGCCAGCCTCCCGCATCCAGCCGGCTGGCAATACTTCTCCCAGAGCGATCTCGCGGGTCGACCGGGAGAGGA 1123
|||.|||||||||||||||||.|...||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||.|||||||
Sbjct 1111 CACTCCAGCCTCCCGCATCCAACAAACTGGCAATACTTCTCCCAGAGCGATCTCACGGGCCGACCGAGAGAGGA 1184
Query 1124 AGGTGAGTATGAGGCTGCACAGGGGTGCGCCCGCCAACGTCTCCTCCTCAGACCTCACTGGGCGGCAAGAGGTC 1197
|||||||.|||||.||.|||||.|||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 AGGTGAGCATGAGACTCCACAGAGGTGCCCCTGCCAATGTCTCCTCCTCAGACCTCACTGGGCGGCAAGAGGTC 1258
Query 1198 TCCCGGATCCCAGCCTCACAGACAGGACCGCCAGTATTCCGTCTC 1242
||||||.|..||||||||||||||.|...||||.|
Sbjct 1259 TCCCGGCTTGCAGCCTCACAGACAAGCGTGCCATT---------- 1293