Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_00379
- Subject:
- XM_017316657.1
- Aligned Length:
- 1248
- Identities:
- 1119
- Gaps:
- 6
Alignment
Query 1 ATGGAGCTACGTGTGGGGAACAAGTACCGCCTGGGACGGAAGATCGGGAGCGGGTCCTTCGGAGATATCTACCT 74
||||||.|.||||||||.||.|||||.||||||||.||.||||||||.||.||.|||||.|||||.||||||||
Sbjct 1 ATGGAGTTGCGTGTGGGAAATAAGTATCGCCTGGGCCGAAAGATCGGCAGTGGCTCCTTTGGAGACATCTACCT 74
Query 75 GGGTGCCAACATCGCCTCTGGTGAGGAAGTCGCCATCAAGCTGGAGTGTGTGAAGACAAAGCACCCCCAGCTGC 148
||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.||.||.||||||||.|
Sbjct 75 GGGTGCCAACATTGCCTCTGGTGAGGAAGTAGCCATCAAGCTCGAATGTGTGAAGACGAAACATCCCCAGCTCC 148
Query 149 ACATCGAGAGCAAGTTCTACAAGATGATGCAGGGTGGCGTGGGGATCCCGTCCATCAAGTGGTGCGGAGCTGAG 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 149 ACATCGAGAGCAAGTTCTACAAGATGATGCAGGGCGGAGTGGGGATCCCGTCCATCAAGTGGTGCGGGGCTGAG 222
Query 223 GGCGACTACAACGTGATGGTCATGGAGCTGCTGGGGCCTAGCCTCGAGGACCTGTTCAACTTCTGTTCCCGCAA 296
||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 223 GGAGACTATAACGTGATGGTCATGGAGCTGCTGGGGCCCAGCCTGGAGGACCTCTTCAACTTCTGTTCCCGGAA 296
Query 297 ATTCAGCCTCAAGACGGTGCTGCTCTTGGCCGACCAGATGATCAGCCGCATCGAGTATATCCACTCCAAGAACT 370
.|||||||||||||||||||||.|..|||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct 297 GTTCAGCCTCAAGACGGTGCTGTTGCTGGCCGACCAGATGATCAGCCGCATCGAGTACATACACTCCAAGAACT 370
Query 371 TCATCCACCGGGACGTCAAGCCCGACAACTTCCTCATGGGGCTGGGGAAGAAGGGCAACCTGGTCTACATCATC 444
|||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.
Sbjct 371 TCATCCACCGGGATGTGAAGCCCGACAACTTCCTCATGGGCCTGGGGAAGAAAGGCAACCTGGTGTACATCATT 444
Query 445 GACTTCGGCCTGGCCAAGAAGTACCGGGACGCCCGCACCCACCAGCACATTCCCTACCGGGAAAACAAGAACCT 518
||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GACTTCGGCCTGGCCAAGAAGTACCGCGATGCCCGCACACACCAGCATATTCCCTACCGGGAAAACAAGAACCT 518
Query 519 GACCGGCACGGCCCGCTACGCTTCCATCAACACGCACCTGGGCATTGAGCAAAGCCGTCGAGATGACCTGGAGA 592
|||||||||.||||||||.||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 519 GACCGGCACTGCCCGCTATGCCTCTATCAACACCCACCTGGGCATTGAGCAAAGCCGTCGAGATGACCTAGAGA 592
Query 593 GCCTGGGCTACGTGCTCATGTACTTCAACCTGGGCTCCCTGCCCTGGCAGGGGCTCAAAGCAGCCACCAAGCGC 666
||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct 593 GCTTGGGCTATGTGCTCATGTACTTCAACCTGGGCTCCCTGCCCTGGCAGGGCCTCAAAGCAGCCACCAAGCGT 666
Query 667 CAGAAGTATGAACGGATCAGCGAGAAGAAGATGTCAACGCCCATCGAGGTCCTCTGCAAAGGCTATCCCTCCGA 740
||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 667 CAGAAGTACGAGCGGATTAGCGAGAAGAAGATGTCAACGCCAATCGAGGTCCTCTGCAAAGGCTACCCCTCCGA 740
Query 741 ATTCTCAACATACCTCAACTTCTGCCGCTCCCTGCGGTTTGACGACAAGCCCGACTACTCTTACCTACGTCAGC 814
.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||||||||.|||||.||.||||
Sbjct 741 GTTCTCAACATACCTCAACTTCTGCCGCTCCCTGCGGTTCGATGATAAGCCTGACTACTCCTACCTGCGCCAGC 814
Query 815 TCTTCCGCAACCTCTTCCACCGGCAGGGCTTCTCCTATGACTACGTCTTTGACTGGAACATGCTGAAATTCGGT 888
|||||||.||.|||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 815 TCTTCCGAAATCTCTTTCACCGGCAGGGTTTCTCCTACGACTACGTCTTCGACTGGAACATGCTCAAATTCGGT 888
Query 889 GCAGCCCGGAATCCCGAGGATGTGGACCGGGAGCGGCGAGAACACGAACGCGAGGAGAGGATGGGGCAGCTACG 962
|||||||||||||||||||||||.||||||||..|.||.||.||||||||.||.|||||||||||||||.|.||
Sbjct 889 GCAGCCCGGAATCCCGAGGATGTAGACCGGGAAAGACGGGAGCACGAACGGGAAGAGAGGATGGGGCAGTTGCG 962
Query 963 GGGGTCCGCGACCCGAGCCCTGCCCCCTGGCCCACCCACGGGGGCCACTGCCAACCGGCTCCGCAGTGCCGCCG 1036
.||||||||||||.||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||||||||.|||||.|||||.||||
Sbjct 963 AGGGTCCGCGACCAGAGCCCTGCCCCCTGGCCCACCTACAGGGGCTACCGCCAACCGACTCCGAAGTGCAGCCG 1036
Query 1037 AGCCCGTGGCTTCCACGCCAGCCTCCCGCATCCAGCCGGCTGGCAATACTTCTCCCAGAGCGATCTCGCGGGTC 1110
||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|...||||||||||||||||||||||||||||.||||.|
Sbjct 1037 AGCCTGTGGCTTCCACTCCAGCCTCCCGCATCCAACAAACTGGCAATACTTCTCCCAGAGCGATCTCACGGGCC 1110
Query 1111 GACCGGGAGAGGAAGGTGAGTATGAGGCTGCACAGGGGTGCGCCCGCCAACGTCTCCTCCTCAGACCTCACTGG 1184
|||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GACCGAGAGAGGAAGGTGAGCATGAGACTCCACAGAGGTGCCCCTGCCAATGTCTCCTCCTCAGACCTCACTGG 1184
Query 1185 GCGGCAAGAGGTCTCCCGGATCCCAGCCTCACAGACAGGACCGCCAGTATTCCGTCTC------ 1242
|||||||||||||||||||.|..||||||||||||||.|...||||.|...||.|||.
Sbjct 1185 GCGGCAAGAGGTCTCCCGGCTTGCAGCCTCACAGACAAGCGTGCCATTTGACCATCTTGGGAAA 1248