Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_00411
• Subject: NM_000777.5
• Aligned Length: 1514
• Identities: 1352
• Gaps: 13

Alignment

Query    1  ATGGCTCTCATCCCAGACTTGGCCATGGAAACCTGGCTTCTCCTGGCTGTCAGCCTGGTGCTCCTCTATCTATA  74
            ||||..|||||||||.|.|||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGACCTCATCCCAAATTTGGCGGTGGAAACCTGGCTTCTCCTGGCTGTCAGCCTGGTGCTCCTCTATCTATA  74

Query   75  TGGAACCCATTCACATGGACTTTTTAAGAAGCTTGGAATTCCAGGGCCCACACCTCTGCCTTTTTTGGGAAATA  148
            |||.||||.|.||||||||||||||||||..||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.
Sbjct   75  TGGGACCCGTACACATGGACTTTTTAAGAGACTGGGAATTCCAGGGCCCACACCTCTGCCTTTGTTGGGAAATG  148

Query  149  TTTTGTCCTACCATAAGGGCTTTTGTATGTTTGACATGGAATGTCATAAAAAGTATGGAAAAGTGTGGGGCTTT  222
            ||||||||||.|.|.||||..|.||.|..|||||||..||.||..|||||||||||||||||.|||||||....
Sbjct  149  TTTTGTCCTATCGTCAGGGTCTCTGGAAATTTGACACAGAGTGCTATAAAAAGTATGGAAAAATGTGGGGAACG  222

Query  223  TATGATGGTCAACAGCCTGTGCTGGCTATCACAGATCCTGACATGATCAAAACAGTGCTAGTGAAAGAATGTTA  296
            |||||.|||||||..|||||||||||.|||||||||||.|||.||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TATGAAGGTCAACTCCCTGTGCTGGCCATCACAGATCCCGACGTGATCAGAACAGTGCTAGTGAAAGAATGTTA  296

Query  297  TTCTGTCTTCACAAACCGGAGGCCTTTTGGTCCAGTGGGATTTATGAAAAGTGCCATCTCTATAGCTGAGGATG  370
            |||||||||||||||.||.|||.||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  297  TTCTGTCTTCACAAATCGAAGGTCTTTAGGCCCAGTGGGATTTATGAAAAGTGCCATCTCTTTAGCTGAGGATG  370

Query  371  AAGAATGGAAGAGATTACGATCATTGCTGTCTCCAACCTTCACCAGTGGAAAACTCAAGGAGATGGTCCCTATC  444
            ||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||.|||
Sbjct  371  AAGAATGGAAGAGAATACGGTCATTGCTGTCTCCAACCTTCACCAGCGGAAAACTCAAGGAGATGTTCCCCATC  444

Query  445  ATTGCCCAGTATGGAGATGTGTTGGTGAGAAATCTGAGGCGGGAAGCAGAGACAGGCAAGCCTGTCACCTTGAA  518
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||..||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ATTGCCCAGTATGGAGATGTATTGGTGAGAAACTTGAGGCGGGAAGCAGAGAAAGGCAAGCCTGTCACCTTGAA  518

Query  519  AGACGTCTTTGGGGCCTACAGCATGGATGTGATCACTAGCACATCATTTGGAGTGAACATCGACTCTCTCAACA  592
            ||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGACATCTTTGGGGCCTACAGCATGGATGTGATTACTGGCACATCATTTGGAGTGAACATCGACTCTCTCAACA  592

Query  593  ATCCACAAGACCCCTTTGTGGAAAACACCAAGAAGCTTTTAAGATTTGATTTTTTGGATCCATTCTTTCTCTCA  666
            ||||||||||||||||||||||.|.|||.||||||.|..|||.|||||.|||.||.||||||||.|||||||||
Sbjct  593  ATCCACAAGACCCCTTTGTGGAGAGCACTAAGAAGTTCCTAAAATTTGGTTTCTTAGATCCATTATTTCTCTCA  666

Query  667  ATAACAGTCTTTCCATTCCTCATCCCAATTCTTGAAGTATTAAATATCTGTGTGTTTCCAAGAGAAGTTAC---  737
            ||||.|.|||||||||||||.|.||||.||.||||||.|||||||.|||.|.|||||||||   |||.|||   
Sbjct  667  ATAATACTCTTTCCATTCCTTACCCCAGTTTTTGAAGCATTAAATGTCTCTCTGTTTCCAA---AAGATACCAT  737

Query  738  AAATTTTTTAAGAAAATCTGTAAAAAGGATGAAAGAAAGTCGCCTCGAAGATACACAAAAGCACCGAGTGGATT  811
            ||||||||||||.|||||||||||.||.|||||..|||||||||||.|.||.|.|||||||||||||.|.||||
Sbjct  738  AAATTTTTTAAGTAAATCTGTAAACAGAATGAAGAAAAGTCGCCTCAACGACAAACAAAAGCACCGACTAGATT  811

Query  812  TCCTTCAGCTGATGATTGACTCTCAGAATTCAAAAGAAACTGAGTCCCACAAAGCTCTGTCCGATCTGGAGCTC  885
            ||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  812  TCCTTCAGCTGATGATTGACTCCCAGAATTCGAAAGAAACTGAGTCCCACAAAGCTCTGTCTGATCTGGAGCTC  885

Query  886  GTGGCCCAATCAATTATCTTTATTTTTGCTGGCTATGAAACCACGAGCAGTGTTCTCTCCTTCATTATGTATGA  959
            |..|||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||.|.|.|||||
Sbjct  886  GCAGCCCAGTCAATAATCTTCATTTTTGCTGGCTATGAAACCACCAGCAGTGTTCTTTCCTTCACTTTATATGA  959

Query  960  ACTGGCCACTCACCCTGATGTCCAGCAGAAACTGCAGGAGGAAATTGATGCAGTTTTACCCAATAAGGCACCAC  1033
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||.||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  960  ACTGGCCACTCACCCTGATGTCCAGCAGAAACTGCAAAAGGAGATTGATGCAGTTTTGCCCAATAAGGCACCAC  1033

Query 1034  CCACCTATGATACTGTGCTACAGATGGAGTATCTTGACATGGTGGTGAATGAAACGCTCAGATTATTCCCAATT  1107
            |.|||||||||.|.|||.|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||
Sbjct 1034  CTACCTATGATGCCGTGGTACAGATGGAGTACCTTGACATGGTGGTGAATGAAACACTCAGATTATTCCCAGTT  1107

Query 1108  GCTATGAGACTTGAGAGGGTCTGCAAAAAAGATGTTGAGATCAATGGGATGTTCATTCCCAAAGGGGTGGTGGT  1181
            |||||.||||||||||||...|||||.|||||||||||.|||||||||.|.|||||||||||||||....||||
Sbjct 1108  GCTATTAGACTTGAGAGGACTTGCAAGAAAGATGTTGAAATCAATGGGGTATTCATTCCCAAAGGGTCAATGGT  1181

Query 1182  GATGATTCCAAGCTATGCTCTTCACCGTGACCCAAAGTACTGGACAGAGCCTGAGAAGTTCCTCCCTGAAAGAT  1255
            |.|||||||||..|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|||||||||.|
Sbjct 1182  GGTGATTCCAACTTATGCTCTTCACCATGACCCAAAGTACTGGACAGAGCCTGAGGAGTTCCGCCCTGAAAGGT  1255

Query 1256  TCAGCAAGAAGAACAAGGACAACATAGATCCTTACATATACACACCCTTTGGAAGTGGACCCAGAAACTGCATT  1329
            ||||.||||||   |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1256  TCAGTAAGAAG---AAGGACAGCATAGATCCTTACATATACACACCCTTTGGAACTGGACCCAGAAACTGCATT  1326

Query 1330  GGCATGAGGTTTGCTCTCATGAACATGAAACTTGCTCTAATCAGAGTCCTTCAGAACTTCTCCTTCAAACCTTG  1403
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1327  GGCATGAGGTTTGCTCTCATGAACATGAAACTTGCTCTAATCAGAGTCCTTCAGAACTTCTCCTTCAAACCTTG  1400

Query 1404  TAAAGAAACACAGATCCCCCTGAAATTAAGCTTAGG--AGGACTTCTTCAACCAGAAAAACCCGTTGTTCTAAA  1475
            |||||||||||||||||||.||||||||..|  |.|  |||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1401  TAAAGAAACACAGATCCCCTTGAAATTAGAC--ACGCAAGGACTTCTTCAACCAGAAAAACCCATTGTTCTAAA  1472

Query 1476  GGTTGAGTCAAGGGATGGCACCGTAAGTGGAGCC  1509
            |||.||.|||||.|||||.|||.|||||||||..
Sbjct 1473  GGTGGATTCAAGAGATGGAACCCTAAGTGGAGAA  1506