Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_00448
• Subject: NM_021120.4
• Aligned Length: 2451
• Identities: 2451
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGCACAAGCACCAGCACTGCTGTAAGTGCCCTGAGTGCTATGAGGTGACCCGCCTGGCCGCCCTGCGGCGCCT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCACAAGCACCAGCACTGCTGTAAGTGCCCTGAGTGCTATGAGGTGACCCGCCTGGCCGCCCTGCGGCGCCT  74

Query   75  CGAGCCTCCGGGCTACGGCGACTGGCAAGTCCCCGACCCTTACGGGCCAGGTGGGGGCAACGGCGCCAGCGCGG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CGAGCCTCCGGGCTACGGCGACTGGCAAGTCCCCGACCCTTACGGGCCAGGTGGGGGCAACGGCGCCAGCGCGG  148

Query  149  GTTATGGGGGCTACAGCTCGCAGACCTTGCCCTCGCAGGCGGGGGCCACCCCCACCCCTCGCACCAAGGCCAAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GTTATGGGGGCTACAGCTCGCAGACCTTGCCCTCGCAGGCGGGGGCCACCCCCACCCCTCGCACCAAGGCCAAG  222

Query  223  CTCATCCCCACCGGCCGGGATGTGGGGCCGGTGCCTCCTAAGCCAGTCCCGGGCAAGAGCACCCCCAAACTCAA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTCATCCCCACCGGCCGGGATGTGGGGCCGGTGCCTCCTAAGCCAGTCCCGGGCAAGAGCACCCCCAAACTCAA  296

Query  297  CGGCAGCGGCCCCAGCTGGTGGCCAGAGTGCACCTGTACCAACCGGGACTGGTATGAGCAGGTGAATGGCAGTG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CGGCAGCGGCCCCAGCTGGTGGCCAGAGTGCACCTGTACCAACCGGGACTGGTATGAGCAGGTGAATGGCAGTG  370

Query  371  ATGGCATGTTCAAATATGAGGAAATCGTACTTGAGAGGGGCAACTCTGGCCTGGGCTTCAGTATCGCAGGTGGC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATGGCATGTTCAAATATGAGGAAATCGTACTTGAGAGGGGCAACTCTGGCCTGGGCTTCAGTATCGCAGGTGGC  444

Query  445  ATCGACAATCCCCATGTCCCTGATGACCCTGGCATCTTTATTACCAAGATTATCCCTGGTGGAGCAGCTGCCAT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ATCGACAATCCCCATGTCCCTGATGACCCTGGCATCTTTATTACCAAGATTATCCCTGGTGGAGCAGCTGCCAT  518

Query  519  GGATGGGAGGCTGGGGGTGAATGACTGTGTGCTGCGGGTGAATGAGGTGGACGTGTCGGAGGTGGTACACAGCC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGATGGGAGGCTGGGGGTGAATGACTGTGTGCTGCGGGTGAATGAGGTGGACGTGTCGGAGGTGGTACACAGCC  592

Query  593  GGGCGGTGGAGGCGCTGAAGGAGGCAGGCCCTGTGGTGCGATTGGTGGTGCGGAGGCGACAGCCTCCACCCGAG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GGGCGGTGGAGGCGCTGAAGGAGGCAGGCCCTGTGGTGCGATTGGTGGTGCGGAGGCGACAGCCTCCACCCGAG  666

Query  667  ACCATCATGGAGGTCAACCTGCTCAAAGGGCCCAAAGGCCTGGGTTTCAGCATTGCTGGGGGTATTGGCAACCA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ACCATCATGGAGGTCAACCTGCTCAAAGGGCCCAAAGGCCTGGGTTTCAGCATTGCTGGGGGTATTGGCAACCA  740

Query  741  GCACATCCCAGGAGACAACAGCATCTACATCACCAAGATCATTGAGGGGGGTGCTGCTCAGAAGGATGGACGCC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GCACATCCCAGGAGACAACAGCATCTACATCACCAAGATCATTGAGGGGGGTGCTGCTCAGAAGGATGGACGCC  814

Query  815  TACAGATTGGGGACCGGCTGCTGGCGGTGAACAACACCAATCTGCAGGATGTGAGGCACGAGGAAGCTGTGGCC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TACAGATTGGGGACCGGCTGCTGGCGGTGAACAACACCAATCTGCAGGATGTGAGGCACGAGGAAGCTGTGGCC  888

Query  889  TCACTGAAGAACACATCTGATATGGTGTATTTGAAGGTGGCCAAGCCAGGCAGCCTCCACCTCAACGACATGTA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TCACTGAAGAACACATCTGATATGGTGTATTTGAAGGTGGCCAAGCCAGGCAGCCTCCACCTCAACGACATGTA  962

Query  963  CGCTCCCCCTGACTACGCCAGCACTTTTACTGCCTTGGCTGACAACCACATAAGCCATAATTCCAGCCTGGGTT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CGCTCCCCCTGACTACGCCAGCACTTTTACTGCCTTGGCTGACAACCACATAAGCCATAATTCCAGCCTGGGTT  1036

Query 1037  ATCTCGGGGCTGTGGAGAGCAAGGTCAGCTACCCTGCTCCTCCTCAGGTTCCCCCCACCCGCTACTCTCCTATT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ATCTCGGGGCTGTGGAGAGCAAGGTCAGCTACCCTGCTCCTCCTCAGGTTCCCCCCACCCGCTACTCTCCTATT  1110

Query 1111  CCCAGGCACATGCTGGCTGAGGAGGACTTCACCAGAGAGCCTCGCAAGATCATCCTGCACAAAGGCTCCACAGG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CCCAGGCACATGCTGGCTGAGGAGGACTTCACCAGAGAGCCTCGCAAGATCATCCTGCACAAAGGCTCCACAGG  1184

Query 1185  CCTGGGCTTCAACATCGTAGGAGGAGAGGATGGAGAAGGCATTTTTGTCTCCTTCATCCTGGCAGGAGGCCCAG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CCTGGGCTTCAACATCGTAGGAGGAGAGGATGGAGAAGGCATTTTTGTCTCCTTCATCCTGGCAGGAGGCCCAG  1258

Query 1259  CTGACCTGAGTGGGGAGCTGCGCAGGGGAGACCGGATCTTATCGGTGAATGGAGTGAATCTGAGGAATGCAACT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CTGACCTGAGTGGGGAGCTGCGCAGGGGAGACCGGATCTTATCGGTGAATGGAGTGAATCTGAGGAATGCAACT  1332

Query 1333  CATGAGCAGGCTGCAGCTGCTCTGAAACGGGCCGGCCAGTCAGTCACCATTGTGGCCCAGTACAGACCTGAAGA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CATGAGCAGGCTGCAGCTGCTCTGAAACGGGCCGGCCAGTCAGTCACCATTGTGGCCCAGTACAGACCTGAAGA  1406

Query 1407  ATACAGTCGCTTTGAATCGAAGATACATGACTTACGAGAACAAATGATGAACAGCAGCATGAGCTCTGGGTCTG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  ATACAGTCGCTTTGAATCGAAGATACATGACTTACGAGAACAAATGATGAACAGCAGCATGAGCTCTGGGTCTG  1480

Query 1481  GGTCCCTCCGAACAAGTGAAAAGAGGTCCTTGTATGTCAGGGCCCTGTTTGATTATGATCGGACTCGGGACAGC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GGTCCCTCCGAACAAGTGAAAAGAGGTCCTTGTATGTCAGGGCCCTGTTTGATTATGATCGGACTCGGGACAGC  1554

Query 1555  TGCCTGCCAAGCCAGGGGCTCAGCTTCTCTTATGGTGACATTCTGCATGTCATTAATGCCTCTGATGATGAGTG  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  TGCCTGCCAAGCCAGGGGCTCAGCTTCTCTTATGGTGACATTCTGCATGTCATTAATGCCTCTGATGATGAGTG  1628

Query 1629  GTGGCAGGCAAGGCTGGTGACCCCACACGGAGAAAGTGAGCAGATCGGTGTGATCCCCAGTAAGAAGAGGGTGG  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GTGGCAGGCAAGGCTGGTGACCCCACACGGAGAAAGTGAGCAGATCGGTGTGATCCCCAGTAAGAAGAGGGTGG  1702

Query 1703  AAAAGAAAGAAAGAGCTCGATTGAAAACTGTGAAGTTCCATGCCAGGACGGGGATGATTGAGTCTAACAGGGAC  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  AAAAGAAAGAAAGAGCTCGATTGAAAACTGTGAAGTTCCATGCCAGGACGGGGATGATTGAGTCTAACAGGGAC  1776

Query 1777  TTCCCGGGGTTAAGTGACGATTATTATGGAGCAAAGAACCTGAAAGGACAAGAGGATGCTATTTTGTCATATGA  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  TTCCCGGGGTTAAGTGACGATTATTATGGAGCAAAGAACCTGAAAGGACAAGAGGATGCTATTTTGTCATATGA  1850

Query 1851  GCCAGTGACACGGCAAGAAATTCACTATGCAAGGCCTGTGATCATCCTGGGCCCAATGAAGGACCGAGTCAATG  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GCCAGTGACACGGCAAGAAATTCACTATGCAAGGCCTGTGATCATCCTGGGCCCAATGAAGGACCGAGTCAATG  1924

Query 1925  ATGACCTGATCTCCGAATTTCCACATAAATTTGGATCCTGTGTGCCACATACTACCCGGCCTCGACGTGATAAT  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  ATGACCTGATCTCCGAATTTCCACATAAATTTGGATCCTGTGTGCCACATACTACCCGGCCTCGACGTGATAAT  1998

Query 1999  GAGGTGGATGGACAAGACTACCACTTTGTGGTGTCCCGAGAACAAATGGAGAAAGATATTCAGGACAACAAGTT  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  GAGGTGGATGGACAAGACTACCACTTTGTGGTGTCCCGAGAACAAATGGAGAAAGATATTCAGGACAACAAGTT  2072

Query 2073  CATCGAGGCGGGCCAATTTAATGATAACCTCTATGGGACCAGCATCCAGTCAGTGCGGGCAGTTGCAGAGAGGG  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  CATCGAGGCGGGCCAATTTAATGATAACCTCTATGGGACCAGCATCCAGTCAGTGCGGGCAGTTGCAGAGAGGG  2146

Query 2147  GCAAGCACTGCATCTTAGATGTTTCCGGCAATGCTATCAAGAGACTGCAGCAAGCACAACTTTACCCCATTGCC  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  GCAAGCACTGCATCTTAGATGTTTCCGGCAATGCTATCAAGAGACTGCAGCAAGCACAACTTTACCCCATTGCC  2220

Query 2221  ATTTTCATCAAGCCCAAGTCCATTGAAGCCCTTATGGAAATGAACCGAAGGCAGACATATGAACAAGCAAATAA  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  ATTTTCATCAAGCCCAAGTCCATTGAAGCCCTTATGGAAATGAACCGAAGGCAGACATATGAACAAGCAAATAA  2294

Query 2295  GATCTATGACAAAGCCATGAAACTGGAGCAGGAATTTGGAGAGTACTTTACAGCCATTGTACAGGGTGACTCAC  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  GATCTATGACAAAGCCATGAAACTGGAGCAGGAATTTGGAGAGTACTTTACAGCCATTGTACAGGGTGACTCAC  2368

Query 2369  TGGAAGAGATTTATAACAAAATCAAACAAATCATTGAGGACCAGTCTGGGCACTACATTTGGGTCCCATCCCCT  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  TGGAAGAGATTTATAACAAAATCAAACAAATCATTGAGGACCAGTCTGGGCACTACATTTGGGTCCCATCCCCT  2442

Query 2443  GAAAAACTC  2451
            |||||||||
Sbjct 2443  GAAAAACTC  2451