Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_00520
Subject:
NM_001163147.1
Aligned Length:
477
Identities:
454
Gaps:
23

Alignment

Query   1  MDGFYDQQVPYMVTNSQRGRNCNEKPTNVRKRKFINRDLAHDSEELFQDLSQLQETWLAEAQVPDNDEQFVPDY  74
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Sbjct   1  MDGFYDQQVPYMVTNSQRGRNCNEKPTNVRKRKFINRDLAHDSEELFQDLSQLQETWLAEAQVPDNDEQFVPDY  74

Query  75  QAESLAFHGLPLKIKKEPHSPCSEISSACSQEQPFKFSYGEKCLYNVSAYDQKPQVGMRPSNPPTPSSTPVSPL  148
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Sbjct  75  QAESLAFHGLPLKIKKEPHSPCSEISSACSQEQPFKFSYGEKCLYNVSAYDQKPQVGMRPSNPPTPSSTPVSPL  148

Query 149  HHASPNSTHTPKPDRAFPAHLPPSQSIPDSSYPMDHRFRRQLSEPCNSFPPLPTMPREGRPMYQRQMSEPNIPF  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  HHASPNSTHTPKPDRAFPAHLPPSQSIPDSSYPMDHRFRRQLSEPCNSFPPLPTMPREGRPMYQRQMSEPNIPF  222

Query 223  PPQGFKQEYHDPVYEHNTMVGSAASQSFPPPLMIKQEPRDFAYDSEVPSCHSIYMRQEGFLAHPSRTEGCMFEK  296
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                       ||||||
Sbjct 223  PPQGFKQEYHDPVYEHNTMVGSAASQSFPPPLMIKQEPRDFAYDS-----------------------GCMFEK  273

Query 297  GPRQFYDDTCVVPEKFDGDIKQEPGMYREGPTYQRRGSLQLWQFLVALLDDPSNSHFIAWTGRGMEFKLIEPEE  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 274  GPRQFYDDTCVVPEKFDGDIKQEPGMYREGPTYQRRGSLQLWQFLVALLDDPSNSHFIAWTGRGMEFKLIEPEE  347

Query 371  VARRWGIQKNRPAMNYDKLSRSLRYYYEKGIMQKVAGERYVYKFVCDPEALFSMAFPDNQRPLLKTDMERHINE  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 348  VARRWGIQKNRPAMNYDKLSRSLRYYYEKGIMQKVAGERYVYKFVCDPEALFSMAFPDNQRPLLKTDMERHINE  421

Query 445  EDTVPLSHFDESMAYMPEGGCCNPHPYNEGYVY  477
           |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 422  EDTVPLSHFDESMAYMPEGGCCNPHPYNEGYVY  454