Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_00520
- Subject:
- XM_011515170.3
- Aligned Length:
- 1438
- Identities:
- 1404
- Gaps:
- 29
Alignment
Query 1 ATGGATGGATTTTATGACCAGCAAGTGCCTTACA------TGG-TCACCAATAGTCAGCGTGGGAGAAATTGTA 67
||||.| .|.||||.|| ||| | ||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 -------------ATGAGC-----TTACCTTTCAGTGATTTGGAT----AAGAGTCAGCGTGGGAGAAATTGTA 52
Query 68 ACGAGAAACCAACAAATGTCAGGAAAAGAAAATTCATTAACAGAGATCTGGCTCATGATTCAGAAGAACTCTTT 141
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 53 ACGAGAAACCAACAAATGTCAGGAAAAGAAAATTCATTAACAGAGATCTGGCTCATGATTCAGAAGAACTCTTT 126
Query 142 CAAGATCTAAGTCAATTACAGGAAACATGGCTTGCAGAAGCTCAGGTACCTGACAATGATGAGCAGTTTGTACC 215
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 127 CAAGATCTAAGTCAATTACAGGAAACATGGCTTGCAGAAGCTCAGGTACCTGACAATGATGAGCAGTTTGTACC 200
Query 216 AGACTATCAGGCTGAAAGTTTGGCTTTTCATGGCCTGCCACTGAAAATCAAGAAAGAACCCCACAGTCCATGTT 289
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 201 AGACTATCAGGCTGAAAGTTTGGCTTTTCATGGCCTGCCACTGAAAATCAAGAAAGAACCCCACAGTCCATGTT 274
Query 290 CAGAAATCAGCTCTGCCTGCAGTCAAGAACAGCCCTTTAAATTCAGCTATGGAGAAAAGTGCCTGTACAATGTC 363
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 275 CAGAAATCAGCTCTGCCTGCAGTCAAGAACAGCCCTTTAAATTCAGCTATGGAGAAAAGTGCCTGTACAATGTC 348
Query 364 AGTGCCTATGATCAGAAGCCACAAGTGGGAATGAGGCCCTCCAACCCCCCCACACCATCCAGCACGCCAGTGTC 437
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 349 AGTGCCTATGATCAGAAGCCACAAGTGGGAATGAGGCCCTCCAACCCCCCCACACCATCCAGCACGCCAGTGTC 422
Query 438 CCCACTGCATCATGCATCTCCAAACTCAACTCATACACCGAAACCTGACCGGGCCTTCCCAGCTCACCTCCCTC 511
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 423 CCCACTGCATCATGCATCTCCAAACTCAACTCATACACCGAAACCTGACCGGGCCTTCCCAGCTCACCTCCCTC 496
Query 512 CATCGCAGTCCATACCAGATAGCAGCTACCCCATGGACCACAGATTTCGCCGCCAGCTTTCTGAACCCTGTAAC 585
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 497 CATCGCAGTCCATACCAGATAGCAGCTACCCCATGGACCACAGATTTCGCCGCCAGCTTTCTGAACCCTGTAAC 570
Query 586 TCCTTTCCTCCTTTGCCGACGATGCCAAGGGAAGGACGTCCTATGTACCAACGCCAGATGTCTGAGCCAAACAT 659
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 571 TCCTTTCCTCCTTTGCCGACGATGCCAAGGGAAGGACGTCCTATGTACCAACGCCAGATGTCTGAGCCAAACAT 644
Query 660 CCCCTTCCCACCACAAGGCTTTAAGCAGGAGTACCACGACCCAGTGTATGAACACAACACCATGGTTGGCAGTG 733
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 645 CCCCTTCCCACCACAAGGCTTTAAGCAGGAGTACCACGACCCAGTGTATGAACACAACACCATGGTTGGCAGTG 718
Query 734 CGGCCAGCCAAAGCTTTCCCCCTCCTCTGATGATTAAACAGGAACCCAGAGATTTTGCATATGACTCAGAAGTG 807
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 719 CGGCCAGCCAAAGCTTTCCCCCTCCTCTGATGATTAAACAGGAACCCAGAGATTTTGCATATGACTCAGAAGTG 792
Query 808 CCTAGCTGCCACTCCATTTATATGAGGCAAGAAGGCTTCCTGGCTCATCCCAGCAGAACAGAAGGCTGTATGTT 881
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 793 CCTAGCTGCCACTCCATTTATATGAGGCAAGAAGGCTTCCTGGCTCATCCCAGCAGAACAGAAGGCTGTATGTT 866
Query 882 TGAAAAGGGCCCCAGGCAGTTTTATGATGACACCTGTGTTGTCCCAGAAAAATTCGATGGAGACATCAAACAAG 955
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 867 TGAAAAGGGCCCCAGGCAGTTTTATGATGACACCTGTGTTGTCCCAGAAAAATTCGATGGAGACATCAAACAAG 940
Query 956 AGCCAGGAATGTATCGGGAAGGACCCACATACCAACGGCGAGGATCACTTCAGCTCTGGCAGTTTTTGGTAGCT 1029
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 941 AGCCAGGAATGTATCGGGAAGGACCCACATACCAACGGCGAGGATCACTTCAGCTCTGGCAGTTTTTGGTAGCT 1014
Query 1030 CTTCTGGATGACCCTTCAAATTCTCATTTTATTGCCTGGACTGGTCGAGGCATGGAATTTAAACTGATTGAGCC 1103
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1015 CTTCTGGATGACCCTTCAAATTCTCATTTTATTGCCTGGACTGGTCGAGGCATGGAATTTAAACTGATTGAGCC 1088
Query 1104 TGAAGAGGTGGCCCGACGTTGGGGCATTCAGAAAAACAGGCCAGCTATGAACTATGATAAACTTAGCCGTTCAC 1177
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1089 TGAAGAGGTGGCCCGACGTTGGGGCATTCAGAAAAACAGGCCAGCTATGAACTATGATAAACTTAGCCGTTCAC 1162
Query 1178 TCCGCTATTACTATGAGAAAGGAATTATGCAAAAGGTGGCTGGAGAGAGATATGTCTACAAGTTTGTGTGTGAT 1251
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1163 TCCGCTATTACTATGAGAAAGGAATTATGCAAAAGGTGGCTGGAGAGAGATATGTCTACAAGTTTGTGTGTGAT 1236
Query 1252 CCAGAAGCCCTTTTCTCCATGGCCTTTCCAGATAATCAGCGTCCACTGCTGAAGACAGACATGGAACGTCACAT 1325
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1237 CCAGAAGCCCTTTTCTCCATGGCCTTTCCAGATAATCAGCGTCCACTGCTGAAGACAGACATGGAACGTCACAT 1310
Query 1326 CAACGAGGAGGACACAGTGCCTCTTTCTCACTTTGATGAGAGCATGGCCTACATGCCGGAAGGGGGCTGCTGCA 1399
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1311 CAACGAGGAGGACACAGTGCCTCTTTCTCACTTTGATGAGAGCATGGCCTACATGCCGGAAGGGGGCTGCTGCA 1384
Query 1400 ACCCCCACCCCTACAACGAAGGCTACGTGTAT 1431
||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1385 ACCCCCACCCCTACAACGAAGGCTACGTGTAT 1416