Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_00567
• Subject: NM_001077362.2
• Aligned Length: 888
• Identities: 787
• Gaps: 48

Alignment

Query   1  ------------------------------------------------ATGGCGGAGAAGTTTGACTGCCACTA  26
                                                           |||.||||||||||.|||||.|||||
Sbjct   1  ATGGCTTCTCAAAGACACTCAGGTCCCTCCAGCTATAAGGTGGGCACCATGTCGGAGAAGTTCGACTGTCACTA  74

Query  27  CTGCAGGGATCCCTTGCAGGGGAAGAAGTATGTGCAAAAGGATGGCCACCACTGCTGCCTGAAATGCTTTGACA  100
           |||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||..||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  75  CTGCAGGGACCCCTTGCAGGGGAAGAAGTACGTGCAGAAGGATGGCCGTCACTGCTGCCTGAAGTGCTTTGACA  148

Query 101  AGTTCTGTGCCAACACCTGTGTGGAATGCCGCAAGCCCATCGGTGCGGACTCCAAGGAGGTGCACTATAAGAAC  174
           |||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||..|.||.||..|||||||||||||.||||||||.
Sbjct 149  AGTTCTGCGCCAACACCTGCGTGGACTGCCGCAAGCCCATAAGCGCTGATGCCAAGGAGGTGCATTATAAGAAT  222

Query 175  CGCTTCTGGCATGACACCTGCTTCCGCTGTGCCAAGTGCCTTCACCCCTTGGCCAATGAGACCTTTGTGGCCAA  248
           ||||.||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||||
Sbjct 223  CGCTACTGGCACGACAACTGCTTCCGCTGTGCCAAGTGCCTTCACCCCTTGGCCAGTGAGACCTTTGTGTCCAA  296

Query 249  GGACAACAAGATCCTGTGCAACAAGTGCACCACTCGGGAGGACTCCCCCAAGTGCAAGGGGTGCTTCAAGGCCA  322
           |||...||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||||||.||||||.||||||||||||||||
Sbjct 297  GGATGGCAAGATCCTGTGCAACAAGTGCGCTACTCGGGAGGACTCCCCCAGGTGCAAAGGGTGCTTCAAGGCCA  370

Query 323  TTGTGGCAGGAGATCAAAACGTGGAGTACAAGGGGACCGTCTGGCACAAAGACTGCTTCACCTGTAGTAACTGC  396
           |||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct 371  TTGTGGCAGGAGACCAGAACGTGGAGTACAAGGGCACCGTCTGGCATAAAGACTGCTTCACCTGCAGCAACTGC  444

Query 397  AAGCAAGTCATCGGGACTGGAAGCTTCTTCCCTAAAGGGGAGGACTTCTACTGCGTGACTTGCCATGAGACCAA  470
           |||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 445  AAGCAAGTCATTGGGACCGGAAGCTTCTTCCCGAAAGGGGAGGACTTCTACTGTGTGACTTGCCATGAGACCAA  518

Query 471  GTTTGCCAAGCATTGCGTGAAGTGCAACAAGGCCATCACATCTGGAGGAATCACTTACCAGGATCAGCCCTGGC  544
           |||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519  GTTCGCCAAACATTGCGTGAAGTGCAACAAGGCCATCACATCTGGAGGAATCACTTACCAGGATCAGCCCTGGC  592

Query 545  ATGCCGATTGCTTTGTGTGTGTTACCTGCTCTAAGAAGCTGGCTGGGCAGCGTTTCACCGCTGTGGAGGACCAG  618
           |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593  ATGCCGAGTGCTTTGTGTGTGTTACCTGCTCTAAGAAGCTGGCTGGGCAGCGTTTCACCGCTGTGGAGGACCAG  666

Query 619  TATTACTGCGTGGATTGCTACAAGAACTTTGTGGCCAAGAAGTGTGCTGGATGCAAGAACCCCATCACTGGGTT  692
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667  TATTACTGCGTGGATTGCTACAAGAACTTTGTGGCCAAGAAGTGTGCTGGATGCAAGAACCCCATCACTGGGTT  740

Query 693  TGGTAAAGGCTCCAGTGTGGTGGCCTATGAAGGACAATCCTGGCACGACTACTGCTTCCACTGCAAAAAATGCT  766
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741  TGGTAAAGGCTCCAGTGTGGTGGCCTATGAAGGACAATCCTGGCACGACTACTGCTTCCACTGCAAAAAATGCT  814

Query 767  CCGTGAATCTGGCCAACAAGCGCTTTGTTTTCCACCAGGAGCAAGTGTATTGTCCCGACTGTGCCAAAAAGCTG  840
           ||||||||||||||||||||||||||||.||.||..|.|||||.||||||||.||.||||||||||||||||||
Sbjct 815  CCGTGAATCTGGCCAACAAGCGCTTTGTATTTCATAATGAGCAGGTGTATTGCCCTGACTGTGCCAAAAAGCTG  888