Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_00567
• Subject: XM_006527807.2
• Aligned Length: 840
• Identities: 647
• Gaps: 147

Alignment

Query   1  ATGGCGGAGAAGTTTGACTGCCACTACTGCAGGGATCCCTTGCAGGGGAAGAAGTATGTGCAAAAGGATGGCCA  74
           |||.||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||.
Sbjct   1  ATGTCGGAGAAGTTCGACTGTCACTACTGCAGGGACCCCTTGCAGGGGAAGAAGTACGTGCAGAAGGATGGCCG  74

Query  75  CCACTGCTGCCTGAAATGCTTTGACAAGTTCTGTGCCAACACCTGTGTGGAATGCCGCAAGCCCATCGGTGCGG  148
           .||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||..|.||.|
Sbjct  75  TCACTGCTGCCTGAAGTGCTTTGACAAGTTCTGCGCCAACACCTGCGTGGACTGCCGCAAGCCCATAAGCGCTG  148

Query 149  ACTCCAAGGAGGTGCACTATAAGAACCGCTTCTGGCATGACACCTGCTTCCGCTGTGCCAAGTGCCTTCACCCC  222
           |..|||||||||||||.||||||||.||||.||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  ATGCCAAGGAGGTGCATTATAAGAATCGCTACTGGCACGACAACTGCTTCCGCTGTGCCAAGTGCCTTCACCCC  222

Query 223  TTGGCCAATGAGACCTTTGTGGCCAAGGACAACAAGATCCTGTGCAACAAGTGCACCACTCGGGAGGACTCCCC  296
           |||||||.|||||||||||||.|||||||...||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||||
Sbjct 223  TTGGCCAGTGAGACCTTTGTGTCCAAGGATGGCAAGATCCTGTGCAACAAGTGCGCTACTCGGGAGGACTCCCC  296

Query 297  CAAGTGCAAGGGGTGCTTCAAGGCCATTGTGGCAGGAGATCAAAACGTGGAGTACAAGGGGACCGTCTGGCACA  370
           ||.||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct 297  CAGGTGCAAAGGGTGCTTCAAGGCCATTGTGGCAGGAGACCAGAACGTGGAGTACAAGGGCACCGTCTGGCATA  370

Query 371  AAGACTGCTTCACCTGTAGTAACTGCAAGCAAGTCATCGGGACTGGAAGCTTCTTCCCTAAAGGGGAGGACTTC  444
           ||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 371  AAGACTGCTTCACCTGCAGCAACTGCAAGCAAGTCATTGGGACCGGAAGCTTCTTCCCGAAAGGGGAGGACTTC  444

Query 445  TACTGCGTGACTTGCCATGAGACCAAGTTTGCCAAGCATTGCGTGAAGTGCAACAAGGCCATCACATCTGGAGG  518
           |||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445  TACTGTGTGACTTGCCATGAGACCAAGTTCGCCAAACATTGCGTGAAGTGCAACAAGGCCATCACATCTGGAGG  518

Query 519  AATCACTTACCAGGATCAGCCCTGGCATGCCGATTGCTTTGTGTGTGTTACCTGCTCTAAGAAGCTGGCTGGGC  592
           |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519  AATCACTTACCAGGATCAGCCCTGGCATGCCGAGTGCTTTGTGTGTGTTACCTGCTCTAAGAAGCTGGCTGGGC  592

Query 593  AGCGTTTCACCGCTGTGGAGGACCAGTATTACTGCGTGGATTGCTACAAGAACTTTGTGGCCAAGAAGTGTGCT  666
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593  AGCGTTTCACCGCTGTGGAGGACCAGTATTACTGCGTGGATTGCTACAAGAACTTTGTGGCCAAGAAGTGTGCT  666

Query 667  GGATGCAAGAACCCCATCACTGGGTTTGGTAAAGGCTCCAGTGTGGTGGCCTATGAAGGACAATCCTGGCACGA  740
           |||||||||||||||||||||||             |||.                                  
Sbjct 667  GGATGCAAGAACCCCATCACTGG-------------TCCT----------------------------------  693

Query 741  CTACTGCTTCCACTGCAAAAAATGCTCCGTGAATCTGGCCAACAAGCGCTTTGTTTTCCACCAGGAGCAAGTGT  814
                                                                                     
Sbjct 694  --------------------------------------------------------------------------  693

Query 815  ATTGTCCCGACTGTGCCAAAAAGCTG  840
                                     
Sbjct 694  --------------------------  693