Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_00693
• Subject: NM_001204258.2
• Aligned Length: 777
• Identities: 751
• Gaps: 26

Alignment

Query   1  MDSKESLTPGREENPSSVLAQERGDVMDFYKTLRGGATVKVSASSPSLAVASQSDSKQRRLLVDFPKGSVSNAQ  74
                                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  --------------------------MDFYKTLRGGATVKVSASSPSLAVASQSDSKQRRLLVDFPKGSVSNAQ  48

Query  75  QPDLSKAVSLSMGLYMGETETKVMGNDLGFPQQGQISLSSGETDLKLLEESIANLNRSTSVPENPKSSASTAVS  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  49  QPDLSKAVSLSMGLYMGETETKVMGNDLGFPQQGQISLSSGETDLKLLEESIANLNRSTSVPENPKSSASTAVS  122

Query 149  AAPTEKEFPKTHSDVSSEQQHLKGQTGTNGGNVKLYTTDQSTFDILQDLEFSSGSPGKETNESPWRSDLLIDEN  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 123  AAPTEKEFPKTHSDVSSEQQHLKGQTGTNGGNVKLYTTDQSTFDILQDLEFSSGSPGKETNESPWRSDLLIDEN  196

Query 223  CLLSPLAGEDDSFLLEGNSNEDCKPLILPDTKPKIKDNGDLVLSSPSNVTLPQVKTEKEDFIELCTPGVIKQEK  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 197  CLLSPLAGEDDSFLLEGNSNEDCKPLILPDTKPKIKDNGDLVLSSPSNVTLPQVKTEKEDFIELCTPGVIKQEK  270

Query 297  LGTVYCQASFPGANIIGNKMSAISVHGVSTSGGQMYHYDMNTASLSQQQDQKPIFNVIPPIPVGSENWNRCQGS  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 271  LGTVYCQASFPGANIIGNKMSAISVHGVSTSGGQMYHYDMNTASLSQQQDQKPIFNVIPPIPVGSENWNRCQGS  344

Query 371  GDDNLTSLGTLNFPGRTVFSNGYSSPSMRPDVSSPPSSSSTATTGPPPKLCLVCSDEASGCHYGVLTCGSCKVF  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 345  GDDNLTSLGTLNFPGRTVFSNGYSSPSMRPDVSSPPSSSSTATTGPPPKLCLVCSDEASGCHYGVLTCGSCKVF  418

Query 445  FKRAVEGQHNYLCAGRNDCIIDKIRRKNCPACRYRKCLQAGMNLEARKTKKKIKGIQQATTGVSQETSENPGNK  518
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 419  FKRAVEGQHNYLCAGRNDCIIDKIRRKNCPACRYRKCLQAGMNLEARKTKKKIKGIQQATTGVSQETSENPGNK  492

Query 519  TIVPATLPQLTPTLVSLLEVIEPEVLYAGYDSSVPDSTWRIMTTLNMLGGRQVIAAVKWAKAIPGFRNLHLDDQ  592
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 493  TIVPATLPQLTPTLVSLLEVIEPEVLYAGYDSSVPDSTWRIMTTLNMLGGRQVIAAVKWAKAIPGFRNLHLDDQ  566

Query 593  MTLLQYSWMFLMAFALGWRSYRQSSANLLCFAPDLIINEQRMTLPCMYDQCKHMLYVSSELHRLQVSYEEYLCM  666
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 567  MTLLQYSWMFLMAFALGWRSYRQSSANLLCFAPDLIINEQRMTLPCMYDQCKHMLYVSSELHRLQVSYEEYLCM  640

Query 667  KTLLLLSSVPKDGLKSQELFDEIRMTYIKELGKAIVKREGNSSQNWQRFYQLTKLLDSMHEVVENLLNYCFQTF  740
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 641  KTLLLLSSVPKDGLKSQELFDEIRMTYIKELGKAIVKREGNSSQNWQRFYQLTKLLDSMHEVVENLLNYCFQTF  714

Query 741  LDKTMSIEFPEMLAEIITNQIPKYSNGNIKKLLFHQK  777
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 715  LDKTMSIEFPEMLAEIITNQIPKYSNGNIKKLLFHQK  751