Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_00693
• Subject: NM_001204261.2
• Aligned Length: 777
• Identities: 680
• Gaps: 97

Alignment

Query   1  MDSKESLTPGREENPSSVLAQERGDVMDFYKTLRGGATVKVSASSPSLAVASQSDSKQRRLLVDFPKGSVSNAQ  74
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  75  QPDLSKAVSLSMGLYMGETETKVMGNDLGFPQQGQISLSSGETDLKLLEESIANLNRSTSVPENPKSSASTAVS  148
                                  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  -----------------------MGNDLGFPQQGQISLSSGETDLKLLEESIANLNRSTSVPENPKSSASTAVS  51

Query 149  AAPTEKEFPKTHSDVSSEQQHLKGQTGTNGGNVKLYTTDQSTFDILQDLEFSSGSPGKETNESPWRSDLLIDEN  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  52  AAPTEKEFPKTHSDVSSEQQHLKGQTGTNGGNVKLYTTDQSTFDILQDLEFSSGSPGKETNESPWRSDLLIDEN  125

Query 223  CLLSPLAGEDDSFLLEGNSNEDCKPLILPDTKPKIKDNGDLVLSSPSNVTLPQVKTEKEDFIELCTPGVIKQEK  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 126  CLLSPLAGEDDSFLLEGNSNEDCKPLILPDTKPKIKDNGDLVLSSPSNVTLPQVKTEKEDFIELCTPGVIKQEK  199

Query 297  LGTVYCQASFPGANIIGNKMSAISVHGVSTSGGQMYHYDMNTASLSQQQDQKPIFNVIPPIPVGSENWNRCQGS  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 200  LGTVYCQASFPGANIIGNKMSAISVHGVSTSGGQMYHYDMNTASLSQQQDQKPIFNVIPPIPVGSENWNRCQGS  273

Query 371  GDDNLTSLGTLNFPGRTVFSNGYSSPSMRPDVSSPPSSSSTATTGPPPKLCLVCSDEASGCHYGVLTCGSCKVF  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 274  GDDNLTSLGTLNFPGRTVFSNGYSSPSMRPDVSSPPSSSSTATTGPPPKLCLVCSDEASGCHYGVLTCGSCKVF  347

Query 445  FKRAVEGQHNYLCAGRNDCIIDKIRRKNCPACRYRKCLQAGMNLEARKTKKKIKGIQQATTGVSQETSENPGNK  518
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 348  FKRAVEGQHNYLCAGRNDCIIDKIRRKNCPACRYRKCLQAGMNLEARKTKKKIKGIQQATTGVSQETSENPGNK  421

Query 519  TIVPATLPQLTPTLVSLLEVIEPEVLYAGYDSSVPDSTWRIMTTLNMLGGRQVIAAVKWAKAIPGFRNLHLDDQ  592
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 422  TIVPATLPQLTPTLVSLLEVIEPEVLYAGYDSSVPDSTWRIMTTLNMLGGRQVIAAVKWAKAIPGFRNLHLDDQ  495

Query 593  MTLLQYSWMFLMAFALGWRSYRQSSANLLCFAPDLIINEQRMTLPCMYDQCKHMLYVSSELHRLQVSYEEYLCM  666
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 496  MTLLQYSWMFLMAFALGWRSYRQSSANLLCFAPDLIINEQRMTLPCMYDQCKHMLYVSSELHRLQVSYEEYLCM  569

Query 667  KTLLLLSSVPKDGLKSQELFDEIRMTYIKELGKAIVKREGNSSQNWQRFYQLTKLLDSMHEVVENLLNYCFQTF  740
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 570  KTLLLLSSVPKDGLKSQELFDEIRMTYIKELGKAIVKREGNSSQNWQRFYQLTKLLDSMHEVVENLLNYCFQTF  643

Query 741  LDKTMSIEFPEMLAEIITNQIPKYSNGNIKKLLFHQK  777
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 644  LDKTMSIEFPEMLAEIITNQIPKYSNGNIKKLLFHQK  680