Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_00760
• Subject: XM_006520458.1
• Aligned Length: 1803
• Identities: 1548
• Gaps: 9

Alignment

Query    1  ATGCCCTGTATCCAAGCCCAATATGGGACACCAGCACCGAGTCCGGGACCCCGTGACCACCTGGCAAGCGACCC  74
            |||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||.||||.||.|||||.||||||||||||.|..|.||.||
Sbjct    1  ATGCCCTGTATTCAAGCTCAATATGGAACACCAGCAACGAGCCCAGGACCGCGTGACCACCTGACCGGTGATCC  74

Query   75  CCTGACCCCTGAGTTCATCAAGCCCACCATGGACCTGGCCAGCCCCGAGGCAGCCCCCGCTGCCCCCACTGCCC  148
            ||||.|||.|||||||..||||||.||||||||||||||||||||||||.||||.||.||.||.||..||.|.|
Sbjct   75  CCTGGCCCTTGAGTTCGGCAAGCCTACCATGGACCTGGCCAGCCCCGAGACAGCACCTGCCGCACCTGCTACAC  148

Query  149  TGCCCAGCTTCAGCACCTTCATGGACGGCTACACAGGAGAGTTTGACACCTTCCTCTACCAGCTGCCAGGAACA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.
Sbjct  149  TGCCCAGCTTCAGCACCTTCATGGACGGGTACACCGGAGAGTTTGACACCTTCCTCTACCAGCTGCCGGGGACG  222

Query  223  GTCCAGCCATGCTCCTCAGCCTCCTCCTCGGCCTCCTCCA------CATCCTCGTCCTCAGCCACCTCCCCTGC  290
            ..||||||.|||||||||||.|..|||||.||||||||||      |.|||||.|||||.|||||||||||.||
Sbjct  223  ACCCAGCCGTGCTCCTCAGCTTGTTCCTCTGCCTCCTCCACGTCTTCTTCCTCATCCTCGGCCACCTCCCCCGC  296

Query  291  CTCTGCCTCCTTCAAGTTCGAGGACTTCCAGGTGTACGGCTGCTACCCCGGCCCCCTGAGCGGCCCAGTGGATG  364
            .||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||.|.||||
Sbjct  297  TTCGGCGTCCTTCAAGTTTGAGGACTTCCAGGTGTACGGCTGCTACCCGGGCACCCTGAGCGGCCCATTAGATG  370

Query  365  AGGCCCTGTCCTCCAGTGGCTCTGACTACTATGGCAGCCCCTGCTCGGCCCCGTCGCCCTCCACGCCCAGCTTC  438
            ||.||||.||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.|||||.||.||.||||.||||
Sbjct  371  AGACCCTATCCTCCAGCGGCTCTGAGTACTATGGCAGTCCCTGCTCAGCCCCCTCGCCATCTACACCCAACTTC  444

Query  439  CAGCCGCCCCAGCTCTCTCCCTGGGATGGCTCCTTCGGCCACTTCTCGCCCAGCCAGACTTACGAAGGCCTGCG  512
            ||||||.|||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||||||||.||.|||||||||||.||||||||..|
Sbjct  445  CAGCCGTCCCAGCTTTCTCCCTGGGACGGCTCATTTGGCCACTTCTCCCCGAGCCAGACTTATGAAGGCCTCTG  518

Query  513  GGCATGGACAGAGCAGCTGCCCAAAGCCTCT---GGGCCCCCACAGCCTCCAGCCTTCTTTTCCTTCAGTCCTC  583
            ||||||||||||||||.||||.||.||.|||   |||||.||.|..||||||.|||||||.|||||||||||||
Sbjct  519  GGCATGGACAGAGCAGTTGCCTAAGGCTTCTTCAGGGCCTCCGCCACCTCCAACCTTCTTCTCCTTCAGTCCTC  592

Query  584  CCACCGGCCCCAGCCCCAGCCTGGCCCAGAGCCCCCTGAAGTTGTTCCCCTCACAGGCCACCCACCAGCTGGGG  657
            ||||.||||||||||||||||||||||||||..|.|||||.||||||||..|||..||||||||||||||.|||
Sbjct  593  CCACTGGCCCCAGCCCCAGCCTGGCCCAGAGTTCTCTGAAATTGTTCCCACCACCAGCCACCCACCAGCTTGGG  666

Query  658  GAGGGAGAGAGCTATTCCATGCCTACGGCCTTCCCAGGTTTGGCACCCACTTCTCCACACCTTGAGGGCTCGGG  731
            |||||.|||||||||||||||||..|.||.|||||.||.|||||||||||.|||||..|||.|||....||.||
Sbjct  667  GAGGGGGAGAGCTATTCCATGCCAGCAGCTTTCCCCGGCTTGGCACCCACCTCTCCGAACCGTGACACTTCCGG  740

Query  732  GATACTGGATACACCCGTGACCTCAACCAAGGCCCGGAGCGGGGCCCCAGGTGGAAGTGAAGGCCGCTGTGCTG  805
            .||.|||||..|||||||||||||.||||||.|||||||||||||..|||||||.||.||.|||||||||||.|
Sbjct  741  CATTCTGGACGCACCCGTGACCTCCACCAAGTCCCGGAGCGGGGCTTCAGGTGGCAGCGAGGGCCGCTGTGCAG  814

Query  806  TGTGTGGGGACAACGCTTCATGCCAGCATTATGGTGTCCGCACATGTGAGGGCTGCAAGGGCTTCTTCAAGCGC  879
            |.|||||.|||||.|||||.||.|||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TCTGTGGTGACAATGCTTCGTGTCAGCACTATGGGGTCCGCACCTGTGAGGGCTGCAAGGGCTTCTTCAAGCGC  888

Query  880  ACAGTGCAGAAAAACGCCAAGTACATCTGCCTGGCTAACAAGGACTGCCCTGTGGACAAGAGGCGGCGAAACCG  953
            |||||.|||||||.|||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  889  ACAGTACAGAAAAGCGCCAAGTACATCTGCCTGGCAAACAAGGATTGCCCTGTGGACAAGAGGCGGCGGAACCG  962

Query  954  CTGCCAGTTCTGCCGCTTCCAGAAGTGCCTGGCGGTGGGCATGGTGAAGGAAGTTGTCCGAACAGACAGCCTGA  1027
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|
Sbjct  963  CTGCCAGTTCTGCCGCTTCCAGAAGTGCCTGGCTGTGGGCATGGTGAAGGAAGTTGTACGGACAGACAGCCTAA  1036

Query 1028  AGGGGCGGCGGGGCCGGCTACCTTCAAAACCCAAGCAGCCCCCAGATGCCTCCCCTGCCAATCTCCTCACTTCC  1101
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||.|||||||||
Sbjct 1037  AAGGGCGGCGGGGCCGGCTACCTTCAAAACCCAAGCAGCCTCCAGATGCCTCCCCTACCAATCTTCTCACTTCC  1110

Query 1102  CTGGTCCGTGCACACCTGGACTCAGGGCCCAGCACTGCCAAACTGGACTACTCCAAGTTCCAGGAGCTGGTGCT  1175
            ||..||||.||||||.|||||||.|||||.||||||||||||.|||||||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1111  CTCATCCGGGCACACTTGGACTCCGGGCCTAGCACTGCCAAATTGGACTATTCCAAGTTCCAGGAACTGGTGCT  1184

Query 1176  GCCCCACTTTGGGAAGGAAGATGCTGGGGATGTACAGCAGTTCTACGACCTGCTCTCCGGTTCTCTGGAGGTCA  1249
            |||||.|||.||||||||||||||.||.||.||.||.||.||.||.|||.|||||||.|||||.|||||.||.|
Sbjct 1185  GCCCCGCTTCGGGAAGGAAGATGCCGGTGACGTGCAACAATTTTATGACTTGCTCTCTGGTTCCCTGGACGTTA  1258

Query 1250  TCCGCAAGTGGGCGGAGAAGATCCCTGGCTTTGCTGAGCTGTCACCGGCTGACCAGGACCTGTTGCTGGAGTCG  1323
            ||||.||||||||.||.||.|||||||||||...||||||.|..||.|..|||||.|||||||||||.|||||.
Sbjct 1259  TCCGAAAGTGGGCAGAAAAAATCCCTGGCTTCATTGAGCTTTGCCCAGGAGACCAAGACCTGTTGCTAGAGTCT  1332

Query 1324  GCCTTCCTGGAGCTCTTCATCCTCCGCCTGGCGTACAGGTCTAAGCCAGGCGAGGGCAAGCTCATCTTCTGCTC  1397
            |||||||||||.||||||||||||||||||||.|||.|.|||||.||.||.|||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1333  GCCTTCCTGGAACTCTTCATCCTCCGCCTGGCATACCGATCTAAACCCGGTGAGGGGAAGCTCATCTTCTGCTC  1406

Query 1398  AGGCCTGGTGCTACACCGGCTGCAGTGTGCCCGTGGCTTCGGGGACTGGATTGACAGTATCCTGGCCTTCTCAA  1471
            |||||||||.|||||||.|||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||..|||||||||||||||.
Sbjct 1407  AGGCCTGGTACTACACCAGCTGCAGTGTGCCCGTGGCTTTGGTGATTGGATTGACAACATCCTGGCCTTCTCAC  1480

Query 1472  GGTCCCTGCACAGCTTGCTTGTCGATGTCCCTGCCTTCGCCTGCCTCTCTGCCCTTGTCCTCATCACCGACCGG  1545
            |||||||||||||||||..|||.|||||.||.|||||.||||||||.||.||.||.|||||||||||.||.||.
Sbjct 1481  GGTCCCTGCACAGCTTGGGTGTTGATGTTCCCGCCTTTGCCTGCCTGTCCGCTCTGGTCCTCATCACTGATCGA  1554

Query 1546  CATGGGCTGCAGGAGCCGCGGCGGGTGGAGGAGCTGCAGAACCGCATCGCCAGCTGCCTGAAGGAGCACGTGGC  1619
            ||.|||||.|||||.||.||.||||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||||||.||||
Sbjct 1555  CACGGGCTCCAGGACCCTCGTCGGGTGGAAGAGCTGCAGAATCGCATTGCTAGCTGTCTGAAGGAGCACATGGC  1628

Query 1620  AGCTGTGGCGGGCGAGCCCCAGCCAGCCAGCTGCCTGTCACGTCTGTTGGGCAAACTGCCCGAGCTGCGGACCC  1693
            ..|.|||||.||.||.||.|||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||.|||||.|||||||
Sbjct 1629  TACCGTGGCAGGAGACCCACAGCCGGCCAGCTGCCTGTCACGTCTGCTGGGCAAACTGCCTGAGCTTCGGACCC  1702

Query 1694  TGTGCACCCAGGGCCTGCAGCGCATCTTCTACCTCAAGCTGGAGGACTTGGTGCCCCCTCCACCCATCATTGAC  1767
            |||||||.||.|||||||||||||||||.|.|||||||.|||||||||||||.|||||||||||.||..|.|||
Sbjct 1703  TGTGCACTCAAGGCCTGCAGCGCATCTTTTGCCTCAAGTTGGAGGACTTGGTACCCCCTCCACCTATTGTGGAC  1776

Query 1768  AAGATCTTCATGGACACGCTGCCCTTC  1794
            ||||||||.||||||||..||.|.|||
Sbjct 1777  AAGATCTTTATGGACACATTGTCTTTC  1803