Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_00765
- Subject:
- NR_002944.2
- Aligned Length:
- 1355
- Identities:
- 955
- Gaps:
- 396
Alignment
Query 1 -----------------------------------------------------------ATGTCTAAGTCAGAG 15
|||||||||||||||
Sbjct 1 TTTCTGCCCGTGGACACCGCCGAAGAAGCATCGTTAAAGTCTCTCTTCACCCTGCCGTCATGTCTAAGTCAGAG 74
Query 16 TCTCCTAAAGAGCCCGAACAGCTGAGGAAGCTCTTCATTGGAGGGTTGAGCTTTGAAACAACTGATGAGAGCCT 89
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TCTCCTAAAGAGCCCGAACAGCTGAGGAAGCTCTTCATTGGAGGGTTGAGCTTTGAAACAACTGATGAGAGCCT 148
Query 90 GAGGAGCCATTTTGAGCAATGGGGAACGCTCACGGACTGTGTGGTAATGAGAGATCCAAACACCAAGCGCTCCA 163
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GAGGAGCCATTTTGAGCAATGGGGAACGCTCACGGACTGTGTGGTAATGAGAGATCCAAACACCAAGCGCTCCA 222
Query 164 GGGGCTTTGGGTTTGTCACATATGCCACTGTGGAGGAGGTGGATGCAGCTATGAATGCAAGGCCACACAAGGTG 237
|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GGGGCTTTGGGTTTGTCACGTATGCCACTGTGGAGGAGGTGGATGCAGCTATGAATGCAAGGCCACACAAGGTG 296
Query 238 GATGGAAGAGTTGTGGAACCAAAGAGAGCTGTCTCCAGAGAAGATTCTCAAAGACCAGGTGCCCACTTAACTGT 311
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GATGGAAGAGTTGTGGAACCAAAGAGAGCTGTCTCCAGAGAAGATTCTCAAAGACCAGGTGCCCACTTAACTGT 370
Query 312 GAAAAAGATATTTGTTGGTGGCATTAAAGAAGACACTGAAGAACATCACCTAAGAGATTATTTTGAACAGTATG 385
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 GAAAAAGATATTTGTTGGTGGCATTAAAGAAGACACTGAAGAACATCACCTAAGAGATTATTTTGAACAGTATG 444
Query 386 GAAAAATTGAAGTGATTGAAATCATGACTGACCGAGGCAGTGGCAAGAAAAGGGGCTTTGCCTTTGTAACCTTT 459
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GAAAAATTGAAGTGATTGAAATCATGACTGACCGAGGCAGTGGCAAGAAAAGGGGCTTTGCCTTTGTAACCTTT 518
Query 460 GACGACCATGACTCCGTGGATAAGATTGTCATTCAGAAATACCATACTGTGAATGGCCACAACTGTGAAGTTAG 533
|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GACGACCATGACTCCGTGGATAAGACTGTCATTCAGAAATACCATACTGTGAATGGCCACAACTGTGAAGTTAG 592
Query 534 AAAAGCCCTGTCAAAGCAAGAGATGGCTAGTGCTTCATCCAGCCAAAGAGGTCGAAGTGGTTCTGGAAACTTTG 607
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 AAAAGCCCTGTCAAAGCAAGAGATGGCTAGTGCTTCATCCAGCCAAAGAGGTCGAAGTGGTTCTGGAAACTTTG 666
Query 608 GTGGTGGTCGTGGAGGTGGTTTCGGTGGGAATGACAACTTCGGTCGTGGAGGAAACTTCAGTGGTCGTGGTGGC 681
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GTGGTGGTCGTGGAGGTGGTTTCGGTGGGAATGACAACTTCGGTCGTGGAGGAAACTTCAGTGGTCGTGGTGGC 740
Query 682 TTTGGTGGCAGCCGTGGTGGTGGTGGATATGGTGGCAGTGGGGATGGCTATAATGGATTTGGTAATGATGGAAG 755
|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TTTGGTGGCAGCCATGGTGGTGGTGGATATGGTGGCAGTGGGGATGGCTATAATGGATTTGGTAATGATGGAAG 814
Query 756 CAATTTTGGAGGTGGTGGAAGCTACAATGATTTTGGGAATTACAACAATCAGTCTTCAAATTTTGGACCCATGA 829
||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CAATTTTGGAGGTGGTGGAAGCTACAATGATTTTGGCAATTACAACAATCAGTCTTCAAATTTTGGACCCATGA 888
Query 830 AGGGAGGAAATTTTGGAGGCAGAAGCTCTGGCCCCTATGGCGGTGGAGGCCAATACTTTGCAAAACCACGAAAC 903
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AGGGAGGAAATTTTGGAGGCAGAAGCTCTGGCCCCTATGGCGGTGGAGGCCAATACTTTGCAAAACCACGAAAC 962
Query 904 CAAGGTGGCTATGGCGGTTCCAGCAGCAGCAGTAGCTATGGCAGTGGCAGAAGATTT----------------- 960
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CAA-GTGGCTATGGCGGTTCCAGCAGCAGCAGTAGCTATGGCAGTGGCAGAAGATTTTAATTAGGAAACAAAGC 1035
Query 961 -------------------------------------------------------------------------- 960
Sbjct 1036 TTAGCAGGAGAGGAGAGCCAGAGAAGTGACAGGGAAGCTACAGGTTACAATAGATTTGTGAACTCAGCCAAGCA 1109
Query 961 -------------------------------------------------------------------------- 960
Sbjct 1110 CAGTGGTGGCAGGGCCTAGCTGCTACAAAGAAGACATGTTTTAGACAAATACTCATGTGTATGGGCAAAAAACT 1183
Query 961 -------------------------------------------------------------------------- 960
Sbjct 1184 CGAGGACTGTATTTGTGACTAATTGTATAACAGGTTATTTTAGTTTCTGTTCTGTGGAAAGTGTAAAGCATTCC 1257
Query 961 -------------------------------------------------------------------------- 960
Sbjct 1258 AACAAAGGGTTTTAACGTAGATTTCTTTTTGCACCCCATGCTGTTGATTGCTAAATGTAATAGTCTGATCGTGA 1331
Query 961 ----------------------- 960
Sbjct 1332 TGCTGAATAAATGTCTTTTTTTT 1354