Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_00973
• Subject: NM_001285455.1
• Aligned Length: 1156
• Identities: 913
• Gaps: 113

Alignment

Query    1  ATGGCTGAGCCCCGCCAGGAGTTCGAAGTGATGGAAGATCACGCTGGGACGTACGGGTTGGGGGACAGGAAAGA  74
            ||||||||.||.|||||||||||.||....||||||||.||.|||||                        |||
Sbjct    1  ATGGCTGACCCTCGCCAGGAGTTTGACACAATGGAAGACCATGCTGG------------------------AGA  50

Query   75  TCAGGGGGGCTACACCATGCACCAAGACCAAGAGGGTGACACGGACGCTGGCCTGAAAGCTGAAGAAGCAGGCA  148
            |         |||||..|||.||||||||||||.||.||||.||||..||||.|.||||||             
Sbjct   51  T---------TACACTCTGCTCCAAGACCAAGAAGGAGACATGGACCATGGCTTAAAAGCT-------------  102

Query  149  TTGGAGACACCCCCAGCCTGGAAGACGAAGCTGCTGGTCACGTGACCCAAGCTCGCATGGTCAGTAAAAGCAAA  222
                                                    ||||             |||.|      ||||||
Sbjct  103  ----------------------------------------CGTG-------------TGGCC------AGCAAA  117

Query  223  GACGGGACTGGAAGCGATGACAAAAAAGCCAAGGGGGCTGATGGTAAAA------CGAAGATCGCCACACCGCG  290
            |||.||||.||||..||.||.||.|||||||||||.||||||||.||||      ||||||||||||||||.||
Sbjct  118  GACAGGACAGGAAATGACGAGAAGAAAGCCAAGGGCGCTGATGGCAAAACCGGGGCGAAGATCGCCACACCTCG  191

Query  291  GGGAGCAGCCCCTCCAGGCCAGAAGGGCCAGGCCAACGCCACCAGGATTCCAGCAAAAACCCCGCCC-GCTCCA  363
            ||||||||||.||||.|.||||||||||..|.||||||||||||||||.||.||.||.|||.||||| || ||.
Sbjct  192  GGGAGCAGCCTCTCCGGCCCAGAAGGGCACGTCCAACGCCACCAGGATCCCGGCCAAGACCACGCCCAGC-CCT  264

Query  364  AAGACACCACCCAGCTCTGGTGAACCTCCAAAATCAGGGGATCGCAGCGGCTACAGCAGCCCCGGCTCCCCAGG  437
            |||||.||.||..|.||.||||||||.||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct  265  AAGACTCCTCCAGGGTCAGGTGAACCACCAAAATCCGGAGAACGAAGCGGCTACAGCAGCCCCGGCTCTCCCGG  338

Query  438  CACTCCCGGCAGCCGCTCCCGCACCCCGTCCCTTCCAACCCCACCCACCCGGGAGCCCAAGAAGGTGGCAGTGG  511
            .||.||.|||||.|||||.||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  339  AACGCCTGGCAGTCGCTCGCGCACCCCATCCCTACCAACACCGCCCACCCGGGAGCCCAAGAAGGTGGCAGTGG  412

Query  512  TCCGTACTCCACCCAAGTCGCCGTCTTCCGCCAAGAGCCGCCTGCAGACAGCCCCCGTGCCCATGCCAGACCTG  585
            ||||.|||||.||.|||||.||.||..|....|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.
Sbjct  413  TCCGCACTCCCCCTAAGTCACCATCAGCTAGTAAGAGCCGCCTGCAGACTGCCCCTGTGCCCATGCCAGACCTA  486

Query  586  AAGAATGTCAAGTCCAAGATCGGCTCCACTGAGAACCTGAAGCACCAGCCGGGAGGCGGGAAGGTGCAGATAAT  659
            ||||||||||.|||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||
Sbjct  487  AAGAATGTCAGGTCGAAGATTGGCTCTACTGAGAACCTGAAGCACCAGCCAGGAGGTGGCAAGGTGCAGATAAT  560

Query  660  TAATAAGAAGCTGGATCTTAGCAACGTCCAGTCCAAGTGTGGCTCAAAGGATAATATCAAACACGTCCCGGGAG  733
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  561  TAATAAGAAGCTGGATCTTAGCAACGTCCAGTCCAAGTGTGGCTCGAAGGATAATATCAAACACGTCCCGGGTG  634

Query  734  GCGGCAGTGTGCAAATAGTCTACAAACCAGTTGACCTGAGCAAGGTGACCTCCAAGTGTGGCTCATTAGGCAAC  807
            |.|||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct  635  GAGGCAGTGTGCAAATAGTCTACAAGCCGGTGGACCTGAGCAAAGTGACCTCCAAGTGTGGCTCGTTAGGGAAC  708

Query  808  ATCCATCATAAACCAGGAGGTGGCCAGGTGGAAGTAAAATCTGAGAAGCTTGACTTCAAGGACAGAGTCCAGTC  881
            ||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  709  ATCCATCACAAGCCAGGAGGTGGCCAGGTGGAAGTAAAATCAGAGAAGCTGGACTTCAAGGACAGAGTCCAGTC  782

Query  882  GAAGATTGGGTCCCTGGACAATATCACCCACGTCCCTGGCGGAGGAAATAAAAAGATTGAAACCCACAAGCTGA  955
            |||||||||.|||.||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  783  GAAGATTGGCTCCTTGGATAATATCACCCACGTCCCTGGAGGAGGGAATAAGAAGATTGAAACCCACAAGCTGA  856

Query  956  CCTTCCGCGAGAACGCCAAAGCCAAGACAGACCACGGGGCGGAGATCGTGTACAAGTCGCCAGTGGTGTCTGGG  1029
            |||||.|.|||||.||||||||||||||||||||.||.||.||.||.|||||.|||||.||.||||||||||||
Sbjct  857  CCTTCAGGGAGAATGCCAAAGCCAAGACAGACCATGGAGCAGAAATTGTGTATAAGTCACCCGTGGTGTCTGGG  930

Query 1030  GACACGTCTCCACGGCATCTCAGCAATGTCTCCTCCACCGGCAGCATCGACATGGTAGACTCGCCCCAGCTCGC  1103
            |||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.||.|||||.||
Sbjct  931  GACACATCTCCACGGCACCTCAGCAATGTGTCTTCCACGGGCAGCATCGACATGGTGGACTCACCACAGCTTGC  1004

Query 1104  CACGCTAGCTGACGAGGTGTCTGCCTCCCTGGCCAAGCAGGGTTTG  1149
            |||.|||||.||.||.||||||||.|||.|||||||||||||||||
Sbjct 1005  CACACTAGCCGATGAAGTGTCTGCTTCCTTGGCCAAGCAGGGTTTG  1050