Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_00998
- Subject:
- NM_001159567.1
- Aligned Length:
- 1439
- Identities:
- 1106
- Gaps:
- 265
Alignment
Query 1 ATGGCGCAAAGGTACGATGAGCTGCCCCATTACGGCGGGATGGACGGAGTAGGGGTTCCCGCTTCCATGTACGG 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCGCAAAGGTACGATGAGCTGCCCCATTACGGCGGGATGGACGGAGTAGGGGTTCCCGCTTCCATGTACGG 74
Query 75 AGACCCTCACGCGCCGCGGCCGATCCCCCCGGTTCACCACCTGAACCACGGGCCGCCGCTCCACGCCACACAGC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 75 AGACCCTCACGCGCCGCGGCCGATCCCCCCGGTTCACCACCTAAACCACGGGCCGCCGCTCCACGCCACGCAGC 148
Query 149 ACTACGGCGCGCACGCCCCGCACCCCAATGTCATGCCGGCCAGTATGGGATCCGCTGTCAACGACGCCTTGAAG 222
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct 149 ACTACGGCGCGCACGCCCCGCACCCCAATGTCATGCCAGCCAGCATGGGATCTGCTGTCAACGACGCCTTGAAA 222
Query 223 CGGGACAAGGACGCGATCTATGGGCACCCGTTGTTTCCTCTGTTAGCTCTGGTCTTTGAGAAGTGCGAGCTGGC 296
.|.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 223 AGAGACAAGGACGCAATCTATGGGCACCCGTTGTTTCCTCTGTTAGCTCTGGTTTTTGAGAAGTGCGAGCTGGC 296
Query 297 GACCTGCACTCCCCGGGAACCTGGAGTGGCTGGCGGAGACGTCTGCTCCTCCGACTCCTTCAACGAGGACATCG 370
|||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GACCTGCACTCCCCGGGAACCCGGAGTGGCCGGCGGAGACGTCTGTTCCTCTGACTCCTTCAACGAGGACATCG 370
Query 371 CGGTCTTCGCCAAGCAGGTTCGCGCCGAAAAGCCACTTTTTTCCTCAAATCCAGAGCTGGACAATTTGATGATA 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||
Sbjct 371 CGGTCTTCGCCAAGCAGGTTCGCGCCGAAAAGCCTCTTTTTTCCTCAAACCCAGAGCTGGATAATTTGATGATA 444
Query 445 CAAGCAATACAAGTACTAAGGTTTCATCTTTTGGAGTTAGAAAAGGTCCACGAACTGTGCGATAACTTCTGCCA 518
||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct 445 CAAGCAATTCAAGTACTAAGGTTTCATCTTCTGGAGTTAGAAAAGGTCCACGAACTATGTGATAACTTCTGCCA 518
Query 519 CCGATACATTAGCTGTTTGAAGGGGAAAATGCCCATCGACCTCGTCATTGATGAAAGAGACGGCAGCTCCAAGT 592
|||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||.||||||||||
Sbjct 519 CCGGTACATTAGCTGTTTGAAGGGAAAAATGCCCATTGACCTCGTGATTGATGAGAGAGATGGAAGCTCCAAGT 592
Query 593 CAGATCATGAAGAACTTTCAGGCTCCTCCACAAATCTCGCTGACCATAACCCTTCTTCTTGGCGAGACCACGAT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||
Sbjct 593 CAGATCATGAAGAACTTTCAGGCTCCTCCACAAATCTCGCCGACCACAACCCTTCATCCTGGCGAGACCACGAT 666
Query 667 GATGCAACCTCAACCCACTCAGCAGGCACCCCAGGGCCCTCCAGTGGGGGCCATGCTTCCCAGAGCGGAGACAA 740
||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 667 GACGCAACCTCAACGCACTCCGCAGGCACCCCAGGACCCTCCAGTGGGGGCCATGCTTCCCAGAGTGGAGACAA 740
Query 741 CAGCAGTGAGCAAGGGGATGGTTTAGACAACAGTGTAGCTTCACCTGGTACAGGTGACGATGATGATCCGGATA 814
|||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||.||.|
Sbjct 741 CAGCAGTGAGCAAGGCGATGGGTTAGACAACAGCGTAGCTTCACCTGGCACAGGTGATGACGACGATCCAGACA 814
Query 815 AGGACAAAAAACGCCAGAAGAAAAGAGGCATTTTCCCCAAAGTAGCAACAAATATCATGAGAGCATGGCTCTTC 888
|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 815 AGGACAAAAAACGCCAGAAGAAAAGAGGCATATTCCCCAAAGTCGCGACAAATATCATGAGAGCGTGGCTCTTC 888
Query 889 CAGCATCTCACACATCCGTACCCTTCCGAAGAGCAGAAGAAACAGTTAGCGCAAGACACAGGACTTACAATTCT 962
||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 889 CAGCATCTCACACACCCGTACCCTTCAGAAGAACAGAAGAAACAGTTAGCGCAAGACACGGGACTGACAATTCT 962
Query 963 CCAAGTAAACAACTGGTTTATTAATGCCAGAAGAAGAATAGTACAGCCCATGATTGACCAGTCAAATCGAG--- 1033
.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GCAAGTGAACAACTGGTTTATCAATGCCAGAAGAAGAATAGTGCAGCCCATGATTGACCAGTCAAATCGAGCAG 1036
Query 1034 ------------------CAGTGAGCCAAGGAGCAGCATATAGTCCAGAGGGTCAGCCCATGGGGAGCTTTGTG 1089
|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 GTTTTCTTCTTGATCCTTCAGTGAGCCAAGGAGCAGCGTATAGTCCAGAGGGTCAGCCCATGGGGAGCTTTGTG 1110
Query 1090 TTGGATGGTCAGCAACACATGGGGATCCGGCCTGCAGGTTTGCAGA-GCATGCCAGGGGACTACGTTTCTCAGG 1162
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || .|||| ||.|||
Sbjct 1111 TTGGATGGTCAGCAACACATGGGGATCCGGCCTGCAG-------GACCCATG--AGTGGA-------------- 1161
Query 1163 GTGGTCCTATGGGAATGAGTATGGCACA-------GCCAAGTTACACTCCTCCCCAGATGACCCCACACCCTAC 1229
|||||.||||.||||| .|| || |||..|||| |.|||
Sbjct 1162 --------ATGGGCATGAATATGG-GCATGGATGGGC--AGTGGCACT-------ATATG-------------- 1203
Query 1230 TCAATTAAGACATGGACCCCCAATGCATTCATATTTGCCAAGCCATCCCCACCACCCAGCCATGATGATGCACG 1303
Sbjct 1204 -------------------------------------------------------------------------- 1203
Query 1304 GAGGACCCCCTACCCACCCTGGAATGACTATGTCAGCACAGAGCCCCACAATGTTAAATTCTGTAGATCCCAAT 1377
Sbjct 1204 -------------------------------------------------------------------------- 1203
Query 1378 GTTGGCGGACAGGTTATGGACATTCATGCCCAA 1410
Sbjct 1204 --------------------------------- 1203